37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3642 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  100 
 
 		 743 aa  1532    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0410  peptidase domain-containing protein  42.82 
 
 		 772 aa  630  1e-179  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0975443  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  28.33 
 
 		 1107 aa  88.6  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3692  putative lipoprotein  32.86 
 
 		 589 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2021  hypothetical protein  28.26 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000885135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3452  hypothetical protein  30 
 
 		 282 aa  59.3  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0272  hypothetical protein  25 
 
 		 783 aa  58.9  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.654602  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2707  putative lipoprotein  25.32 
 
 		 504 aa  54.3  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2157  hypothetical protein  26.85 
 
 		 268 aa  54.3  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  33 
 
 		 304 aa  52.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00818  hypothetical protein  26.97 
 
 		 150 aa  51.6  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0427  peptidase domain-containing protein  34.95 
 
 		 553 aa  51.2  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  41.33 
 
 		 286 aa  51.2  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1173  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 629 aa  50.8  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4576  hypothetical protein  24.02 
 
 		 956 aa  49.7  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000693966 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0555  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  27.32 
 
 		 1426 aa  49.7  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2600  PGAP1 family protein  50 
 
 		 589 aa  49.7  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000186594  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0106  hypothetical protein  27.34 
 
 		 596 aa  49.3  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.35 
 
 		 629 aa  48.9  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1333  hypothetical protein  35.48 
 
 		 302 aa  48.1  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  30.09 
 
 		 197 aa  47.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3338  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.37 
 
 		 629 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45579  predicted protein  40.32 
 
 		 366 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.63 
 
 		 629 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2724  hypothetical protein  26 
 
 		 599 aa  46.6  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0271436  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  42.86 
 
 		 282 aa  46.2  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  34.88 
 
 		 361 aa  45.8  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  43.48 
 
 		 294 aa  45.4  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00499  acid phosphatase  24.08 
 
 		 773 aa  45.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  32 
 
 		 309 aa  45.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  33.33 
 
 		 285 aa  45.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2983  PGAP1 family protein  36.36 
 
 		 437 aa  44.7  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2651  PKD domain-containing protein  25.84 
 
 		 611 aa  44.7  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0949  PGAP1 family protein  34.25 
 
 		 414 aa  44.3  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000633482  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2398  hypothetical protein  24.4 
 
 		 325 aa  44.3  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.675927  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  36.11 
 
 		 334 aa  44.3  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  53.7 
 
 		 357 aa  44.3  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0106157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>