47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0310 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0310  DNA methylase N-4/N-6  100 
 
 		 599 aa  1244    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0639  DNA methylase N-4/N-6  32.24 
 
 		 852 aa  340  5e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0814  hypothetical protein  29.92 
 
 		 992 aa  270  5.9999999999999995e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0772637 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3558  hypothetical protein  30.22 
 
 		 920 aa  267  5e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1177  hypothetical protein  30.22 
 
 		 920 aa  267  5e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0642948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1119  hypothetical protein  29.23 
 
 		 1030 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327751 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1494  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.85 
 
 		 1068 aa  238  3e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0059  hypothetical protein  28.82 
 
 		 947 aa  231  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  29.13 
 
 		 540 aa  98.2  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  23.77 
 
 		 596 aa  94.4  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  32.47 
 
 		 731 aa  83.2  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  25.76 
 
 		 916 aa  80.5  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  30.56 
 
 		 1279 aa  73.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  30.07 
 
 		 967 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  32.35 
 
 		 1106 aa  72  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  30.34 
 
 		 996 aa  71.2  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  34.43 
 
 		 651 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  25 
 
 		 746 aa  68.6  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0950  hypothetical protein  35.48 
 
 		 501 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0387274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1184  adenine-specific DNA methylase  29.01 
 
 		 610 aa  65.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.34 
 
 		 739 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  25.14 
 
 		 703 aa  65.1  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  20.06 
 
 		 878 aa  63.9  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  25.62 
 
 		 982 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  26.16 
 
 		 892 aa  62  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  28.28 
 
 		 1118 aa  62  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  26.16 
 
 		 1045 aa  61.6  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0719  hypothetical protein  30.86 
 
 		 947 aa  61.2  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000148143 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  24.73 
 
 		 894 aa  60.8  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  27.34 
 
 		 1070 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  20.57 
 
 		 934 aa  60.1  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  20.63 
 
 		 936 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1071 aa  59.3  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  27.27 
 
 		 911 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  27.27 
 
 		 911 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1353  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  21.92 
 
 		 995 aa  55.1  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  26.15 
 
 		 737 aa  53.9  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1003 aa  53.5  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  22.28 
 
 		 747 aa  51.2  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  24.62 
 
 		 751 aa  50.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4967  protein of unknown function DUF1156  23.33 
 
 		 745 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241084 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4855  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.93 
 
 		 249 aa  47.4  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.862856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0982  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1001 aa  46.6  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3051  methyltransferase DNA modification enzyme  26.5 
 
 		 421 aa  46.2  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.85 
 
 		 383 aa  44.3  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  51.16 
 
 		 947 aa  43.9  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0013  DNA methylase containing a Zn-ribbon  23.15 
 
 		 979 aa  43.5  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>