More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4900 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4900  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
298 aa  587  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000488276 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4425  alpha/beta hydrolase fold  80.61 
 
 
302 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1443  alpha/beta hydrolase fold protein  34.75 
 
 
293 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.384489  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1124  hydrolase/oxidase  22.78 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370065  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  27.11 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  32.19 
 
 
494 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2354  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658883  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.21 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 
295 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6254  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  26.48 
 
 
274 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  27.4 
 
 
286 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 
278 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 
291 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  29.12 
 
 
327 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 
453 aa  62.4  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
328 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0771  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  26.53 
 
 
289 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
291 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
328 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
291 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3261  alpha/beta hydrolase fold protein  25.57 
 
 
272 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767293  normal  0.718789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  29.06 
 
 
302 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
291 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
327 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 
281 aa  60.5  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
327 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
340 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
327 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  27.35 
 
 
275 aa  58.9  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
279 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
277 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 
309 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3346  alpha/beta hydrolase fold protein  32.08 
 
 
274 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6821  alpha/beta hydrolase fold protein  26.76 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3625  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 
274 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  24.41 
 
 
276 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  33 
 
 
293 aa  57  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  37.78 
 
 
254 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  35.51 
 
 
330 aa  57.4  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 
297 aa  57.4  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  26.71 
 
 
294 aa  57  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1487  alpha/beta hydrolase fold protein  38.66 
 
 
267 aa  57  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.672056  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  33 
 
 
302 aa  57  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 
296 aa  57  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 
273 aa  56.6  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
301 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2364  alpha/beta hydrolase fold  35.42 
 
 
352 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  24.71 
 
 
279 aa  56.2  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  24.71 
 
 
279 aa  56.2  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  24.71 
 
 
279 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  24.71 
 
 
279 aa  56.2  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
322 aa  56.2  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  24.71 
 
 
279 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 
340 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  26.39 
 
 
279 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 
289 aa  55.8  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  24.29 
 
 
287 aa  55.8  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  25.69 
 
 
279 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1701  alpha/beta hydrolase fold protein  26.53 
 
 
303 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2485  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 
353 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.125677 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00788  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08810)  32.8 
 
 
313 aa  55.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0593995  normal  0.200969 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03628  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  35.71 
 
 
275 aa  55.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 
303 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  27.8 
 
 
346 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
294 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  24.51 
 
 
279 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  26.85 
 
 
279 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  23.72 
 
 
297 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  34.34 
 
 
263 aa  55.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  25.08 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 
301 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  23.47 
 
 
294 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1726  alpha/beta hydrolase fold protein  25.4 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5248  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 
287 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  24.16 
 
 
291 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  23.9 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1843  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
320 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00347923  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 
325 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 
294 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18381  alpha/beta fold family hydrolase  23.08 
 
 
304 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5099  haloalkane dehalogenase  29.29 
 
 
295 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal  0.0388419 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
283 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  37.62 
 
 
252 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6488  Alpha/beta hydrolase  23.08 
 
 
271 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0140  hypothetical protein  26.62 
 
 
281 aa  53.9  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 
310 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  38.6 
 
 
330 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 
301 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  25.54 
 
 
269 aa  53.9  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>