128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2551 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2551  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  270  7e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2442  putative copper efflux system periplasmic protein CusF  46.03 
 
 		 122 aa  100  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5388  hypothetical protein  49.41 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2320  hypothetical protein  52.27 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0023  hypothetical protein  42.86 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.814264  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0025  hypothetical protein  42.86 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.130406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0023  hypothetical protein  42.86 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.803739 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4016  heavy metal efflux system protein  38.2 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2039  hypothetical protein  44.09 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4052  Tn4652, TnpA repressor protein TnpC, putative  42.53 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3979  hypothetical protein  44.58 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6290  hypothetical protein  40.86 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2580  hypothetical protein  51.47 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2581  hypothetical protein  48.53 
 
 		 236 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.405095 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4403  hypothetical protein  50.79 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.574836  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  49.3 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1032  hypothetical protein  47.06 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1033  protein of unknown function DUF305  47.76 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  49.25 
 
 		 546 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4901  hypothetical protein  45.95 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7872  hypothetical protein  48.53 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0715  hypothetical protein  39.81 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115312  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4823  hypothetical protein  45.95 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186817 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5191  hypothetical protein  41.49 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.255118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.88 
 
 		 537 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  48.44 
 
 		 538 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4604  hypothetical protein  44.59 
 
 		 94 aa  57  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.647307  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2010  RND family efflux transporter MFP subunit  40.19 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  51.79 
 
 		 537 aa  56.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0623  hypothetical protein  40.19 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3490  hypothetical protein  41.18 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2549  secretion protein HlyD  46.88 
 
 		 490 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1332  hypothetical protein  42.31 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1391  putative cation efflux system transmembrane protein  46.77 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0160925  normal  0.327473 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3354  hypothetical protein  39.78 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  43.66 
 
 		 537 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1093  hypothetical protein  44.93 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4752  hypothetical protein  38.46 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533115  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3415  hypothetical protein  38.46 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4101  hypothetical protein  38.46 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.385135 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0538  hypothetical protein  40.91 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0116  hypothetical protein  44.93 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  37.08 
 
 		 540 aa  53.9  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1326  hypothetical protein  34.78 
 
 		 134 aa  52.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3892  RND family efflux transporter MFP subunit  40.43 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0493  hypothetical protein  43.28 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119099 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4353  RND family efflux transporter MFP subunit  40.43 
 
 		 115 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0871487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2763  hypothetical protein  34.78 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1958  RND family efflux transporter MFP subunit  42.03 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0416  hypothetical protein  44.05 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3489  hypothetical protein  39.71 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5183  RND family efflux transporter MFP subunit  37.11 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3363  RND family efflux transporter MFP subunit  35.44 
 
 		 483 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.640634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.15 
 
 		 512 aa  51.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1203  hypothetical protein  36.25 
 
 		 120 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2654  hypothetical protein  41.79 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3346  RND family efflux transporter MFP subunit  36.73 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3492  secretion protein HlyD  40 
 
 		 545 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5034  periplasmic copper-binding protein  46.15 
 
 		 123 aa  50.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2049  RND family efflux transporter MFP subunit  43.1 
 
 		 523 aa  50.4  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00264035 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3056  periplasmic copper-binding protein  33.85 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2293  hypothetical protein  39.13 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119473  normal  0.136633 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0620  periplasmic copper-binding protein  33.85 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000654239  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3073  periplasmic copper-binding protein  33.85 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00534  periplasmic copper-binding protein  33.85 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  37.04 
 
 		 504 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4550  hypothetical protein  40.91 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00523  hypothetical protein  33.85 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0069  cation efflux system domain-containing protein  42.86 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0591  periplasmic copper-binding protein  33.85 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00546027  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0591  periplasmic copper-binding protein  32.31 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.877525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4560  hypothetical protein  39.39 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  46.3 
 
 		 517 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2325  RND family efflux transporter MFP subunit  41.38 
 
 		 513 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.757874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1637  hypothetical protein  40.3 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214754  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6281  RND family efflux transporter MFP subunit  34.34 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.358593 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0471  hypothetical protein  42.19 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5685  RND family efflux transporter MFP subunit  34.78 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0654  periplasmic copper-binding protein  32.31 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.380565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5684  hypothetical protein  38.81 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2211  RND family efflux transporter MFP subunit  38.46 
 
 		 486 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2196  hypothetical protein  42.35 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  35.79 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132756  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3403  RND family efflux transporter MFP subunit  35.79 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0733  hypothetical protein  38.24 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3386  cation efflux system protein  27.2 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1463  hypothetical protein  37.65 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2262  hypothetical protein  39.13 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4512  RND family efflux transporter MFP subunit  45.76 
 
 		 552 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4028  hypothetical protein  38.24 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0335786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4113  RND family efflux transporter MFP subunit  37.93 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3914  hypothetical protein  38.24 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.248976  normal  0.907588 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.07 
 
 		 500 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2720  hypothetical protein  40.3 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00719919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4298  periplasmic copper-binding protein  34.72 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4171  RND family efflux transporter MFP subunit  40 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.339982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0316  hypothetical protein  39.13 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0877405  normal  0.0871096 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6069  hypothetical protein  41.38 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387914  normal  0.0699917 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5288  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.67 
 
 		 516 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1647  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.67 
 
 		 516 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0515736  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>