163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4161 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4098  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  98.92 
 
 		 369 aa  745    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3993  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  98.92 
 
 		 369 aa  744    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4161  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  100 
 
 		 369 aa  751    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  0.579159 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3272  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  86.72 
 
 		 369 aa  635    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3975  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  98.92 
 
 		 369 aa  745    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4047  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  98.37 
 
 		 369 aa  740    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0548491 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4739  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  45.33 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4579  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase; selenocysteine synthase  45.33 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5099  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  45.33 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4987  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  45.94 
 
 		 367 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4959  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  45.33 
 
 		 367 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4598  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase; selenocysteine synthase  45.33 
 
 		 367 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5002  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  45.05 
 
 		 367 aa  309  5e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4974  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  44.51 
 
 		 367 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4688  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  43.96 
 
 		 367 aa  305  6e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0261  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  44.23 
 
 		 367 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.262008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0918  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  42.15 
 
 		 372 aa  295  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0430  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  42.7 
 
 		 372 aa  292  5e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3866  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  44.54 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.559786  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4847  hypothetical protein  41.48 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.601246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4728  hypothetical protein  41.48 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0676  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  44.54 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4792  hypothetical protein  41.48 
 
 		 372 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4826  hypothetical protein  41.21 
 
 		 372 aa  285  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4697  hypothetical protein  40.93 
 
 		 372 aa  285  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.547246 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4375  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  41.76 
 
 		 372 aa  283  5.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.417275 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3153  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  41.21 
 
 		 373 aa  281  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0105  hypothetical protein  41.21 
 
 		 348 aa  267  2.9999999999999995e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2990  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  38.8 
 
 		 398 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.625674  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5759  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  38.52 
 
 		 398 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.646746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6666  L-seryl-tRNA selenium transferase  39.29 
 
 		 398 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184749  normal  0.0169225 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2704  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  38.96 
 
 		 402 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5094  L-seryl-tRNA(ser) selenium transferase  40.44 
 
 		 398 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0940  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  34.77 
 
 		 400 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0099  L-seryl-tRNA selenium transferase  31.02 
 
 		 406 aa  159  6e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.789274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1144  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  31.09 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.46182  normal  0.521262 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2440  selenocysteine synthase (seryl-tRNASer selenium transferase)-like protein  27.01 
 
 		 406 aa  145  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0244624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6463  selenocysteine synthase (seryl-tRNASer selenium transferase)-like protein  25.53 
 
 		 414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0175  Pyridoxal phosphate-dependent transferase  30.99 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1021  Pyridoxal phosphate-dependent transferase  28.64 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3964  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  26.96 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.741974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3968  L-seryl-tRNA(ser) selenium transferase protein  25.81 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.456181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0481  selenocysteine synthase (seryl-tRNASer selenium transferase)-like protein  27.73 
 
 		 511 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2085  selenocysteine synthase  25.12 
 
 		 462 aa  93.6  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2373  selenocysteine synthase  24.88 
 
 		 462 aa  93.2  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4162  selenocysteine synthase  25.94 
 
 		 462 aa  90.5  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4157  selenocysteine synthase  28.25 
 
 		 478 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.109282 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0488  L-seryl-tRNA selenium transferase  29.06 
 
 		 451 aa  88.6  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.117557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2186  selenocysteine synthase  23.25 
 
 		 475 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000130274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3879  selenocysteine synthase  26.22 
 
 		 468 aa  86.7  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.797755 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0819  selenocysteine synthase  27.16 
 
 		 461 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3796  selenocysteine synthase  26 
 
 		 468 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.245945  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3060  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  27.04 
 
 		 491 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000814567  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0482  selenocysteine synthase  29.27 
 
 		 489 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.112411  hitchhiker  0.001297 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2561  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  27.74 
 
 		 470 aa  83.2  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1814  selenocysteine synthase  26.81 
 
 		 465 aa  79.7  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.071718 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3477  L-seryl-tRNA selenium transferase  27.47 
 
 		 473 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.213454  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0672  selenocysteine synthase  24.37 
 
 		 462 aa  79  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1311  selenocysteine synthase  30.77 
 
 		 506 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000207864 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0061  selenocysteine synthase  25.75 
 
 		 462 aa  77  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3059  selenocysteine synthase  28.1 
 
 		 483 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00615002  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2867  selenocysteine synthase  25.93 
 
 		 465 aa  75.1  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0090  selenocysteine synthase  27.97 
 
 		 463 aa  74.7  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0873  selenocysteine synthase  27.72 
 
 		 468 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1646  selenocysteine synthase  25 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000318162  unclonable  0.000000000338513 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3766  selenocysteine synthase  26.46 
 
 		 462 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0042  selenocysteine synthase  26.46 
 
 		 462 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4522  selenocysteine synthase  27.86 
 
 		 478 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6556  selenocysteine synthase  25.62 
 
 		 476 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0759041  decreased coverage  0.00101657 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4115  selenocysteine synthase  26.46 
 
 		 462 aa  73.6  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1740  selenocysteine synthase  27.92 
 
 		 475 aa  73.2  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.820555  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1093  selenocysteine synthase  23.94 
 
 		 473 aa  72  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2477  selenocysteine synthase  26 
 
 		 448 aa  71.6  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0658  selenocysteine synthase  25.89 
 
 		 485 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0487708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3486  selenocysteine synthase  27.9 
 
 		 484 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0801308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1162  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  24.04 
 
 		 476 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103584 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0101  selenocysteine synthase  29.39 
 
 		 473 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0441  selenocysteine synthase  24.37 
 
 		 491 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0440  selenocysteine synthase  24.62 
 
 		 491 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3369  selenocysteine synthase  24.88 
 
 		 462 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2549  selenocysteine synthase  26.33 
 
 		 476 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0106  selenocysteine synthase  29.15 
 
 		 476 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0106  selenocysteine synthase  28.95 
 
 		 476 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2208  L-seryl-tRNA selenium transferase  25.82 
 
 		 519 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.223965 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0301  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  26.48 
 
 		 466 aa  67.4  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2504  selenocysteine synthase  25.26 
 
 		 470 aa  67  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0196405  normal  0.0690834 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4267  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  23.4 
 
 		 476 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000207221  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1546  selenocysteine synthase  26.49 
 
 		 442 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0548  selenocysteine synthase  24.91 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.147839 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3265  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  25.56 
 
 		 474 aa  65.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.322866  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0105  selenocysteine synthase  26.56 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3381  selenocysteine synthase  26.87 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0104  selenocysteine synthase  27.63 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0109  selenocysteine synthase  27.63 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3919  selenocysteine synthase  27.92 
 
 		 463 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.419812 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3883  selenocysteine synthase  26.87 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0108  selenocysteine synthase  28.07 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1678.1  selenocysteine synthase  25.78 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0726  selenocysteine synthase  25.78 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2255  selenocysteine synthase  25.78 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>