More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3207 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3207  aminotransferase, class IV  100 
 
 		 325 aa  668    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0255  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  41.29 
 
 		 313 aa  249  5e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2383  aminotransferase class IV  39.35 
 
 		 313 aa  233  3e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0329  aminotransferase, class IV  39.22 
 
 		 315 aa  229  4e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1756  aminotransferase class IV  39.07 
 
 		 316 aa  228  7e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.336644  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1107  aminotransferase class IV  36.25 
 
 		 314 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.0333795 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2275  aminotransferase class IV  36.77 
 
 		 320 aa  189  7e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.337005  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  34.62 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  34.32 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  32.6 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  34.93 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  33.07 
 
 		 299 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  31.36 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  31.71 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  32.65 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  31.71 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  33.7 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  33.46 
 
 		 298 aa  143  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  33.59 
 
 		 299 aa  143  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  31.01 
 
 		 299 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  31.01 
 
 		 299 aa  143  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  31.01 
 
 		 299 aa  143  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  31.01 
 
 		 299 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  31.01 
 
 		 299 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  31.01 
 
 		 299 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  31.01 
 
 		 299 aa  142  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  31.01 
 
 		 299 aa  142  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  33.07 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  33.07 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  33.07 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  33.07 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  33.07 
 
 		 298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  33.07 
 
 		 298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  34.42 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  33.08 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  32.68 
 
 		 298 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  33.08 
 
 		 298 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  32.84 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  33.21 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  33.85 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  32.97 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  31.87 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  34.08 
 
 		 288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  32.6 
 
 		 287 aa  133  5e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  32.17 
 
 		 292 aa  132  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  30.4 
 
 		 293 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  31.37 
 
 		 288 aa  132  9e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  32.95 
 
 		 288 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  30.55 
 
 		 292 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  31.95 
 
 		 293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  32.31 
 
 		 289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  31.65 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  32.2 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  31.5 
 
 		 287 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  31.15 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  30.91 
 
 		 286 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  29.06 
 
 		 286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  29.01 
 
 		 303 aa  113  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  29.66 
 
 		 282 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  33.33 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  32.84 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  27.24 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  30.47 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  30.48 
 
 		 285 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  29.07 
 
 		 295 aa  99.4  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  27.66 
 
 		 287 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43558  predicted protein  29.03 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0165019 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  27.66 
 
 		 293 aa  98.2  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  29.75 
 
 		 319 aa  97.1  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2045  aminotransferase class IV  28.03 
 
 		 279 aa  95.9  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754197  hitchhiker  0.00531754 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0712  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  27.01 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.157131  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  28.9 
 
 		 285 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  26.87 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  31.13 
 
 		 287 aa  92.8  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  25.17 
 
 		 307 aa  91.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  28.73 
 
 		 287 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  27.96 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  25.96 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  27.13 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3631  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  26.99 
 
 		 308 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  29.79 
 
 		 288 aa  90.9  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  28.08 
 
 		 282 aa  90.9  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0716  branched-chain amino acid aminotransferase  27.3 
 
 		 303 aa  90.5  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.470563  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  27.17 
 
 		 307 aa  90.5  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  24.66 
 
 		 285 aa  90.1  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  27.3 
 
 		 303 aa  89.7  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6235  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  30.14 
 
 		 308 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.513933 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  29.53 
 
 		 286 aa  89  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  26.76 
 
 		 309 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  25.82 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1779  branched-chain amino acid aminotransferase  27.44 
 
 		 303 aa  88.2  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.059153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4443  branched-chain amino acid aminotransferase  29.62 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  26.12 
 
 		 286 aa  87.4  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  26.67 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  26.79 
 
 		 281 aa  87.4  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  24.14 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2879  D-amino acid aminotransferase  29.78 
 
 		 285 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0317  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  26.81 
 
 		 300 aa  87  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5604  D-amino acid aminotransferase  26.15 
 
 		 306 aa  87  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000400845  unclonable  1.75706e-25 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0499  aminotransferase class IV  28.14 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>