140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3328 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3328  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  100 
 
 		 169 aa  348  2e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435703 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3286  phage tail Collar  62.35 
 
 		 168 aa  222  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2682  phage tail collar domain-containing protein  49.7 
 
 		 169 aa  194  7e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0278651  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3288  phage tail Collar  54.29 
 
 		 175 aa  189  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.890287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4988  tail collar domain-containing protein  51.19 
 
 		 163 aa  179  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  49.72 
 
 		 181 aa  177  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4954  tail collar domain-containing protein  49.71 
 
 		 171 aa  176  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4989  tail collar domain-containing protein  50.29 
 
 		 173 aa  175  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4953  tail collar domain-containing protein  48.26 
 
 		 165 aa  175  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294288  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1336  Tail Collar domain protein  46.47 
 
 		 169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1292  Tail Collar domain protein  48.85 
 
 		 167 aa  171  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  46.55 
 
 		 172 aa  168  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2607  Tail Collar domain protein  47.13 
 
 		 175 aa  167  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2641  phage tail collar domain-containing protein  50 
 
 		 195 aa  166  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.262211 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  49.72 
 
 		 178 aa  166  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0184  microcystin dependent protein  43.41 
 
 		 183 aa  164  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2453  phage tail Collar  44.97 
 
 		 166 aa  162  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2609  Tail Collar domain protein  46.95 
 
 		 170 aa  163  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.247685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2684  phage tail collar domain-containing protein  47.06 
 
 		 171 aa  162  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0111921  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3327  phenylacrylic acid decarboxylase  46.89 
 
 		 174 aa  161  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449816 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2640  phage tail collar domain-containing protein  48.55 
 
 		 199 aa  161  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1349  phage tail collar domain-containing protein  47.51 
 
 		 181 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3173  tail collar domain-containing protein  46.41 
 
 		 179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0996292  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0116  hypothetical protein  45.81 
 
 		 182 aa  160  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.964945  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1099  tail collar domain-containing protein  43.58 
 
 		 179 aa  159  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  42.86 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2009  Tail Collar domain protein  45.26 
 
 		 189 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.410779  normal  0.314034 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3326  forkhead-associated  45.45 
 
 		 176 aa  158  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1982  Tail Collar domain protein  45.26 
 
 		 189 aa  158  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2454  phage tail Collar  48.28 
 
 		 165 aa  158  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.45663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  43.17 
 
 		 182 aa  157  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1338  Tail Collar domain protein  44.25 
 
 		 173 aa  156  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2328  hypothetical protein  47.37 
 
 		 199 aa  154  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000740366  normal  0.751095 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  45.76 
 
 		 176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0737  Tail Collar domain protein  48.82 
 
 		 167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2329  hypothetical protein  48.26 
 
 		 197 aa  153  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000218448  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03557  microcystin dependent protein  43.72 
 
 		 181 aa  153  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1098  tail collar domain-containing protein  42.93 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.958881  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  42.21 
 
 		 199 aa  151  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  42.71 
 
 		 199 aa  151  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1294  Tail Collar domain protein  43.6 
 
 		 173 aa  150  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.911705 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2683  phage tail collar domain-containing protein  46.34 
 
 		 163 aa  150  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  42.21 
 
 		 199 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  41.71 
 
 		 199 aa  148  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0736  Tail Collar domain protein  46.29 
 
 		 172 aa  148  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1012  phage tail Collar  45.56 
 
 		 176 aa  147  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0947871  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  45 
 
 		 181 aa  146  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  43.18 
 
 		 176 aa  144  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1455  Phage tail Collar  41.11 
 
 		 186 aa  144  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.349612  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2455  phage tail Collar  41.76 
 
 		 176 aa  144  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5802  tail collar domain-containing protein  44.05 
 
 		 166 aa  144  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1097  tail collar domain-containing protein  40.88 
 
 		 181 aa  143  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal  0.740743 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1337  Tail Collar domain protein  39.66 
 
 		 171 aa  143  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5801  tail collar domain-containing protein  42.44 
 
 		 173 aa  141  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334192 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2872  microcystin dependent  42.86 
 
 		 179 aa  140  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497886 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1348  phage tail collar domain-containing protein  43.65 
 
 		 205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4987  tail collar domain-containing protein  43.14 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0735  Tail Collar domain protein  41.71 
 
 		 173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  38.73 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0117  hypothetical protein  41.48 
 
 		 177 aa  139  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  0.412841 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03558  microcystin dependent protein  40.23 
 
 		 175 aa  136  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5865  Tail Collar domain protein  41.12 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3729  phage tail Collar  38.31 
 
 		 198 aa  134  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0351559  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0674  tail collar domain-containing protein  41.24 
 
 		 195 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  hitchhiker  0.003962 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1453  Phage tail Collar  39.46 
 
 		 187 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4047  phage tail collar domain-containing protein  39.66 
 
 		 180 aa  133  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1014  phage tail Collar  37.36 
 
 		 180 aa  132  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00907435  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1013  phage tail Collar  35.8 
 
 		 176 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295632  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  38.01 
 
 		 170 aa  131  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0118  hypothetical protein  41.04 
 
 		 173 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.595481 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0155  Phage tail Collar  38.66 
 
 		 195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1668  phage tail collar domain-containing protein  40.61 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000114685  normal  0.438569 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5803  tail collar domain-containing protein  40.22 
 
 		 180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4898  Tail Collar domain protein  39.34 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.705005  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4899  Tail Collar domain protein  38.59 
 
 		 183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142286  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4900  Tail Collar domain protein  37.57 
 
 		 192 aa  124  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.129965  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1454  Phage tail Collar  34.27 
 
 		 178 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.809591  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1669  phage tail collar domain-containing protein  37.56 
 
 		 206 aa  118  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343584  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5866  Tail Collar domain protein  39.58 
 
 		 195 aa  118  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255471  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03559  microcystin dependent protein  36.46 
 
 		 178 aa  118  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.536453  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4253  tail collar domain-containing protein  36.23 
 
 		 207 aa  117  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0588212  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0186  microcystin dependent protein  37.57 
 
 		 181 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0053  phage tail collar domain-containing protein  38.68 
 
 		 209 aa  114  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6119  Tail Collar domain protein  41.86 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1350  phage tail collar domain-containing protein  34.08 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0167  phage tail collar domain-containing protein  34.42 
 
 		 211 aa  105  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5259  hypothetical protein  34.55 
 
 		 224 aa  100  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0135116  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4048  phage tail collar domain-containing protein  41.34 
 
 		 179 aa  97.8  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4722  phage tail collar domain-containing protein  62.3 
 
 		 80 aa  95.9  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4235  phage tail collar domain-containing protein  32.18 
 
 		 204 aa  95.1  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.296558  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4767  phage tail collar domain-containing protein  58.06 
 
 		 80 aa  94  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.428551 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3002  phage tail Collar  32.86 
 
 		 210 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.592982 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4236  phage tail collar domain-containing protein  32.51 
 
 		 203 aa  89.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290715  normal  0.365652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2124  Tail Collar domain protein  57.35 
 
 		 84 aa  89  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2491  Tail Collar domain protein  51.52 
 
 		 80 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4046  phage tail collar domain-containing protein  36.87 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0703  Tail Collar domain protein  32.53 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2887  Tail Collar domain protein  45 
 
 		 80 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00705187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0595  phage tail collar domain-containing protein  62.3 
 
 		 80 aa  75.1  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2493  Tail Collar domain protein  51.67 
 
 		 81 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>