39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2892 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2892  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  254  3e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0627  hypothetical protein  53.78 
 
 
125 aa  118  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.593343 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04270  hypothetical protein  43.33 
 
 
182 aa  55.5  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379993  normal  0.356103 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1445  flavocytochrome c heme subunit  43.28 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0887  hypothetical protein  33.64 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.590211  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1491  tetraheme cytochrome c  46.77 
 
 
127 aa  47  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3623  tetraheme cytochrome c  33.62 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0946  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  32.52 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  26.55 
 
 
588 aa  45.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3693  hypothetical protein  28.45 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.799168  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0342  tetraheme cytochrome c  44.78 
 
 
126 aa  45.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0276  tetraheme cytochrome c  33.91 
 
 
117 aa  44.3  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  43.55 
 
 
596 aa  44.3  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07630  hypothetical protein  42.68 
 
 
229 aa  43.9  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.48578 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0137  fumarate reductase flavoprotein subunit  48.48 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100425  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1444  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  33.04 
 
 
114 aa  43.9  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3938  tetraheme cytochrome c  32.2 
 
 
117 aa  43.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3056  tetraheme cytochrome c  41.27 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  32.76 
 
 
596 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  32.76 
 
 
597 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  32.76 
 
 
596 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  32.76 
 
 
596 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  32.76 
 
 
596 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2097  hypothetical protein  43.28 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206741  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1860  hypothetical protein  44.78 
 
 
221 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  34.19 
 
 
596 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  34.19 
 
 
596 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  34.19 
 
 
596 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  34.19 
 
 
596 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1781  hypothetical protein  44.78 
 
 
221 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.531778  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4179  tetraheme cytochrome c  33.68 
 
 
120 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.717177 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2430  tetraheme cytochrome c  39.68 
 
 
135 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.439789  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2229  tetraheme cytochrome c  33.33 
 
 
117 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1830  flavocytochrome c heme subunit  43.75 
 
 
144 aa  42  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2152  tetraheme cytochrome c  33.33 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738839  normal  0.0741814 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3370  tetraheme cytochrome c  43.55 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1004  hypothetical protein  41.67 
 
 
165 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3388  hypothetical protein  37.88 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2279  tetraheme cytochrome c  41.94 
 
 
126 aa  40.4  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0855381  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>