227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0510 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  623  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  63.43 
 
 		 317 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  63.43 
 
 		 317 aa  401  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  62.58 
 
 		 320 aa  391  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  62.09 
 
 		 317 aa  388  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  61.94 
 
 		 325 aa  385  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  58.65 
 
 		 322 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  58.97 
 
 		 322 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  58.65 
 
 		 337 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  58.65 
 
 		 322 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  58.65 
 
 		 322 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  59.11 
 
 		 321 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  59.16 
 
 		 321 aa  368  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  59.61 
 
 		 325 aa  369  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  59.16 
 
 		 321 aa  368  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  59.16 
 
 		 320 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  60.65 
 
 		 325 aa  371  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  59.11 
 
 		 321 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  59.16 
 
 		 321 aa  368  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  59.11 
 
 		 321 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  58.44 
 
 		 325 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  59.35 
 
 		 323 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  58.71 
 
 		 321 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  58.79 
 
 		 321 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3381  Integral membrane protein TerC  60 
 
 		 319 aa  354  7.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  54.81 
 
 		 317 aa  353  2e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  57.42 
 
 		 322 aa  350  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  54.81 
 
 		 317 aa  343  2e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  56.29 
 
 		 320 aa  336  3.9999999999999995e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4461  integral membrane protein TerC  53.9 
 
 		 334 aa  322  6e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  52.09 
 
 		 319 aa  319  3e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1080  integral membrane protein TerC  53.06 
 
 		 315 aa  317  1e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.132797  normal  0.336795 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03496  export protein  54.52 
 
 		 318 aa  317  1e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  52.32 
 
 		 320 aa  316  4e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3859  integral membrane protein TerC  52.4 
 
 		 327 aa  311  9e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.891237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3132  Integral membrane protein TerC  53.62 
 
 		 327 aa  310  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  49.51 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  48.24 
 
 		 338 aa  288  8e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  45.77 
 
 		 331 aa  287  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  48.87 
 
 		 328 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  49.01 
 
 		 328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  50.65 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  45.42 
 
 		 311 aa  278  6e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  47.47 
 
 		 320 aa  276  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  44.87 
 
 		 311 aa  276  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  46.08 
 
 		 306 aa  276  4e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  47.13 
 
 		 359 aa  275  9e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  49.84 
 
 		 314 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  44.37 
 
 		 310 aa  271  9e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  45.75 
 
 		 307 aa  270  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  45.95 
 
 		 321 aa  269  5e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  48.54 
 
 		 328 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  45.77 
 
 		 330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  47.85 
 
 		 314 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  43.89 
 
 		 318 aa  266  4e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  45.31 
 
 		 321 aa  264  2e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  46.79 
 
 		 327 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  47.1 
 
 		 308 aa  263  3e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  44.51 
 
 		 321 aa  261  8e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  47.71 
 
 		 313 aa  261  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  46.33 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  43.04 
 
 		 354 aa  259  4e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5359  TerC family protein  46.33 
 
 		 325 aa  258  7e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  hitchhiker  0.00169974 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  44.09 
 
 		 337 aa  258  8e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  44.12 
 
 		 322 aa  258  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  46.44 
 
 		 314 aa  257  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  45.16 
 
 		 313 aa  256  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  44.24 
 
 		 329 aa  255  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  44.95 
 
 		 312 aa  254  9e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  45.71 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  45.02 
 
 		 312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1647  Integral membrane protein TerC  47.37 
 
 		 279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.409513  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  45.43 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  45.08 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  45.45 
 
 		 320 aa  252  7e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  45.48 
 
 		 311 aa  252  7e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  44.83 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  45.45 
 
 		 320 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  46.71 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  44.83 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  45.03 
 
 		 312 aa  250  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  44.83 
 
 		 328 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  46.71 
 
 		 346 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  45.25 
 
 		 330 aa  249  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  44.01 
 
 		 318 aa  249  3e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  45.27 
 
 		 352 aa  249  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1451  integral membrane protein TerC  44.51 
 
 		 328 aa  249  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  44.2 
 
 		 325 aa  249  5e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0942  integral membrane protein TerC  43.53 
 
 		 328 aa  249  5e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  45.07 
 
 		 320 aa  249  6e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  44.2 
 
 		 327 aa  249  6e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  44.2 
 
 		 327 aa  249  6e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  49.68 
 
 		 334 aa  249  6e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  44.51 
 
 		 328 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  44.2 
 
 		 325 aa  248  7e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  45.98 
 
 		 344 aa  248  8e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  46.39 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  43.89 
 
 		 325 aa  247  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  44.76 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  45.34 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>