More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2946 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2946  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  100 
 
 
135 aa  284  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.750797  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1796  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  66.67 
 
 
135 aa  203  7e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.461798  normal  0.880254 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2790  molybdopterin oxidoreductase  55.91 
 
 
668 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2799  molybdopterin oxidoreductase  55.91 
 
 
668 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  57.04 
 
 
674 aa  160  7e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  57.04 
 
 
674 aa  159  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  55.97 
 
 
677 aa  159  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  56.3 
 
 
674 aa  156  9e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  56.72 
 
 
676 aa  155  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  56.72 
 
 
676 aa  154  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  49.63 
 
 
745 aa  153  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2705  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  54.07 
 
 
355 aa  153  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  55.97 
 
 
676 aa  152  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.94 
 
 
917 aa  152  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.33 
 
 
674 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.63 
 
 
893 aa  148  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.76 
 
 
893 aa  147  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  54.07 
 
 
688 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0472  formate dehydrogenase-like protein  51.13 
 
 
133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.59 
 
 
688 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.62 
 
 
900 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  54.07 
 
 
686 aa  145  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.49 
 
 
901 aa  144  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  50 
 
 
893 aa  144  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.87 
 
 
668 aa  144  5e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1856  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  51.49 
 
 
351 aa  143  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.11 
 
 
688 aa  142  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.59 
 
 
687 aa  142  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  52.59 
 
 
695 aa  142  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0785  NADH dehydrogenase I chain G  49.63 
 
 
353 aa  141  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.91 
 
 
904 aa  142  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  50 
 
 
905 aa  140  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.99 
 
 
900 aa  140  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.47 
 
 
879 aa  138  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  50 
 
 
688 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  47.1 
 
 
899 aa  138  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1831  NADH dehydrogenase I chain G  46.62 
 
 
363 aa  137  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0030  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  47.37 
 
 
359 aa  137  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00062453  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  51.13 
 
 
687 aa  136  8.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.62 
 
 
686 aa  136  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  50 
 
 
685 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.49 
 
 
886 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.25 
 
 
959 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1833  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.62 
 
 
687 aa  134  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00515495  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0845  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  49.24 
 
 
376 aa  134  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.51 
 
 
960 aa  133  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.51 
 
 
960 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.12 
 
 
979 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.76 
 
 
960 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.51 
 
 
898 aa  131  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0255  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.11 
 
 
952 aa  130  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971632  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.13 
 
 
689 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.97 
 
 
986 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0685  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.33 
 
 
718 aa  128  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.92 
 
 
1406 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.86 
 
 
983 aa  128  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3566  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.88 
 
 
886 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0757584 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  47.76 
 
 
689 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.91 
 
 
906 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4642  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.88 
 
 
886 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0800652  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1029  NADH dehydrogenase I chain G  45.86 
 
 
358 aa  127  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.27 
 
 
988 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4391  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.44 
 
 
886 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410335  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4523  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.44 
 
 
886 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.195662  normal  0.224956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4914  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.36 
 
 
950 aa  127  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.263268 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0180  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.7 
 
 
984 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0450  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.7 
 
 
984 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.858013  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3012  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  44.7 
 
 
984 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.7 
 
 
984 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.7 
 
 
984 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1622  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.7 
 
 
984 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.437101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2964  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.7 
 
 
984 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2902  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.7 
 
 
984 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679741  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2797  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.24 
 
 
961 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.36 
 
 
947 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2032  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 subunit  45.86 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.11 
 
 
983 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0201  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 subunit  46.76 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.89 
 
 
945 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.86 
 
 
982 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3470  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.24 
 
 
963 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.873157  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1861  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.86 
 
 
978 aa  124  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  45.11 
 
 
982 aa  124  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3660  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.45 
 
 
888 aa  125  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.76 
 
 
724 aa  124  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3019  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.37 
 
 
957 aa  124  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0552  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.36 
 
 
983 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.36 
 
 
983 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.36 
 
 
983 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0805  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.52 
 
 
948 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624345  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.36 
 
 
983 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2383  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.62 
 
 
959 aa  123  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0324  formate dehydrogenase alpha subunit  45 
 
 
713 aa  123  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4072  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.22 
 
 
957 aa  122  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2376  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.18 
 
 
984 aa  122  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2333  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.18 
 
 
984 aa  122  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1238  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.11 
 
 
721 aa  122  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.768724  normal  0.0266527 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0724  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.78 
 
 
948 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696908  normal  0.792249 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4869  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.86 
 
 
950 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0187329 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3710  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  45.11 
 
 
977 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.749683  normal  0.699855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>