217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1361 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 282 aa  554  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  88.65 
 
 		 282 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  79.41 
 
 		 292 aa  430  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2562  XRE family transcriptional regulator  85.33 
 
 		 342 aa  360  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  49.44 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  46.83 
 
 		 287 aa  222  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  44.24 
 
 		 296 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  44.77 
 
 		 303 aa  209  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  44.29 
 
 		 302 aa  208  7e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  45.96 
 
 		 302 aa  205  8e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  44.89 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 285 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  45.29 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  44.32 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  45.29 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  46.07 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  44.57 
 
 		 278 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  46.99 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 297 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  43.22 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  44.48 
 
 		 304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  40.62 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  46.4 
 
 		 313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  45.32 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  45.76 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  44.03 
 
 		 292 aa  192  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3498  transcriptional regulator, XRE family  42.55 
 
 		 293 aa  192  7e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  45.71 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  44.69 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12000  Helix-turn-helix protein  47.64 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  45.19 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  42.91 
 
 		 293 aa  188  7e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  41.05 
 
 		 290 aa  185  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 288 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  44.32 
 
 		 288 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  41.7 
 
 		 307 aa  185  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0777  transcriptional regulator, XRE family  42.01 
 
 		 287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245899  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  42.22 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  42.75 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20310  hypothetical protein  42.96 
 
 		 297 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.643001  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2109  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  43.59 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  40.37 
 
 		 303 aa  178  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  41.54 
 
 		 334 aa  175  7e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  43.28 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  42.18 
 
 		 286 aa  172  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14230  Helix-turn-helix protein  43.63 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.814537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  41.3 
 
 		 281 aa  169  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5666  putative transcriptional regulator, XRE family  41.29 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  37.82 
 
 		 276 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  41.51 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  38.38 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  42.59 
 
 		 291 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 284 aa  165  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  41.76 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  40.22 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 317 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4329  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1956  putative transcriptional regulator, XRE family  41.61 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4541  helix-turn-helix domain-containing protein  38.54 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2389  helix-turn-helix domain protein  41.07 
 
 		 311 aa  159  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00160745  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2718  helix-turn-helix domain protein  38.57 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.479107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 289 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 289 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3153  transcriptional regulator, XRE family  38.55 
 
 		 290 aa  155  6e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4317  helix-turn-helix domain protein  41.8 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2521  helix-turn-helix domain protein  43.03 
 
 		 285 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.895975  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1949  transcriptional regulator, XRE family  38.93 
 
 		 307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2804  putative transcriptional regulator, XRE family  37.45 
 
 		 300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7620  putative transcriptional regulator, XRE family  40.52 
 
 		 278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350779  normal  0.254497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  36.29 
 
 		 280 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8805  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1995  transcriptional regulator, XRE family  41.75 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000234374  normal  0.041772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  40.87 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0368  transcriptional regulator, XRE family  40.23 
 
 		 291 aa  149  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  34.96 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4244  helix-turn-helix domain protein  39.16 
 
 		 287 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16850  Helix-turn-helix protein  39.54 
 
 		 280 aa  146  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  0.0208664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4662  helix-turn-helix domain protein  37.81 
 
 		 287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1305  XRE family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 287 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 299 aa  145  9e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  38.06 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19630  Helix-turn-helix protein  36.16 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.879989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 314 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  35.09 
 
 		 275 aa  143  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2024  putative transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 286 aa  143  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  36.06 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3299  helix-turn-helix domain protein  39.34 
 
 		 280 aa  142  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.043491  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3700  transcriptional regulator, XRE family  39.15 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.564208  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8368  XRE family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 288 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6085  transcriptional regulator, XRE family  38.66 
 
 		 291 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.126069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  38.7 
 
 		 313 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  35.96 
 
 		 280 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3785  helix-turn-helix domain-containing protein  38.79 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 295 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>