280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1608 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1887  Na+/H+ exchanger family protein  49.93 
 
 
689 aa  680    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1608  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  100 
 
 
688 aa  1377    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0429  Na+/H+ antiporter  44.16 
 
 
680 aa  571  1e-161  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.708351  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2465  sodium/hydrogen exchanger  29.74 
 
 
692 aa  259  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148199  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2514  sodium/hydrogen exchanger  29.74 
 
 
692 aa  259  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0398611  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06580  Na+ antiporter  30.89 
 
 
666 aa  218  2e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.855563 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2745  sodium/hydrogen exchanger  31.92 
 
 
667 aa  209  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  31.99 
 
 
554 aa  201  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1657  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  29.93 
 
 
705 aa  200  9e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  32.52 
 
 
548 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0289  Na+/H+ antiporter, putative  30.28 
 
 
679 aa  196  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  31.4 
 
 
551 aa  196  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  32.17 
 
 
563 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  32.17 
 
 
563 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  32.17 
 
 
563 aa  196  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  32.17 
 
 
563 aa  196  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4528  Na+/H+ antiporter  31.67 
 
 
549 aa  195  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03937  predicted cation/proton antiporter  32.17 
 
 
549 aa  193  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3927  Na+/H+ antiporter  32.17 
 
 
549 aa  193  7e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4308  Na+/H+ antiporter  32.17 
 
 
549 aa  193  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3962  Na+/H+ antiporter  32.17 
 
 
549 aa  193  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00930832 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4583  Na+/H+ antiporter  32.17 
 
 
549 aa  193  7e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5570  Na+/H+ antiporter  32.17 
 
 
549 aa  193  7e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03897  hypothetical protein  32.17 
 
 
549 aa  193  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.733833  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4620  Na+/H+ antiporter  32.17 
 
 
549 aa  193  7e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.799359  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10750  Na+ antiporter  31.13 
 
 
770 aa  193  8e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0270  Na+/H+ antiporter  32.38 
 
 
548 aa  192  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063266  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  32.94 
 
 
555 aa  192  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1943  sodium/hydrogen exchanger  32.97 
 
 
666 aa  191  5e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.575078  normal  0.181083 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0667  sodium/hydrogen exchanger  29.57 
 
 
680 aa  190  5.999999999999999e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0883524  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0652  sodium/hydrogen exchanger  29.57 
 
 
680 aa  190  5.999999999999999e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  32.94 
 
 
551 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  32.47 
 
 
548 aa  189  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4430  Na+/H+ antiporter  32.65 
 
 
549 aa  188  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.470814 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1481  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  33.4 
 
 
690 aa  188  3e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  32.16 
 
 
548 aa  187  5e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  30.27 
 
 
566 aa  185  3e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3138  Na+/H+ antiporter  29.15 
 
 
547 aa  184  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  30.69 
 
 
549 aa  183  8.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  30.27 
 
 
566 aa  183  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3378  Na+/H+ antiporter  30.24 
 
 
548 aa  182  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000770944  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1230  sodium/hydrogen exchanger  29.94 
 
 
757 aa  180  7e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.503131  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3263  Na+/H+ antiporter  29.8 
 
 
548 aa  178  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  32.18 
 
 
555 aa  178  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1234  Na+/H+ antiporter  31.16 
 
 
549 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0196469 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0359  Na+/H+ antiporter  31.16 
 
 
549 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0428  Na+/H+ antiporter  31.16 
 
 
549 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0366963  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  30.04 
 
 
654 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  28.92 
 
 
633 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  32.51 
 
 
555 aa  174  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1569  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  26.65 
 
 
698 aa  173  7.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  29.1 
 
 
555 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0104  Na+/H+ antiporter  33.03 
 
 
552 aa  172  2e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  28.92 
 
 
555 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3166  Na+/H+ antiporter  32 
 
 
542 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300063  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0564  Na+/H+ antiporter  29.84 
 
 
585 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564881  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  33.7 
 
 
553 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03053  Na+/H+ antiporter  29.96 
 
 
545 aa  168  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  34.05 
 
 
581 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3545  Na+/H+ antiporter  32.77 
 
 
546 aa  167  6.9999999999999995e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0379  Na+/H+ antiporter  29.84 
 
 
555 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0399  Na+/H+ antiporter  29.84 
 
 
555 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.117645  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0497  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  28.99 
 
 
695 aa  166  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.429815  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1587  Na+/H+ antiporter  31 
 
 
566 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.373701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4190  Na+/H+ antiporter  31.31 
 
 
548 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.200807  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0358  Na+/H+ antiporter  30.65 
 
 
631 aa  165  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.075768  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  34.12 
 
 
425 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1665  sodium/hydrogen exchanger  26.05 
 
 
653 aa  164  7e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1141  Na+/H+ antiporter  30.18 
 
 
548 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.678529 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5394  Na+/H+ antiporter  27.55 
 
 
545 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.622563  normal  0.782547 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4086  Na+/H+ antiporter  30.87 
 
 
548 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1228  Na+/H+ antiporter  29.98 
 
 
546 aa  153  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1095  Na+/H+ antiporter  31.61 
 
 
543 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11700  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  34.33 
 
 
775 aa  150  6e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.273812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  28.05 
 
 
536 aa  150  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  27.47 
 
 
524 aa  150  7e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  27.27 
 
 
527 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  27.89 
 
 
534 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  27.82 
 
 
525 aa  147  5e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  26.44 
 
 
533 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  27.94 
 
 
537 aa  145  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5974  Na+/H+ antiporter  30.42 
 
 
577 aa  143  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  28.33 
 
 
537 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  27.66 
 
 
524 aa  140  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2343  Na+/H+ antiporter  29.79 
 
 
560 aa  139  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  28.54 
 
 
511 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  27.65 
 
 
531 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  26.52 
 
 
524 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  33.24 
 
 
526 aa  135  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  33.24 
 
 
526 aa  135  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  33.24 
 
 
526 aa  135  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  33.24 
 
 
526 aa  135  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  33.24 
 
 
526 aa  135  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  32.55 
 
 
527 aa  135  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  28.53 
 
 
537 aa  135  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1516  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  31.15 
 
 
577 aa  134  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.116985  normal  0.152785 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  33.24 
 
 
526 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  28.72 
 
 
521 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  32.96 
 
 
526 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  24.86 
 
 
527 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>