223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0923 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0923  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  393  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0987  hypothetical protein  91.33 
 
 
196 aa  360  9e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0723  hypothetical protein  65.38 
 
 
196 aa  241  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1704  hypothetical protein  47.34 
 
 
208 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  hitchhiker  0.00529814 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0924  hypothetical protein  49.74 
 
 
193 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1710  hypothetical protein  48.65 
 
 
192 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  45.5 
 
 
198 aa  156  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3882  protein of unknown function DUF179  49.19 
 
 
191 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5392  hypothetical protein  44.92 
 
 
204 aa  154  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.891404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5481  hypothetical protein  44.92 
 
 
204 aa  154  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478764  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5768  hypothetical protein  44.92 
 
 
204 aa  154  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802117  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39570  hypothetical protein  45.86 
 
 
198 aa  154  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.336935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2389  hypothetical protein  46.84 
 
 
198 aa  153  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.468382  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7076  hypothetical protein  45.5 
 
 
193 aa  152  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0850  hypothetical protein  44.26 
 
 
204 aa  151  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6057  hypothetical protein  42.25 
 
 
201 aa  149  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.229198  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10037  hypothetical protein  44.15 
 
 
202 aa  149  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.739012 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1179  protein of unknown function DUF179  46.2 
 
 
184 aa  148  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0188247  normal  0.235234 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0367  protein of unknown function DUF179  44.5 
 
 
192 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4219  protein of unknown function DUF179  41.8 
 
 
209 aa  143  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1471  hypothetical protein  45.99 
 
 
205 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1289  hypothetical protein  46.28 
 
 
191 aa  140  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5395  hypothetical protein  42.33 
 
 
190 aa  137  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4833  protein of unknown function DUF179  38.67 
 
 
225 aa  132  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0922435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  41.53 
 
 
182 aa  129  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5076  protein of unknown function DUF179  39.67 
 
 
187 aa  128  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  41.3 
 
 
183 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1773  transcriptional regulator  33.7 
 
 
182 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  32.8 
 
 
187 aa  99.8  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  34.41 
 
 
189 aa  98.6  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  33.68 
 
 
186 aa  97.1  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  34.92 
 
 
187 aa  96.3  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  32.81 
 
 
186 aa  95.5  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1432  protein of unknown function DUF179  33.53 
 
 
188 aa  92  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.914919  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  91.7  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  31.18 
 
 
188 aa  91.3  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  33.33 
 
 
184 aa  91.3  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3631  hypothetical protein  35.26 
 
 
184 aa  87.4  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  32.28 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  31.05 
 
 
187 aa  85.9  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  30.6 
 
 
187 aa  84.3  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0483  hypothetical protein  29.44 
 
 
190 aa  83.6  0.000000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.195339  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1764  protein of unknown function DUF179  30.41 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.619647  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  32.62 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4491  hypothetical protein  33.14 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154644  normal  0.460951 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  34.42 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2850  hypothetical protein  28.16 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  30.29 
 
 
200 aa  79  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  35.76 
 
 
190 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0726  hypothetical protein  32.9 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0620  hypothetical protein  29.66 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3962  hypothetical protein  35.33 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0636  hypothetical protein  29.66 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  31.07 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  31.15 
 
 
198 aa  75.9  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  33.33 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  35 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  31.82 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  30.23 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  30.46 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  33.33 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  33.33 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  26.88 
 
 
190 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  31.61 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  28.16 
 
 
188 aa  74.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  28.81 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  31.79 
 
 
184 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  29.28 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  31.79 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  31.37 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  29.19 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  32.68 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  31.18 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4073  protein of unknown function DUF179  34.78 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.424244  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  33.33 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09628  putative transcriptional regulator  26.63 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.770481  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6966  hypothetical protein  31.15 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4106  protein of unknown function DUF179  34.78 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  30.29 
 
 
186 aa  72  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0140  hypothetical protein  25.95 
 
 
209 aa  72  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  30.63 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  34 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  29.71 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  31.84 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0457  hypothetical protein  32.8 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  28.49 
 
 
185 aa  71.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  31.43 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  30.23 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  29.56 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  29.56 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  28 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  32.26 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  30.54 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  31.25 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  31.06 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0426  hypothetical protein  31.48 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.152287  normal  0.709849 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0753  hypothetical protein  25.82 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  31.74 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  28.73 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  29.56 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>