243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2916 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2916  flagellar hook-associated protein  100 
 
 		 441 aa  862    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1262  flagellar hook-associated protein FlgK  39.46 
 
 		 450 aa  279  9e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.237896  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  29.27 
 
 		 459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  28.23 
 
 		 457 aa  127  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  27.27 
 
 		 457 aa  126  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  27.9 
 
 		 457 aa  126  9e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  26.81 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  28.29 
 
 		 458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0074  FlgK flagellar hook-associated protein 1  35.89 
 
 		 1363 aa  117  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  29.82 
 
 		 549 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3362  flagellar hook-associated protein FlgK  26.77 
 
 		 458 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1710  flagellar hook-associated protein FlgK  35.89 
 
 		 1363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.447823  normal  0.0702953 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  26.75 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0989  flagellar hook-associated protein FlgK  28.84 
 
 		 482 aa  114  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100834  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0272  lateral flagellar hook associated protein 1  26.3 
 
 		 458 aa  112  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.508781 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  25.42 
 
 		 480 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2041  flagellar hook-associated protein FlgK  27 
 
 		 463 aa  110  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  28.1 
 
 		 637 aa  110  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31330  flagellar hook-associated protein FlgK  26.07 
 
 		 475 aa  108  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  28.61 
 
 		 644 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  26.75 
 
 		 463 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1233  flagellar hook-associated protein FlgK  29.27 
 
 		 649 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  28.61 
 
 		 647 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0215  flagellar hook-associated protein FlgK  27.16 
 
 		 455 aa  103  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727542  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1233  flagellar hook-associated protein FlgK  28.66 
 
 		 649 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1663  flagellar hook-associated protein FlgK  30.75 
 
 		 1365 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1622  flagellar hook-associated protein FlgK  26.95 
 
 		 482 aa  99.8  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  27.14 
 
 		 546 aa  99  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  28.48 
 
 		 541 aa  98.2  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  25.1 
 
 		 471 aa  98.2  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  26.71 
 
 		 457 aa  98.2  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  28.83 
 
 		 653 aa  98.2  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  24.09 
 
 		 464 aa  97.1  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  25.88 
 
 		 554 aa  97.1  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0022  flagellar hook-associated protein FlgK  27.96 
 
 		 443 aa  97.1  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  25.88 
 
 		 554 aa  97.1  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  25.88 
 
 		 554 aa  96.7  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  26.87 
 
 		 457 aa  96.7  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  23.44 
 
 		 486 aa  96.7  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  26.94 
 
 		 642 aa  95.9  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0648  flagellar hook-associated protein FlgK  23.61 
 
 		 453 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  27.84 
 
 		 686 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  26.87 
 
 		 465 aa  95.1  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0218  flagellar hook-associated protein FlgK  23.59 
 
 		 453 aa  94.7  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0250  flagellar hook-associated protein FlgK  27.94 
 
 		 667 aa  94  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4711  flagellar hook-associated protein FlgK  26.84 
 
 		 641 aa  93.6  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402809  normal  0.0701142 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  23.74 
 
 		 531 aa  93.6  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  28.45 
 
 		 645 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3335  flagellar hook-associated protein FlgK  27.03 
 
 		 667 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  28.45 
 
 		 645 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0079  flagellar hook-associated protein FlgK  30.08 
 
 		 588 aa  92.4  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3004  flagellar hook-associated protein FlgK  27.03 
 
 		 667 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2089  flagellar hook-associated protein FlgK  27.03 
 
 		 667 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0276  flagellar hook-associated protein FlgK  27.03 
 
 		 714 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0246  flagellar hook-associated protein FlgK  26.51 
 
 		 452 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0288  flagellar hook-associated protein FlgK  27.03 
 
 		 667 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3344  flagellar hook-associated protein FlgK  27.03 
 
 		 667 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0473  flagellar hook-associated protein FlgK  27.03 
 
 		 667 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  30.31 
 
 		 695 aa  91.3  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  27.03 
 
 		 640 aa  90.9  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  26.19 
 
 		 477 aa  90.9  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  24.68 
 
 		 454 aa  90.1  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3471  flagellar hook-associated protein FlgK  26.77 
 
 		 686 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  26.09 
 
 		 547 aa  89  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  26.09 
 
 		 547 aa  89  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  26.11 
 
 		 547 aa  89  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2563  flagellar hook-associated protein FlgK  25.62 
 
 		 481 aa  89.7  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  22.82 
 
 		 541 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  25.57 
 
 		 685 aa  89.4  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  26.11 
 
 		 547 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  26.11 
 
 		 547 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  26.11 
 
 		 547 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  25.96 
 
 		 464 aa  88.6  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  26.41 
 
 		 547 aa  88.6  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  26.11 
 
 		 547 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  27.86 
 
 		 683 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  26.11 
 
 		 547 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  23.15 
 
 		 858 aa  88.2  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  26.29 
 
 		 631 aa  87.8  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  29.55 
 
 		 682 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  22.84 
 
 		 858 aa  87.4  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  29.41 
 
 		 640 aa  87  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2589  flagellar hook-associated protein FlgK  25.96 
 
 		 568 aa  87  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0560  flagellar hook-associated protein FlgK  27.07 
 
 		 658 aa  86.7  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3642  flagellar hook-associated protein  23.55 
 
 		 457 aa  86.3  9e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  26.18 
 
 		 640 aa  86.3  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  25.68 
 
 		 920 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2422  flagellar hook-associated protein FlgK  26.96 
 
 		 698 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  25.74 
 
 		 553 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  25.74 
 
 		 553 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  25.74 
 
 		 553 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4680  flagellar hook-associated protein FlgK  24.25 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296928 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  25.74 
 
 		 553 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  25.74 
 
 		 553 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  23.28 
 
 		 583 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  23.82 
 
 		 637 aa  83.6  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  21.72 
 
 		 489 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3010  flagellar hook-associated protein FlgK  27.38 
 
 		 659 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1486  flagellar hook-associated protein  27.94 
 
 		 665 aa  83.2  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  26.35 
 
 		 629 aa  83.2  0.000000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.770281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>