89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0309 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0309  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  392  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0860  hypothetical protein  47.37 
 
 		 189 aa  162  3e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1469  transformation system protein  44.21 
 
 		 189 aa  160  7e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1638  transformation system protein  43.62 
 
 		 191 aa  160  1e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1458  transformation system protein  42.33 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.476694  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1047  transformation system protein  42.11 
 
 		 191 aa  143  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.733048  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1172  transformation system protein  42.11 
 
 		 191 aa  143  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.363092  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0760  transformation system protein  42.11 
 
 		 191 aa  140  8e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00157325  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1215  transformation system protein  38.89 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1143  conserved hypothetical protein, possible purine/pyrimidine phosphoribosyltransferase  38.95 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  27.32 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  30.81 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20620  predicted amidophosphoribosyltransferase  34.31 
 
 		 253 aa  52.4  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  23.38 
 
 		 229 aa  52  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  32.56 
 
 		 232 aa  51.6  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1247  phosphoribosyltransferase  27.23 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1208  phosphoribosyltransferase  27.23 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195663  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  36.84 
 
 		 245 aa  50.1  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  27.62 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  31.58 
 
 		 269 aa  49.7  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  32.35 
 
 		 242 aa  49.3  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  27.54 
 
 		 217 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  27.54 
 
 		 217 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4012  competence protein ComF  30.3 
 
 		 249 aa  48.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  33 
 
 		 238 aa  48.5  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0756  putative amidophosphoribosyltransferase  37.5 
 
 		 107 aa  48.1  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  27.75 
 
 		 230 aa  48.1  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  27.81 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  31.28 
 
 		 299 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  34.69 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  30.33 
 
 		 273 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  32.77 
 
 		 259 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  38.37 
 
 		 282 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4394  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.13 
 
 		 312 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  26.76 
 
 		 223 aa  45.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5311  comF operon protein 3  27.1 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0506612  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  25.51 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0337  competence protein F, putative  24.23 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  25.35 
 
 		 242 aa  45.8  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3712  gluconate periplasmic binding protein  26.85 
 
 		 227 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3880  gluconate periplasmic binding protein  26.85 
 
 		 227 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3818  gluconate periplasmic binding protein  26.85 
 
 		 227 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  24.42 
 
 		 242 aa  45.4  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5299  comF operon protein 3  26.32 
 
 		 234 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3784  gluconate periplasmic binding protein  26.85 
 
 		 227 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  26.4 
 
 		 229 aa  45.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5357  comF operon protein 3  26.49 
 
 		 190 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  34.58 
 
 		 231 aa  45.1  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  27.63 
 
 		 227 aa  44.7  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3709  gluconate periplasmic binding protein  26.85 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.604176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  29.52 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  34.29 
 
 		 253 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5041  comF operon protein 3  25 
 
 		 234 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5281  comF operon protein 3  25.16 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000208608 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1648  phosphoribosyltransferase  30.91 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  34.09 
 
 		 244 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  39.68 
 
 		 243 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5425  ComF operon protein 3  25.16 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.412025  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1678  ComF family protein  24.54 
 
 		 230 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  31.63 
 
 		 262 aa  43.5  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  37.21 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0964  competence protein F  29.81 
 
 		 238 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186379  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  25.93 
 
 		 247 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  37.21 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  28.3 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  37.21 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3874  orotate phosphoribosyltransferase  39.62 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0737  ribose-phosphate pyrophosphokinase  24.62 
 
 		 312 aa  42.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  30.71 
 
 		 276 aa  42  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0985  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28.44 
 
 		 249 aa  42.4  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  22.28 
 
 		 246 aa  42  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  38.81 
 
 		 308 aa  42  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  35.14 
 
 		 271 aa  42  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  36.07 
 
 		 242 aa  42  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0998  hypothetical protein  29.63 
 
 		 208 aa  41.6  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.338338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3237  late competence protein  25.26 
 
 		 230 aa  41.6  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00615  amidophosphoribosyltransferase  32.58 
 
 		 185 aa  41.6  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5646  comF operon protein 3  23.84 
 
 		 190 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.740013  hitchhiker  0.00000001662 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  42.22 
 
 		 181 aa  41.6  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4720  gluconate periplasmic binding protein  25.71 
 
 		 248 aa  41.2  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0300  gluconate periplasmic binding protein  26.67 
 
 		 227 aa  41.2  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414054  normal  0.0237558 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.83 
 
 		 291 aa  41.2  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03265  gluconate periplasmic binding protein with phosphoribosyltransferase domain, GNT I system  26.67 
 
 		 227 aa  41.2  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0300  comF family protein  26.67 
 
 		 227 aa  41.2  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00612033  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03217  hypothetical protein  26.67 
 
 		 227 aa  41.2  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00548769  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3610  gluconate periplasmic binding protein  26.67 
 
 		 227 aa  41.2  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  31.19 
 
 		 215 aa  41.2  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3694  gluconate periplasmic binding protein  26.67 
 
 		 227 aa  41.2  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  36.36 
 
 		 255 aa  41.2  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>