40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3439 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3439  PepSY-associated TM helix  100 
 
 		 221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0854  PepSY-associated TM helix  98.64 
 
 		 221 aa  447  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3510  PepSY-associated TM helix  96.83 
 
 		 241 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3633  PepSY-associated TM helix  96.83 
 
 		 221 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0271  hypothetical protein  35.4 
 
 		 252 aa  148  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2335  hypothetical protein  35.51 
 
 		 246 aa  145  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0761845  normal  0.418419 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2276  hypothetical protein  35.35 
 
 		 247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0509869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0345  PepSY-associated TM helix  41.62 
 
 		 247 aa  145  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.965963  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3463  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.84 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.234764 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0734  hypothetical protein  34.98 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.611753  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0376  PepSY-associated TM helix  36.02 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3753  hypothetical protein  35.71 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0289731 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3580  PepSY-associated TM helix  35.55 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2410  hypothetical protein  36.32 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0940252  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0344  PepSY-associated TM helix  37.57 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.305287 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2460  hypothetical protein  31.92 
 
 		 257 aa  105  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0204  hypothetical protein  32 
 
 		 251 aa  98.6  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2356  hypothetical protein  31.86 
 
 		 234 aa  95.5  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2357  PepSY-associated TM helix  29.02 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11713  hypothetical protein  27.19 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1052  hypothetical protein  28.07 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6817  hypothetical protein  27.98 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2409  PepSY-associated TM helix  28.26 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0289711  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6865  hypothetical protein  26.15 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.432634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0270  hypothetical protein  26.34 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0735  hypothetical protein  28.69 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2334  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.55 
 
 		 658 aa  62.4  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0217317  normal  0.528208 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2277  Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrF  26.64 
 
 		 639 aa  57  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.712445 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3511  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.35 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.49 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3440  PepSY-associated TM helix domain protein  23.35 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.23 
 
 		 359 aa  55.1  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3634  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.34 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4221  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.28 
 
 		 477 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0059  hypothetical protein  24.02 
 
 		 501 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3754  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.66 
 
 		 359 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303924 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3132  PepSY-associated TM helix domain protein  27.98 
 
 		 510 aa  45.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.785962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3331  hypothetical protein  31.46 
 
 		 497 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.525329 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3581  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.41 
 
 		 359 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2117  PepSY-associated TM helix domain protein  24.44 
 
 		 519 aa  41.6  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>