More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2569 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 260 aa  532  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  41.04 
 
 		 831 aa  125  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3872  Sel1 domain-containing protein  32.11 
 
 		 258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000147421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0663  Sel1 domain-containing protein  29.8 
 
 		 259 aa  119  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000538554  hitchhiker  0.000142702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  40.72 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  43.09 
 
 		 789 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3508  Sel1 domain-containing protein  29.6 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00034309  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  38.78 
 
 		 305 aa  113  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  45 
 
 		 684 aa  113  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3746  Sel1 domain-containing protein  30.2 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16618  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3003  hypothetical protein  31.73 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000180512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3872  Sel1 domain-containing protein  30.2 
 
 		 259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0228743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3689  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.2 
 
 		 259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.292341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3189  Sel1-like protein  30.8 
 
 		 265 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270269  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0579  Sel1 domain-containing protein  30.2 
 
 		 259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171088  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  43.65 
 
 		 2413 aa  112  5e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3411  Sel1 domain-containing protein  29.91 
 
 		 259 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.001433  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  43.9 
 
 		 961 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  38.75 
 
 		 1493 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0625  hypothetical protein  29.39 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  39.86 
 
 		 1037 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0619  Sel1 domain-containing protein  29.91 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0168047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.65 
 
 		 318 aa  109  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  50 
 
 		 489 aa  109  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  38.71 
 
 		 1402 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0618  Sel1 domain-containing protein  29.49 
 
 		 259 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000151187  normal  0.335089 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  37.16 
 
 		 232 aa  108  9.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  43.2 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  45.03 
 
 		 557 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  40.12 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  43.41 
 
 		 731 aa  106  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  41.45 
 
 		 185 aa  106  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  37.82 
 
 		 264 aa  106  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  43.8 
 
 		 416 aa  105  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  35.16 
 
 		 490 aa  105  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  38.62 
 
 		 380 aa  105  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  43.18 
 
 		 254 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0653  hypothetical protein  28.98 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  42.96 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  43.06 
 
 		 329 aa  103  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3291  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.107014  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  34.3 
 
 		 425 aa  103  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  37.82 
 
 		 393 aa  102  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.01 
 
 		 528 aa  102  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  37.89 
 
 		 1877 aa  102  8e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  34.62 
 
 		 490 aa  102  9e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  40.54 
 
 		 208 aa  101  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  42.74 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.62 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  44.27 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  44.62 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  39.22 
 
 		 1002 aa  99.8  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.38 
 
 		 380 aa  99.4  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0586  TPR repeat-containing protein  29.96 
 
 		 259 aa  99.4  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0440919  normal  0.522989 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  37.95 
 
 		 448 aa  99.8  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  38.64 
 
 		 373 aa  99  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  38.13 
 
 		 271 aa  99.4  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  44.19 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  30.49 
 
 		 344 aa  98.2  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  38.13 
 
 		 376 aa  97.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.71 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  45.22 
 
 		 172 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  36.6 
 
 		 193 aa  97.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  42.75 
 
 		 327 aa  96.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  38.13 
 
 		 376 aa  95.9  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  44.83 
 
 		 331 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  44.64 
 
 		 252 aa  95.5  7e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  37.12 
 
 		 373 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  37.41 
 
 		 838 aa  95.1  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  40.98 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  31.87 
 
 		 523 aa  94.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4119  Sel1 domain-containing protein  42.37 
 
 		 175 aa  94.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  37.97 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  34.9 
 
 		 293 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  44.64 
 
 		 117 aa  93.6  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  38.36 
 
 		 303 aa  93.6  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  42.86 
 
 		 235 aa  93.2  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.88 
 
 		 341 aa  92.4  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  36.73 
 
 		 342 aa  92  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1107  Sel1 domain-containing protein  40.34 
 
 		 234 aa  92  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.747543 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  42.06 
 
 		 552 aa  92  9e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.03 
 
 		 278 aa  91.3  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4151  Sel1 domain-containing protein  42.02 
 
 		 365 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216978  normal  0.586602 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40 
 
 		 346 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  39.84 
 
 		 685 aa  90.1  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  38.41 
 
 		 241 aa  89.4  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.1 
 
 		 343 aa  87.8  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.5 
 
 		 392 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  37.14 
 
 		 438 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  39.1 
 
 		 399 aa  87.4  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  35.71 
 
 		 1200 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  35.71 
 
 		 1200 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.44 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  39.67 
 
 		 482 aa  87.4  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  38.1 
 
 		 1141 aa  87  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  44.44 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 1032 aa  87.8  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  39.01 
 
 		 358 aa  87  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  41.46 
 
 		 763 aa  87  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 976 aa  86.7  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>