66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1307 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1307  peptidase M28  100 
 
 		 299 aa  613  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0681394  normal  0.0392161 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  41.84 
 
 		 347 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  39.01 
 
 		 335 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  38.3 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3053  peptidase M28  38.38 
 
 		 325 aa  175  9e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.387481 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3011  peptidase M28  38.38 
 
 		 325 aa  175  9e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844179  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3438  peptidase M28  40.71 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.346638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1467  peptidase M28  37.84 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1386  peptidase M28  36 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492148  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2420  M28A family peptidase  36 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.564351  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3219  peptidase M28  37.32 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.115329  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2428  M28 family peptidase  36.79 
 
 		 273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1044  peptidase M28  38.89 
 
 		 306 aa  155  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  37.87 
 
 		 282 aa  149  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3437  peptidase M28  33.1 
 
 		 453 aa  145  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  35.27 
 
 		 339 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0187  peptidase M28  31.6 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  32.71 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0031  hypothetical protein  27.19 
 
 		 397 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0032  hypothetical protein  27.6 
 
 		 397 aa  62.8  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  26.35 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  28.44 
 
 		 677 aa  60.1  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  29 
 
 		 1103 aa  58.9  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  25.74 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  28.64 
 
 		 391 aa  53.9  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  26.22 
 
 		 455 aa  52.4  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  25.42 
 
 		 502 aa  52.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0019  hypothetical protein  27.88 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1748  peptidase M28  22 
 
 		 430 aa  49.7  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3374  hypothetical protein  25 
 
 		 476 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0508877  normal  0.0110235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  27.02 
 
 		 346 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  26.48 
 
 		 346 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4460  aminopeptidase  29.51 
 
 		 794 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000347887  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  26.84 
 
 		 342 aa  47.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  28.57 
 
 		 1247 aa  47  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  27.02 
 
 		 436 aa  47  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  26.83 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  25.47 
 
 		 504 aa  45.8  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  26.32 
 
 		 398 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  27.55 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4032  hypothetical protein  29.41 
 
 		 347 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  24.06 
 
 		 417 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  24.06 
 
 		 417 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  27.6 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  34.51 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  24.06 
 
 		 417 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  26.34 
 
 		 384 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  26.75 
 
 		 353 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  25.85 
 
 		 393 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  23.05 
 
 		 434 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  25.77 
 
 		 568 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0513  peptidase M28  27.73 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  24.06 
 
 		 417 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2745  amidase, hydantoinase/carbamoylase  32.43 
 
 		 417 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  27.17 
 
 		 944 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  25.7 
 
 		 501 aa  43.5  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  22.7 
 
 		 457 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1190  peptidase M28  24.45 
 
 		 629 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.909659  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  23.4 
 
 		 408 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  24.06 
 
 		 417 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  24.06 
 
 		 417 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  36.07 
 
 		 678 aa  43.1  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  25.93 
 
 		 386 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  32.06 
 
 		 555 aa  42.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  23.71 
 
 		 407 aa  42.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16010  predicted aminopeptidase  43.33 
 
 		 335 aa  42.4  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.964199  hitchhiker  0.000000285922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>