More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0660 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0660  hydrolase, TatD family  100 
 
 
266 aa  542  1e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0516456  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1192  YabD  59.38 
 
 
254 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.937754  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1355  TatD family hydrolase  60 
 
 
271 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.300834  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0672  TatD family hydrolase  59.22 
 
 
271 aa  309  2.9999999999999997e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0747  TatD family hydrolase  58.43 
 
 
271 aa  307  1.0000000000000001e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1083  TatD-related deoxyribonuclease  60.78 
 
 
258 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.634743  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0460  TatD family hydrolase  57.59 
 
 
261 aa  301  9e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0653  TatD-related deoxyribonuclease  59.06 
 
 
265 aa  298  8e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0953194  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0299  putative deoxyribonuclease Sll1786  57.53 
 
 
256 aa  279  3e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.858826  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1985  glyoxalase II  53.97 
 
 
253 aa  275  8e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  42.91 
 
 
256 aa  208  9e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  43.24 
 
 
255 aa  204  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  42.53 
 
 
257 aa  203  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  42.53 
 
 
257 aa  203  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  43.63 
 
 
255 aa  202  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  43.63 
 
 
255 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  43.63 
 
 
255 aa  202  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  43.63 
 
 
255 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  43.63 
 
 
255 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  43.24 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  43.24 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  43.24 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  43.24 
 
 
255 aa  199  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  42.75 
 
 
255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  43.24 
 
 
255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  37.69 
 
 
255 aa  198  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  41.54 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  41.6 
 
 
256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  37.45 
 
 
459 aa  191  7e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  41.22 
 
 
257 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  41.22 
 
 
256 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  39.92 
 
 
257 aa  188  7e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  40.68 
 
 
606 aa  188  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  40.6 
 
 
262 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  39.46 
 
 
256 aa  186  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  40.68 
 
 
255 aa  185  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  40.75 
 
 
262 aa  185  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  38.26 
 
 
462 aa  184  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  37.5 
 
 
457 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  40.15 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  39.62 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  39.08 
 
 
462 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  39.85 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  39.69 
 
 
256 aa  183  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  38.85 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  38.7 
 
 
255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  39.46 
 
 
266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1984  putative metallodependent hydrolase  39.05 
 
 
265 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000140367  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1316  putative metallodependent hydrolase  39.05 
 
 
265 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  hitchhiker  0.00000000025238 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2167  putative metallodependent hydrolase  39.05 
 
 
265 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  hitchhiker  0.000000000251924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1301  putative metallodependent hydrolase  39.05 
 
 
265 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0214431  hitchhiker  0.0000000000156726 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1278  putative metallodependent hydrolase  39.05 
 
 
265 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.558923  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  39.08 
 
 
262 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  40.68 
 
 
263 aa  180  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  38.35 
 
 
262 aa  180  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1769  TatD family hydrolase  39.08 
 
 
266 aa  180  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.655605 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  40.54 
 
 
253 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  39.46 
 
 
262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1739  TatD family hydrolase  39.08 
 
 
274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.50309  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  38.08 
 
 
254 aa  179  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  37.45 
 
 
263 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  37.93 
 
 
268 aa  179  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  36.9 
 
 
263 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  36.9 
 
 
263 aa  179  5.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  37.83 
 
 
258 aa  178  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  39.16 
 
 
265 aa  178  8e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  39.03 
 
 
262 aa  178  8e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  39.08 
 
 
283 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  38.72 
 
 
262 aa  177  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  39.08 
 
 
283 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  39.08 
 
 
283 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  36.84 
 
 
258 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2260  TatD-related deoxyribonuclease  37.07 
 
 
263 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225663  normal  0.492402 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  36.7 
 
 
257 aa  177  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  39.77 
 
 
257 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  36.84 
 
 
258 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  39.77 
 
 
257 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  36.5 
 
 
258 aa  176  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  36.64 
 
 
256 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  36.64 
 
 
256 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  38.82 
 
 
251 aa  176  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  38.78 
 
 
265 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  38.78 
 
 
265 aa  176  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  38.78 
 
 
265 aa  176  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  38.78 
 
 
265 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  38.78 
 
 
265 aa  176  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  38.78 
 
 
265 aa  176  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  38.78 
 
 
265 aa  176  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  38.78 
 
 
265 aa  176  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2211  TatD family hydrolase  39.08 
 
 
280 aa  175  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  37.5 
 
 
464 aa  175  8e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  38.4 
 
 
264 aa  175  9e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  38.11 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1926  TatD family hydrolase  39.69 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  35.42 
 
 
264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  36.86 
 
 
458 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  37.16 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  37.16 
 
 
255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  39.78 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  37.59 
 
 
259 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>