35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0515 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0515  MSHA biogenesis protein MshO  100 
 
 		 290 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.141751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0519  MSHA biogenesis protein MshO  90.39 
 
 		 282 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3825  MSHA biogenesis protein MshO  89.68 
 
 		 282 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0143391  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0494  MSHA biogenesis protein MshO  89.32 
 
 		 282 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709841  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0571  MSHA biogenesis protein MshO  79.58 
 
 		 281 aa  455  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4102  MSHA biogenesis protein MshO  76.6 
 
 		 282 aa  436  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0476  methylation site containing protein  77.74 
 
 		 287 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0553768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3475  methylation site containing protein  78.09 
 
 		 287 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3651  methylation site containing protein  76.68 
 
 		 287 aa  429  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3337  MSHA biogenesis protein MshO precursor  60.07 
 
 		 278 aa  323  1e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.131781  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3757  methylation site containing protein  53.57 
 
 		 295 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0400  methylation site containing protein  52.63 
 
 		 265 aa  263  4e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.642203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4405  methylation site containing protein  51.93 
 
 		 277 aa  256  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0464  MSHA biogenesis protein MshO precursor  48.94 
 
 		 282 aa  255  7e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.467537  normal  0.968118 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3741  methylation site containing protein  53.21 
 
 		 275 aa  251  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.772407  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0555  methylation site containing protein  49.82 
 
 		 269 aa  249  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0166475  normal  0.583012 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0180  prepilin-type cleavage/methylation  36.84 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4566  putative MSHA biogenesis protein MshO  35.96 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1144  MSHA biogenesis protein MshO  28.42 
 
 		 282 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3265  type II secretory pathway pseudopilin PulG  31.23 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0763  hypothetical protein  30.71 
 
 		 261 aa  92.8  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0696342  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002380  MSHA biogenesis protein MshO  28.92 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.197407  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03688  hypothetical protein  28.57 
 
 		 237 aa  87  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00261  Tfp pilus assembly protein PilW  25.69 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2830  hypothetical protein  40.66 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.496531  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0886  general secretion pathway protein H  30.54 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.115142 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0394  type II secretory pathway pseudopilin PulG  27.87 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3339  methylation  26.76 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.510017  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0480  exported protein MshO  24.13 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.772217  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3104  hypothetical protein  34.07 
 
 		 297 aa  58.9  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1798  hypothetical protein  35.71 
 
 		 1145 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0757  hypothetical protein  26.21 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.538658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0340  N-terminal methylation motif domain protein  32.2 
 
 		 567 aa  43.5  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1034  hypothetical protein  32.14 
 
 		 1104 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.881671 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4845  type IV pilus assembly protein PilW  28.83 
 
 		 237 aa  43.1  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>