122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0728 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0728  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
171 aa  353  5e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000860866  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1518  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  39.38 
 
 
160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000119119  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1932  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.57 
 
 
157 aa  112  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000184693  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0864  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.81 
 
 
155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1445  ferredoxin-type protein NapF  41.07 
 
 
159 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000171683  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0442  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.46 
 
 
179 aa  105  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1271  ferredoxin-type protein NapF  33.33 
 
 
167 aa  105  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.853171  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2793  ferredoxin-type protein NapF  33.33 
 
 
167 aa  105  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.167014 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1385  ferredoxin-type protein NapF  33.33 
 
 
167 aa  105  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.570523  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2368  ferredoxin-type protein NapF  41.1 
 
 
172 aa  103  9e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.957681  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2933  ferredoxin-type protein NapF  36.73 
 
 
162 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000053627  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2445  ferredoxin-type protein  38.73 
 
 
163 aa  101  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.399328 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2396  ferredoxin-type protein  38.73 
 
 
163 aa  101  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2604  ferredoxin-type protein  38.73 
 
 
163 aa  101  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  normal  0.656417 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0733  ferredoxin-type protein  35.19 
 
 
164 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2487  ferredoxin-type protein  38.03 
 
 
163 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1451  ferredoxin-type protein NapF  34.57 
 
 
164 aa  98.6  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1432  ferredoxin-type protein NapF  38.03 
 
 
158 aa  98.2  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.390259 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2507  ferredoxin-type protein  34.57 
 
 
164 aa  98.6  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3345  ferredoxin-type protein  34.57 
 
 
164 aa  98.6  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0931001  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2356  ferredoxin-type protein  34.57 
 
 
164 aa  97.8  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1712  ferredoxin-type protein NapF  37.16 
 
 
163 aa  97.4  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00359598  normal  0.496256 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2346  ferredoxin-type protein  33.95 
 
 
164 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1442  ferredoxin-type protein  33.95 
 
 
164 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02135  ferredoxin-type protein, predicted role in electron transfer to periplasmic nitrate reductase (NapA)  33.33 
 
 
164 aa  95.1  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1383  ferredoxin-type protein NapF  36.3 
 
 
168 aa  95.1  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1476  ferredoxin-type protein NapF  33.55 
 
 
160 aa  95.1  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000676016  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02094  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  95.1  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2598  ferredoxin-type protein NapF  36.3 
 
 
161 aa  94  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1157  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.91 
 
 
156 aa  92.8  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0986005  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1512  ferredoxin-type protein NapF  35.21 
 
 
160 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0688671  normal  0.812249 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2871  ferredoxin-type protein NapF  36.62 
 
 
160 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  hitchhiker  0.000000902156 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2610  ferredoxin-type protein NapF  35.9 
 
 
158 aa  92.4  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.326175  hitchhiker  0.000000545081 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2677  ferredoxin-type protein NapF  35.9 
 
 
158 aa  92.4  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131835  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1481  ferredoxin-type protein NapF  35.21 
 
 
160 aa  91.7  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000195514  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2784  ferredoxin-type protein NapF  36.73 
 
 
161 aa  91.7  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.9279  hitchhiker  0.000480705 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1326  ferredoxin-type protein NapF  35.66 
 
 
161 aa  90.1  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1663  ferredoxin-type protein NapF  34.57 
 
 
161 aa  89  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0615  iron-sulfur cluster-binding protein NapF  35.29 
 
 
168 aa  85.9  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2409  ferredoxin-type protein NapF  33.14 
 
 
178 aa  85.1  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1593  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  34.27 
 
 
187 aa  84.3  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2225  ferredoxin-type protein NapF  34.29 
 
 
165 aa  84  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000128219  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05379  ferredoxin-type protein  34.91 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49220  ferredoxin protein NapF  35.09 
 
 
163 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.36196  hitchhiker  0.00430686 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2176  ferredoxin-type protein NapF  34.81 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.455284  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000511  nitrate reductase  35.67 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1059  ferredoxin-type protein NapF  33.1 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1720  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.58 
 
 
154 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.774075  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4000  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  36.62 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.692634 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2713  ferredoxin-type protein NapF  32.54 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4203  ferredoxin protein NapF  33.92 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.197134  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3988  hypothetical protein  33.12 
 
 
160 aa  79  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0935811  normal  0.360541 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3488  ferredoxin-type protein NapF  32.9 
 
 
165 aa  79  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104519  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0116  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.77 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5178  ferredoxin-type protein NapF  38.76 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.818564  normal  0.868281 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3167  ferredoxin-type protein napF  31.37 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3224  hypothetical protein  30.23 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0610  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.13 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.260421  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2764  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.78 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.936882 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4011  ferredoxin-type protein NapF  33.55 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1287  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.87 
 
 
192 aa  64.3  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0358  iron-sulfur cluster-binding protein  33.08 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0378692  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02503  ferredoxin  29.88 
 
 
165 aa  62.4  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.87 
 
 
189 aa  62  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4114  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  26.71 
 
 
160 aa  61.6  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1340  putative ferredoxin-type protein NapF  28.87 
 
 
189 aa  61.6  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2720  putative ferredoxin-type protein NapF  28.87 
 
 
189 aa  61.6  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27410  4Fe-4S protein  27.61 
 
 
206 aa  55.8  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16850  4Fe-4S protein  30.18 
 
 
242 aa  55.8  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459268  normal  0.811902 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0622  quinol dehydrogenase periplasmic component  30.57 
 
 
244 aa  55.1  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3028  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.26 
 
 
221 aa  53.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0478  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.59 
 
 
213 aa  53.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0492  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.9 
 
 
213 aa  52.4  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.363621 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0439  quinol dehydrogenase periplasmic component  25.25 
 
 
264 aa  52.4  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000708697  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001237  ferredoxin-type protein NapG (periplasmic nitrate reductase)  30.07 
 
 
256 aa  51.2  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3958  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.99 
 
 
244 aa  50.8  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0389498 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1738  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.82 
 
 
204 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.850071  normal  0.0241918 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3207  quinol dehydrogenase periplasmic component  27.71 
 
 
243 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1096  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  27.85 
 
 
266 aa  48.9  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0514529  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0725  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  24.56 
 
 
271 aa  48.5  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0157367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1290  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.34 
 
 
470 aa  48.5  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0703  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.24 
 
 
244 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3319  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.24 
 
 
244 aa  47.8  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3431  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.24 
 
 
244 aa  47.8  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0554  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  26.63 
 
 
234 aa  47  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22790  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  26.85 
 
 
219 aa  47  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06170  4Fe-4S protein  27.22 
 
 
226 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0847  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.24 
 
 
244 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1590  periplasmic nitrate reductase subunit NapG  28.05 
 
 
256 aa  46.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2412  quinol dehydrogenase periplasmic component  25.44 
 
 
230 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2984  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.1 
 
 
241 aa  45.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3149  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.24 
 
 
244 aa  45.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0861746  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3164  ferredoxin-type protein NapG  28.22 
 
 
270 aa  45.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2716  quinol dehydrogenase periplasmic component  26.04 
 
 
230 aa  45.4  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0014  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.48 
 
 
1116 aa  45.1  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.952368 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2648  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.22 
 
 
538 aa  44.7  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0802  quinol dehydrogenase periplasmic component  25.25 
 
 
246 aa  44.7  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.208725  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0872  quinol dehydrogenase periplasmic component  25.25 
 
 
246 aa  44.3  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0937  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50 
 
 
158 aa  44.3  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.153792  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3221  hypothetical protein  28.4 
 
 
263 aa  44.3  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>