221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2225 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2225  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 114 aa  233  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.666474  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2627  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.8267  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  33.67 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  32.61 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03940  transcriptional regulator, ArsR family  32.53 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.621476  normal  0.0987714 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  38.1 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  32.5 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2592  regulatory protein ArsR  33.68 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.108396 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  38.1 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  34.57 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  35.23 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  32.63 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1142  transcriptional regulator, ArsR family  34.72 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.629326  normal  0.465859 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0248  regulatory protein ArsR  38.04 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4493  transcriptional regulator, ArsR family  27.93 
 
 		 302 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  32.58 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2808  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 101 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.598578  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  33.75 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  34.09 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  35.29 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  35.29 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  32.94 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4079  transcriptional regulator, MarR family  32.47 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0764894  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  30.39 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2381  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.43402  normal  0.916761 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2713  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1854  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  30.86 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  32 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  30.23 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  32.53 
 
 		 114 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2839  metal-regulated homodimeric transcriptional regulator  33.8 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2062  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.242619  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  30.23 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0480  ArsR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0108431  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2108  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.777393  normal  0.0654079 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2283  transcriptional regulator, ArsR family  27.17 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2045  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  30.23 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1619  regulatory protein ArsR  34.21 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  30.23 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3099  regulatory protein ArsR  31.46 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  32 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2942  regulatory protein ArsR  31.46 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.130788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2994  regulatory protein ArsR  31.46 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.566931  normal  0.0250812 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4284  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  43.04 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  29.89 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  27.27 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2977  regulatory protein ArsR  31.46 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.623995  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2910  regulatory protein, ArsR  31.46 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  31.52 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  32.35 
 
 		 118 aa  45.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3421  regulatory protein, ArsR  33.85 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.993799  normal  0.836004 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2275  ArsR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  31.63 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  38.36 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 		 227 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  29.63 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  32.05 
 
 		 94 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1969  ArsR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  33.78 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1714  ArsR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.515787  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000827961  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4283  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.18 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3214  transcriptional regulator, ArsR family  30.34 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  32.5 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2080  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  35.09 
 
 		 271 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0586  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.516582  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  28.42 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>