More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3511 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  100 
 
 		 198 aa  410  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  61.22 
 
 		 200 aa  257  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.71 
 
 		 200 aa  257  8e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.71 
 
 		 200 aa  257  8e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.63 
 
 		 198 aa  255  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  59.39 
 
 		 203 aa  254  5e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  59.9 
 
 		 204 aa  254  6e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  60.71 
 
 		 200 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  60.91 
 
 		 198 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  61.22 
 
 		 200 aa  252  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  59.69 
 
 		 200 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  59.69 
 
 		 200 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  60.91 
 
 		 204 aa  251  7e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.92 
 
 		 200 aa  249  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  59.69 
 
 		 208 aa  249  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.18 
 
 		 200 aa  248  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  57.87 
 
 		 199 aa  244  8e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.65 
 
 		 200 aa  239  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  56.85 
 
 		 208 aa  236  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  49.5 
 
 		 201 aa  210  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2641  Glutathione S-transferase domain  47.21 
 
 		 218 aa  209  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.213293 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  49.24 
 
 		 201 aa  207  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04799  glutathione S-transferase  46.19 
 
 		 209 aa  203  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2587  Glutathione S-transferase domain  51.83 
 
 		 195 aa  201  9e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1985  glutathione S-transferase  49.74 
 
 		 207 aa  200  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2312  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.31 
 
 		 195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  48.97 
 
 		 210 aa  198  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.5 
 
 		 204 aa  198  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  49.23 
 
 		 203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  49.23 
 
 		 203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  49.22 
 
 		 197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0017  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.21 
 
 		 192 aa  195  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2269  Glutathione S-transferase domain  50.26 
 
 		 195 aa  194  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  51.05 
 
 		 201 aa  194  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1311  glutathione S-transferase-like protein  48.19 
 
 		 196 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55458  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1171  Glutathione S-transferase domain protein  47.06 
 
 		 204 aa  192  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3587  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.67 
 
 		 203 aa  191  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0707812  hitchhiker  0.000377551 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.95 
 
 		 216 aa  184  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.89 
 
 		 203 aa  181  7e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  45 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1820  putative glutathione S-transferase  44.44 
 
 		 196 aa  178  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  45 
 
 		 216 aa  177  7e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3756  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.52 
 
 		 208 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  45.5 
 
 		 228 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  44.5 
 
 		 216 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  44.5 
 
 		 217 aa  171  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  44.5 
 
 		 217 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  44 
 
 		 228 aa  168  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3618  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.85 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5413  Glutathione S-transferase domain protein  40.21 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0134  Glutathione S-transferase domain protein  44.97 
 
 		 209 aa  151  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  37.06 
 
 		 206 aa  131  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.62 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  37.06 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  40.1 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  37.62 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  35.15 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  37.44 
 
 		 203 aa  125  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  35.64 
 
 		 208 aa  124  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.83 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  35.53 
 
 		 203 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  34.8 
 
 		 203 aa  121  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.31 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  34.31 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.5 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  35.68 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  34.17 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  37.62 
 
 		 198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.01 
 
 		 205 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  35.96 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  33.33 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.03 
 
 		 205 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.53 
 
 		 205 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  34 
 
 		 207 aa  114  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  31.68 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  32.84 
 
 		 217 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.5 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.5 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.5 
 
 		 214 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5568  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.01 
 
 		 205 aa  111  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  35.03 
 
 		 203 aa  111  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  33.33 
 
 		 214 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  33.33 
 
 		 214 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  33 
 
 		 266 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  31.5 
 
 		 214 aa  110  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.5 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  31.5 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.5 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.5 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  32.5 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  32.5 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  32.84 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  36.32 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.5 
 
 		 209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.5 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.67 
 
 		 203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  31 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  33 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  33.5 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3285  putative glutathione S-transferase  32.84 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.549218  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>