More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2613 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  100 
 
 
270 aa  554  1e-157  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  42.08 
 
 
266 aa  226  4e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4001  alpha/beta hydrolase fold protein  40.93 
 
 
271 aa  208  7e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  38.91 
 
 
266 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0700  alpha/beta fold family hydrolase  27.13 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.338828  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  31.5 
 
 
274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  31.99 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  31.95 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 
272 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  32.21 
 
 
272 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6302  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  28.32 
 
 
273 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  31.14 
 
 
272 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 
272 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  27.7 
 
 
273 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  30.97 
 
 
272 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 
270 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
272 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 
273 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 
274 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  30.53 
 
 
273 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 
273 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  26.87 
 
 
273 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 
273 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
273 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 
273 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 
338 aa  102  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 
275 aa  102  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 
273 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0314  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
303 aa  101  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000332733  normal  0.010488 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
305 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
273 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  29.28 
 
 
273 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 
340 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  27.99 
 
 
272 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
272 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
324 aa  99  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 
276 aa  99  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
334 aa  98.6  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2363  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
328 aa  98.6  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.329927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2427  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 
267 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 
276 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0492  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 
313 aa  97.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 
297 aa  97.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02640  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.14 
 
 
281 aa  96.7  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0973655  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  27.74 
 
 
273 aa  97.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86812  predicted protein  27.92 
 
 
312 aa  96.7  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  28.57 
 
 
322 aa  96.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 
269 aa  96.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.10927  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
277 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
277 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
277 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 
273 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0741  alpha/beta fold family hydrolase  27.01 
 
 
263 aa  95.5  8e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00132598  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
290 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  26.02 
 
 
330 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 
324 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 
277 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3584  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 
274 aa  93.6  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0874  alpha/beta hydrolase fold protein  26.97 
 
 
301 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  27.96 
 
 
275 aa  93.2  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  27.82 
 
 
277 aa  93.2  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
274 aa  93.2  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 
273 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  26.44 
 
 
279 aa  92.8  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 
278 aa  92.4  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 
292 aa  92.4  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5814  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 
273 aa  92.4  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.086599  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  27.61 
 
 
276 aa  92  9e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 
297 aa  92  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 
273 aa  92  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 
275 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  28.99 
 
 
280 aa  90.5  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  27.14 
 
 
274 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 
273 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  27.14 
 
 
274 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0621  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
277 aa  89.7  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 
279 aa  89.7  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
278 aa  89.7  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  24.29 
 
 
274 aa  89.7  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
278 aa  89.7  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 
273 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3320  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
273 aa  89.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 
290 aa  89  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 
286 aa  89  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  25.38 
 
 
260 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5825  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 
276 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0224159  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.94 
 
 
273 aa  88.2  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 
286 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4606  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 
262 aa  88.6  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.34 
 
 
262 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3996  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
277 aa  87.4  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.01 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06620  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.92 
 
 
281 aa  87.4  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.270497  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4028  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
280 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>