77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1407 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1142  phage portal protein, lambda family  98.45 
 
 		 515 aa  1039    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.57853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1407  phage portal protein, lambda family  100 
 
 		 515 aa  1050    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  hitchhiker  0.000144883 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1070  phage portal protein lambda family  99.61 
 
 		 515 aa  1045    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.815422  hitchhiker  0.0000926741 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0694  phage portal protein, lambda family  73.08 
 
 		 511 aa  778    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000299773 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3203  phage portal protein, lambda family  64.02 
 
 		 500 aa  630  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254824 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1863  phage portal protein, lambda family  64.02 
 
 		 500 aa  630  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  62.79 
 
 		 1156 aa  558  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1677  phage portal protein, lambda family protein  50.3 
 
 		 519 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3250  phage portal protein, lambda  48.82 
 
 		 524 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3599  lambda family phage portal protein  47.32 
 
 		 524 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0755  lambda family phage portal protein  46.63 
 
 		 524 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0786  lambda family phage portal protein  46.63 
 
 		 524 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0469703 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0782  phage portal protein, lambda family  46.44 
 
 		 524 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.339104 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2254  lambda family phage portal protein  40.37 
 
 		 529 aa  363  4e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.347018  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3174  phage portal protein, lambda  26.38 
 
 		 536 aa  131  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0857  bacteriophage-like protein  27.9 
 
 		 508 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5773  phage portal protein, lambda family  26.58 
 
 		 530 aa  121  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2660  prophage LambdaMc01, lambda family portal protein  28.74 
 
 		 502 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3783  bacteriophage-related protein lambda family phage portal protein  26.51 
 
 		 496 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401598  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3359  lambda family phage portal protein  26.51 
 
 		 496 aa  120  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4921  lambda family phage portal protein  25.32 
 
 		 524 aa  120  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.149822 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3207  phage portal protein, lambda family  27.98 
 
 		 499 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2897  lambda family phage portal protein  27.61 
 
 		 494 aa  117  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0733  Phage portal protein, lambda  26.71 
 
 		 487 aa  117  6.9999999999999995e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.660834 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1260  lambda family phage portal protein  27.61 
 
 		 494 aa  116  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2048  lambda family phage portal protein  26.34 
 
 		 494 aa  113  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2822  lambda family phage portal protein  26.18 
 
 		 472 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6669  phage portal protein, lambda family  25.32 
 
 		 511 aa  111  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3860  phage portal protein, lambda family  25.76 
 
 		 537 aa  110  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0281  phage portal protein, lambda family  24.32 
 
 		 539 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.592205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2818  lambda family phage portal protein  25.93 
 
 		 494 aa  104  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1197  lambda family phage portal protein  27.19 
 
 		 488 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224747 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2746  lambda family phage portal protein  25.93 
 
 		 494 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2576  lambda family phage portal protein  25.93 
 
 		 494 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1325  lambda family phage portal protein  25.93 
 
 		 494 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1204  lambda family phage portal protein  25.98 
 
 		 531 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1875  lambda family phage portal protein  27.02 
 
 		 495 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1151  phage-related portal protein  24.08 
 
 		 528 aa  101  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0412  phage-related portal protein  24.08 
 
 		 528 aa  101  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6598  lambda family phage portal protein  25.49 
 
 		 512 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0808  Phage portal protein, lambda  26.56 
 
 		 511 aa  99.4  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.343711  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1171  lambda family phage portal protein  23.85 
 
 		 528 aa  98.6  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1658  lambda family phage portal protein  28.47 
 
 		 574 aa  96.7  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805551  normal  0.257873 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0136  lambda family phage portal protein  27.3 
 
 		 443 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1172  phage portal protein, lambda family  25.83 
 
 		 489 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3044  lambda family phage portal protein  25.44 
 
 		 497 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426475  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0596  phage portal protein, lambda family  26.3 
 
 		 532 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3410  portal protein  27.31 
 
 		 493 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.797214  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2191  lambda family phage portal protein  25.7 
 
 		 497 aa  89.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000483953 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1300  phage portal protein, lambda  22.87 
 
 		 537 aa  85.9  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.616273 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2308  lambda family phage portal protein  24.31 
 
 		 510 aa  84.7  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0803517  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0649  hypothetical protein  34.81 
 
 		 171 aa  84.3  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1686  bacteriophage capsid protein-like protein  34.81 
 
 		 171 aa  84  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1505  lambda family phage portal protein  25.54 
 
 		 516 aa  83.2  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1887  lambda family phage portal protein  26.23 
 
 		 556 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167275 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2092  lambda family phage portal protein  24.81 
 
 		 524 aa  80.1  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.778496  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0679  Phage portal protein, lambda  23.36 
 
 		 482 aa  76.3  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.468195  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4684  lambda family phage portal protein  23.53 
 
 		 500 aa  67.4  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3432  lambda family phage portal protein  22.92 
 
 		 588 aa  67  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3064  putative phage portal protein Gp17  22.98 
 
 		 551 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0202724  hitchhiker  0.000118688 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1062  lambda family phage portal protein  20.55 
 
 		 517 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.544007 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1784  lambda family phage portal protein  21.48 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2462  phage portal protein, lambda family  22.35 
 
 		 536 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4145  lambda family phage portal protein  21.85 
 
 		 534 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0120  phage portal protein, lambda  28.4 
 
 		 281 aa  53.5  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0615825  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2128  Bacteriophage capsid protein-like protein  23.23 
 
 		 494 aa  52  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2391  phage portal protein, lambda  21.29 
 
 		 538 aa  50.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0370  putative phage related protein  23.73 
 
 		 210 aa  50.1  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1785  phage portal protein, lambda family  25.56 
 
 		 533 aa  47  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0988466 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1622  phage portal protein, lambda family  25.56 
 
 		 533 aa  47  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0251357 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10038  capsid component  25.56 
 
 		 533 aa  47  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2093  lambda family phage portal protein  25.56 
 
 		 533 aa  47  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0127798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00733  hypothetical protein  25.56 
 
 		 533 aa  47  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2312  Bacteriophage capsid protein  21.86 
 
 		 545 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2813  phage portal protein lambda family  23.81 
 
 		 526 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.579589 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2775  phage portal protein, lambda family  21.35 
 
 		 530 aa  43.5  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1188  phage portal protein, lambda family  21.35 
 
 		 530 aa  43.5  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>