More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0848 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0848  histidine kinase internal region  100 
 
 		 326 aa  667    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0115  signal transduction histidine kinase, LytS  35.61 
 
 		 552 aa  123  5e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.368367  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  34.86 
 
 		 578 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0377  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  32.51 
 
 		 576 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  37.08 
 
 		 576 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2328  signal transduction histidine kinase, LytS  37.89 
 
 		 565 aa  116  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0659282  normal  0.34431 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  36.84 
 
 		 568 aa  116  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  42.62 
 
 		 360 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  33.15 
 
 		 557 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  33.15 
 
 		 557 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  33.15 
 
 		 557 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0489  histidine kinase internal region  37.25 
 
 		 372 aa  112  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  41.62 
 
 		 362 aa  112  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  33.15 
 
 		 557 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3044  signal transduction histidine kinase, LytS  35.95 
 
 		 438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  33.15 
 
 		 557 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  33.15 
 
 		 557 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  40.23 
 
 		 357 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  37.91 
 
 		 572 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  37.04 
 
 		 558 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2452  signal transduction histidine kinase, LytS  28.74 
 
 		 408 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00298598  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  34 
 
 		 557 aa  109  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  33.78 
 
 		 561 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  33.78 
 
 		 561 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  33.78 
 
 		 561 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  33.78 
 
 		 561 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1324  signal transduction histidine kinase, LytS  35.59 
 
 		 433 aa  109  8.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0634382  hitchhiker  0.00226936 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  38.06 
 
 		 361 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1005  signal transduction histidine kinase, LytS  37.78 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000807756  normal  0.310499 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3169  signal transduction histidine kinase, LytS  33.86 
 
 		 560 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3061  signal transduction histidine kinase, LytS  33.86 
 
 		 560 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3090  histidine kinase internal region  33.88 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  34.67 
 
 		 558 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  35.45 
 
 		 561 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  35.45 
 
 		 561 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  35.45 
 
 		 561 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01150  putative regulator of cell autolysis  33.94 
 
 		 440 aa  107  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  35.45 
 
 		 561 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  35.45 
 
 		 561 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  35.45 
 
 		 561 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  35.45 
 
 		 561 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0276  signal transduction histidine kinase, LytS  30.43 
 
 		 561 aa  106  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2094  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase internal region:5TM Receptors of the LytS-YhcK type, transmembrane region  30.57 
 
 		 577 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  35.45 
 
 		 561 aa  106  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  28.4 
 
 		 563 aa  106  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1441  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 559 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  35.45 
 
 		 561 aa  106  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  30.73 
 
 		 563 aa  105  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 561 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0037  histidine kinase internal region  33.65 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4588  signal transduction histidine kinase, LytS  31.86 
 
 		 561 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3680  histidine kinase internal region  32.06 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  35.93 
 
 		 432 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1282  signal transduction histidine kinase, LytS  32.88 
 
 		 569 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211527 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1319  membrane receptor, histidine kinase  33.66 
 
 		 560 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  33.71 
 
 		 563 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2724  signal transduction histidine kinase, LytS  33.85 
 
 		 562 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2024  sensor histidine kinase LytS  35.9 
 
 		 591 aa  104  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  29.81 
 
 		 428 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  37.43 
 
 		 556 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  34.62 
 
 		 403 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0764  histidine kinase internal region  34.8 
 
 		 582 aa  103  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.294756 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  36.09 
 
 		 556 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  32.37 
 
 		 645 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 374 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5383  sensor histidine kinase LytS  34.01 
 
 		 522 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.498572  normal  0.326696 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00390  putative regulator of cell autolysis  32.63 
 
 		 431 aa  102  6e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.848872  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5296  sensor histidine kinase LytS  37.18 
 
 		 589 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5123  sensor histidine kinase  37.18 
 
 		 589 aa  102  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5537  sensor histidine kinase LytS  37.18 
 
 		 589 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5138  sensor histidine kinase  37.18 
 
 		 589 aa  102  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5692  sensor histidine kinase LytS  37.18 
 
 		 589 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  35.43 
 
 		 374 aa  102  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  34.95 
 
 		 558 aa  102  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5566  sensor histidine kinase LytS  37.18 
 
 		 589 aa  102  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1674  signal transduction histidine kinase, LytS  34.42 
 
 		 565 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0178726  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  27.36 
 
 		 340 aa  102  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  37.18 
 
 		 589 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1696  signal transduction histidine kinase, LytS  34.42 
 
 		 565 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0311025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2684  signal transduction histidine kinase, LytS  34.42 
 
 		 565 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.287497  hitchhiker  0.00116896 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  31.36 
 
 		 565 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1084  histidine kinase internal region  29.13 
 
 		 575 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0370265  normal  0.975996 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0146  signal transduction histidine kinase, LytS  30.87 
 
 		 565 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889074  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2593  signal transduction histidine kinase, LytS  34.58 
 
 		 560 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0091271  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3342  signal transduction histidine kinase, LytS  36.46 
 
 		 556 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.891854 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1659  signal transduction histidine kinase, LytS  34.42 
 
 		 565 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000213246  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  31.98 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  30.39 
 
 		 572 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  33.33 
 
 		 568 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3669  sensory transduction protein kinase AlgZ  38.24 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00147493  normal  0.157843 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  32.97 
 
 		 581 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4305  signal transduction histidine kinase, LytS  30.22 
 
 		 654 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.119677  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2431  signal transduction histidine kinase, LytS  34.11 
 
 		 560 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000324417  normal  0.0100076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2501  signal transduction histidine kinase, LytS  34.11 
 
 		 560 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.443565  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5235  signal transduction histidine kinase, LytS  36.54 
 
 		 589 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5574  sensor histidine kinase LytS  36.54 
 
 		 589 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1017  sensor histidine kinase, putative  35.86 
 
 		 579 aa  100  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  30.39 
 
 		 572 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3959  signal transduction histidine kinase, LytS  37.82 
 
 		 591 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>