66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1444 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1444  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  100 
 
 		 114 aa  234  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  34.71 
 
 		 593 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0887  hypothetical protein  39.42 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.590211  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  34.21 
 
 		 588 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0946  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  37.38 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  37.36 
 
 		 596 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  37.07 
 
 		 591 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  32.77 
 
 		 597 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  32.77 
 
 		 596 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  32.77 
 
 		 596 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  32.77 
 
 		 596 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  38.89 
 
 		 589 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3617  hypothetical protein  44.19 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  32.74 
 
 		 596 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0297  flavocytochrome c  30.28 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000730502 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  36.67 
 
 		 598 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3683  hypothetical protein  43.02 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1781  hypothetical protein  35.24 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.531778  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1860  hypothetical protein  35.24 
 
 		 221 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  32.61 
 
 		 589 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  32.77 
 
 		 596 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  32.77 
 
 		 596 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2279  tetraheme cytochrome c  43.53 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0855381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  32.77 
 
 		 596 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  32.77 
 
 		 596 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  32.77 
 
 		 596 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3056  tetraheme cytochrome c  35.09 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  34.44 
 
 		 598 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  32.74 
 
 		 596 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  36.67 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  33.05 
 
 		 596 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1491  tetraheme cytochrome c  37.39 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2097  hypothetical protein  35 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1004  hypothetical protein  37.21 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.43 
 
 		 589 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0509  tetraheme cytochrome c  35.11 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  30.09 
 
 		 596 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1158  hypothetical protein  42.24 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3693  hypothetical protein  31.93 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.799168  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3769  hypothetical protein  34.83 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2402  tetraheme cytochrome c, putative  39.19 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04960  hypothetical protein  31.3 
 
 		 240 aa  53.1  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3370  tetraheme cytochrome c  35.83 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0137  fumarate reductase flavoprotein subunit  34.91 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100425  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2510  tetraheme cytochrome c  32.2 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  31.07 
 
 		 583 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2430  tetraheme cytochrome c  33.33 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.439789  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2786  hypothetical protein  33.04 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0942  hypothetical protein  34.69 
 
 		 172 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0342  tetraheme cytochrome c  37.21 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3388  hypothetical protein  34.29 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2585  hypothetical protein  37.1 
 
 		 232 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000203897  normal  0.20088 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0339  cytochrome c  27.19 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04270  hypothetical protein  29.81 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379993  normal  0.356103 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0274  tetraheme cytochrome c  32.11 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2528  hypothetical protein  35.48 
 
 		 216 aa  43.9  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1825  cytochrome c3  33.33 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.870052  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3300  cytochrome c  27.68 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1445  flavocytochrome c heme subunit  34.44 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2540  hypothetical protein  35.79 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2333  cytochrome c3  37 
 
 		 116 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.318001  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1504  cytochrome c3  35.05 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07630  hypothetical protein  25 
 
 		 229 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.48578 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2892  hypothetical protein  41.38 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4179  tetraheme cytochrome c  30.91 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.717177 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2229  tetraheme cytochrome c  29.73 
 
 		 117 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>