75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1898 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  694    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  49.69 
 
 		 372 aa  299  4e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  47.34 
 
 		 417 aa  291  8e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  51.11 
 
 		 329 aa  277  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  49.83 
 
 		 329 aa  275  6e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  49.09 
 
 		 361 aa  265  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  49.09 
 
 		 361 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  49.09 
 
 		 361 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  52.2 
 
 		 365 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  52.2 
 
 		 365 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  52.38 
 
 		 365 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  52.38 
 
 		 365 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  52.2 
 
 		 365 aa  259  7e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  47.6 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  45.81 
 
 		 346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  47.23 
 
 		 338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  48.73 
 
 		 354 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  42.11 
 
 		 318 aa  209  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  39.87 
 
 		 317 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  36.97 
 
 		 327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  33.97 
 
 		 349 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  35.87 
 
 		 323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  36.16 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  38.26 
 
 		 318 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  34.58 
 
 		 337 aa  179  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  39.74 
 
 		 330 aa  173  5e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  30.98 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  31.97 
 
 		 326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  30.09 
 
 		 374 aa  139  7.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  34.34 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  31.23 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  29.97 
 
 		 315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  30.29 
 
 		 316 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  27.89 
 
 		 333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  29.8 
 
 		 346 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  31.19 
 
 		 317 aa  113  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  27.14 
 
 		 353 aa  112  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  28.1 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  29.05 
 
 		 372 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  27.21 
 
 		 323 aa  102  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  25.51 
 
 		 353 aa  99.8  6e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  27.87 
 
 		 316 aa  99.4  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  27.64 
 
 		 357 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  29.31 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  27.64 
 
 		 357 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  27.48 
 
 		 339 aa  97.4  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  29 
 
 		 341 aa  97.1  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  27.52 
 
 		 337 aa  95.9  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  26.01 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  25.46 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  26.69 
 
 		 352 aa  93.2  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  28.75 
 
 		 344 aa  93.6  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  25.73 
 
 		 344 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  27.95 
 
 		 319 aa  90.5  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  27.95 
 
 		 319 aa  90.5  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  28.62 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  25 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  26.77 
 
 		 318 aa  87  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  25.34 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  27.21 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  25.31 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  28.53 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  23.13 
 
 		 943 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  22.99 
 
 		 412 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  25.18 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  25.1 
 
 		 267 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  22.86 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0481  protein of unknown function DUF58  19.73 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  27.88 
 
 		 497 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  25 
 
 		 421 aa  43.9  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  22.64 
 
 		 363 aa  43.5  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  24.82 
 
 		 275 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  24.1 
 
 		 275 aa  43.5  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  28.87 
 
 		 395 aa  42.7  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  26.72 
 
 		 431 aa  42.7  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>