78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1028 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1028  hypothetical protein  100 
 
 		 529 aa  1080    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743991  normal  0.0101542 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1769  cytochrome c peroxidase family protein  33.67 
 
 		 422 aa  192  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2760  cytochrome c peroxidase family protein  30.9 
 
 		 451 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1210  methylamine utilization protein MauG, putative  29.68 
 
 		 453 aa  172  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000191755  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1538  methylamine utilization protein MauG, putative  31.05 
 
 		 419 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258234  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  28.6 
 
 		 361 aa  147  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1291  Di-heme cytochrome c peroxidase  30.64 
 
 		 487 aa  144  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5340600000000002e-32 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  29.57 
 
 		 390 aa  126  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  25.44 
 
 		 353 aa  107  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  26.89 
 
 		 378 aa  103  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2351  di-haem cytochrome c peroxidase  28.2 
 
 		 393 aa  89.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118544  normal  0.0769716 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0610  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  26.92 
 
 		 536 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673254  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0857  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  26.92 
 
 		 536 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1823  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  26.92 
 
 		 536 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1042  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  26.92 
 
 		 536 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.023459  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2342  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  26.71 
 
 		 540 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349952  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3802  hypothetical protein  25.94 
 
 		 454 aa  84.7  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1637  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  27.52 
 
 		 525 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0346  putative cytochrome c peroxidase  26.85 
 
 		 491 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3756  di-haem cytochrome c peroxidase  24.95 
 
 		 480 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5017  Di-haem cytochrome c peroxidase  25.74 
 
 		 480 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130881  normal  0.0650022 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5305  Di-heme cytochrome c peroxidase  25.43 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16606  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4344  di-haem cytochrome c peroxidase  25.21 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4022  di-haem cytochrome c peroxidase  25.21 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6009  di-haem cytochrome c peroxidase  25 
 
 		 473 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4228  di-haem cytochrome c peroxidase  25.16 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3754  di-haem cytochrome c peroxidase  24.73 
 
 		 472 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1889  Di-haem cytochrome c peroxidase  24.06 
 
 		 468 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0196458  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4736  di-haem cytochrome c peroxidase  24.57 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0936086  normal  0.189061 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0550  di-haem cytochrome c peroxidase  24.69 
 
 		 456 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1948  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  24.69 
 
 		 474 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0165417  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1675  di-haem cytochrome c peroxidase  24.79 
 
 		 473 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1092  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  25.06 
 
 		 543 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3582  Di-heme cytochrome c peroxidase  24.81 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0770126  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3364  di-haem cytochrome c peroxidase  23.68 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  26.63 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4152  di-haem cytochrome c peroxidase  23.68 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333964  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4214  di-haem cytochrome c peroxidase  23.68 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4808  putative di-heme cytochrome c peroxidase  27.33 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1560  Di-heme cytochrome c peroxidase  22.92 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.27225 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2353  Di-heme cytochrome c peroxidase  24.68 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332837  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2493  signal peptide protein  24.04 
 
 		 449 aa  62  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2756  putative signal peptide protein  25.13 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.852122  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1696  Di-heme cytochrome c peroxidase  22.99 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1279  di-haem cytochrome c peroxidase  25.16 
 
 		 469 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1878  di-haem cytochrome c peroxidase  23.17 
 
 		 465 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1649  di-haem cytochrome c peroxidase  22.08 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0694  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  22.08 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1805  di-haem cytochrome c peroxidase  22.08 
 
 		 467 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1628  di-haem cytochrome c peroxidase  22.27 
 
 		 468 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171293  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0465  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  22.08 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00419693  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1412  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  22.08 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.779688  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4273  di-haem cytochrome c peroxidase  24.79 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2833  Di-haem cytochrome c peroxidase  23.65 
 
 		 460 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85653  decreased coverage  0.00293873 
 
 
-
 
NC_003296  RS01731  lipoprotein  22.52 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0887  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  22.2 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1913  di-haem cytochrome c peroxidase  24.11 
 
 		 461 aa  57  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.452525 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1402  di-haem cytochrome c peroxidase  24.09 
 
 		 449 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05063  lipoprotein transmembrane  24.63 
 
 		 441 aa  56.2  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  0.0603302 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4316  Di-heme cytochrome c peroxidase  24.47 
 
 		 463 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65624 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0920  di-haem cytochrome c peroxidase  24.09 
 
 		 449 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4206  Di-haem cytochrome c peroxidase  24.47 
 
 		 463 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1380  di-haem cytochrome c peroxidase  24.37 
 
 		 449 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0723  Di-heme cytochrome c peroxidase  23.96 
 
 		 451 aa  54.7  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0259217  normal  0.788287 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4041  di-haem cytochrome c peroxidase  23.06 
 
 		 448 aa  54.3  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4434  di-haem cytochrome c peroxidase  23.4 
 
 		 458 aa  54.3  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4546  di-haem cytochrome c peroxidase  23.57 
 
 		 461 aa  54.3  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5888  Di-haem cytochrome c peroxidase  25.99 
 
 		 429 aa  53.9  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1313  di-haem cytochrome c peroxidase  23.42 
 
 		 435 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0706759 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4631  di-haem cytochrome c peroxidase  22.11 
 
 		 428 aa  51.6  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3560  di-haem cytochrome c peroxidase  22.17 
 
 		 448 aa  50.4  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  25 
 
 		 594 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1302  putative di-haem cytochrome c peroxidase  22.41 
 
 		 461 aa  49.3  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  20.8 
 
 		 336 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  23.01 
 
 		 613 aa  47.4  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2670  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  22.97 
 
 		 462 aa  47  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  24.85 
 
 		 626 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1613  di-haem cytochrome c peroxidase  20.92 
 
 		 424 aa  47  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>