More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4425 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4425  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 302 aa  597  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4900  alpha/beta hydrolase fold  80.61 
 
 		 298 aa  473  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000488276 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1443  alpha/beta hydrolase fold protein  37.15 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.384489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  23.89 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  26.41 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  30.14 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2354  alpha/beta hydrolase fold protein  31.99 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658883  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1124  hydrolase/oxidase  21.83 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3261  alpha/beta hydrolase fold protein  26.44 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767293  normal  0.718789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 302 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5694  alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0242785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  21.7 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  25.72 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  25.72 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6254  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  23.87 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4957  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.0565751 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  37 
 
 		 328 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  37 
 
 		 328 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1693  putative hydrolase  22.69 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800205 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03628  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  35.96 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3346  alpha/beta hydrolase fold protein  30.84 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  23.6 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  23.32 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  22.92 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  22.92 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  22.92 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  22.92 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  22.92 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6821  alpha/beta hydrolase fold protein  27.15 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  36.26 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  22.71 
 
 		 279 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  23.11 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  37 
 
 		 327 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  26.26 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 		 246 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1487  alpha/beta hydrolase fold protein  36.13 
 
 		 267 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.672056  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3625  alpha/beta hydrolase fold  30.84 
 
 		 274 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3137  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  22.92 
 
 		 279 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0857  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.34 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00184237  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  34.04 
 
 		 259 aa  54.3  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  22.81 
 
 		 276 aa  53.5  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6488  Alpha/beta hydrolase  23.94 
 
 		 271 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  30.69 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 350 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  31.25 
 
 		 254 aa  53.5  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  35 
 
 		 326 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  27.42 
 
 		 298 aa  53.1  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  35 
 
 		 324 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  35 
 
 		 324 aa  52.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1701  alpha/beta hydrolase fold protein  23.98 
 
 		 303 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  35 
 
 		 324 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  30.69 
 
 		 302 aa  53.1  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  35 
 
 		 327 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  35 
 
 		 326 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  35 
 
 		 324 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  35 
 
 		 324 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  32.86 
 
 		 295 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  24.19 
 
 		 301 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 303 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1726  alpha/beta hydrolase fold protein  23.55 
 
 		 303 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 327 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 327 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 		 281 aa  52.4  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  35.56 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3829  bioH protein  32.38 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2640  putative hydrolase  28.91 
 
 		 194 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.660495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  24.48 
 
 		 289 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  32.98 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2524  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 		 271 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191212  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 327 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3075  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3153  alpha/beta hydrolase fold  24.39 
 
 		 271 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0769848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11214  hypothetical protein  39.78 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00241452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0140  hypothetical protein  25.96 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0771  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0155  hypothetical protein  25.81 
 
 		 306 aa  50.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0704545  normal  0.0817623 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  33.33 
 
 		 263 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  28.66 
 
 		 297 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  32.08 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  33 
 
 		 346 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 		 350 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>