More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1413 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1413  ThiJ/PfpI family protein  100 
 
 		 172 aa  343  6e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1963  PfpI family intracellular peptidase  88.3 
 
 		 171 aa  310  9e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.710922  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1929  PfpI family intracellular peptidase  88.3 
 
 		 171 aa  310  9e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.833537  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03020  predicted intracellular protease  48.85 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0552  intracellular protease, PfpI family  48.85 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3345  PfpI family intracellular peptidase  48.85 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3618  intracellular peptidase, PfpI family  48.85 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02971  hypothetical protein  48.85 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3590  PfpI family intracellular peptidase  50 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.638149  normal  0.0943675 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3636  PfpI family intracellular peptidase  48.85 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4473  intracellular peptidase, PfpI family  48.85 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0545  PfpI family intracellular peptidase  48.85 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712189  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3564  PfpI family intracellular peptidase  48.28 
 
 		 172 aa  157  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3458  intracellular peptidase, PfpI family  48.28 
 
 		 172 aa  157  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3624  intracellular peptidase, PfpI family  48.28 
 
 		 172 aa  157  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3456  intracellular protease 1  48.28 
 
 		 172 aa  157  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3527  intracellular peptidase, PfpI family  48.28 
 
 		 172 aa  157  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3449  PfpI family intracellular peptidase  48.28 
 
 		 172 aa  157  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0802  thiJ/pfpI family protein  47.09 
 
 		 171 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0842  thiJ/pfpI family protein  47.09 
 
 		 171 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0898  intracellular protease 1  47.67 
 
 		 171 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0919  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  44.71 
 
 		 168 aa  151  5e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57671  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2558  intracellular protease, PfpI family  44.12 
 
 		 172 aa  151  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0751  protease I, ThiJ/PfpI family protein  46.51 
 
 		 171 aa  149  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0938  thiJ/pfpI family protein  46.51 
 
 		 171 aa  149  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000935342 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0753  PfpI family intracellular peptidase  47.67 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0935  thiJ/pfpI family protein  46.51 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0746  protease I, ThiJ/PfpI family protein  45.93 
 
 		 171 aa  147  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4439  intracellular protease 1  45.93 
 
 		 171 aa  144  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.831334  normal  0.103801 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  43.43 
 
 		 189 aa  143  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  43.79 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1532  PfpI family intracellular peptidase  42.6 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  40.94 
 
 		 173 aa  137  6e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  44.51 
 
 		 183 aa  137  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  41.28 
 
 		 189 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  41.07 
 
 		 168 aa  134  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  42.86 
 
 		 188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  39.64 
 
 		 168 aa  132  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  42.86 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  41.38 
 
 		 188 aa  131  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  43.93 
 
 		 186 aa  130  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  41.86 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  40.57 
 
 		 193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  41.14 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0815  PfpI family intracellular peptidase  42.01 
 
 		 189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.119747 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2130  PfpI family intracellular peptidase  38.46 
 
 		 184 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.334013  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  41.76 
 
 		 177 aa  128  5.0000000000000004e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  41.07 
 
 		 188 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2882  peptidase C56, PfpI  38.42 
 
 		 185 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348106  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2926  PfpI family intracellular peptidase  38.42 
 
 		 185 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2912  PfpI family intracellular peptidase  38.42 
 
 		 185 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367289  normal  0.283246 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3488  PfpI family intracellular peptidase  40.23 
 
 		 188 aa  124  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4496  peptidase C56, PfpI  39.64 
 
 		 364 aa  123  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  39.53 
 
 		 204 aa  123  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  40.34 
 
 		 181 aa  123  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  40.57 
 
 		 187 aa  123  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0863  peptidase C56, PfpI  40.34 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1595  PfpI family intracellular peptidase  35.84 
 
 		 199 aa  121  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16340  intracellular protease, PfpI family  38.73 
 
 		 194 aa  121  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4771  PfpI family intracellular protease  37.87 
 
 		 366 aa  120  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.102673  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5796  PfpI family intracellular peptidase  38.98 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4592  intracellular protease, PfpI family  40.7 
 
 		 189 aa  119  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3024  PfpI peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C56  41.07 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0470812  normal  0.272847 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  39.31 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2970  intracellular protease, PfpI family  42.77 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0104  intracellular protease, PfpI family  39.53 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6630  intracellular protease, PfpI family  38.51 
 
 		 184 aa  118  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0685678 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0951  peptidase C56, PfpI  36.87 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  39.88 
 
 		 187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0097  intracellular protease, PfpI family  38.95 
 
 		 182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1574  intracellular protease, PfpI family  41.57 
 
 		 241 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  38.1 
 
 		 189 aa  117  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0578  intracellular protease, PfpI family  38.1 
 
 		 364 aa  117  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3148  intracellular protease, PfpI family  36.9 
 
 		 363 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  37.85 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  38.18 
 
 		 245 aa  116  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  38.69 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03390  Peptidase C56, PfpI  37.79 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0217955  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1154  intracellular protease, PfpI family  40.48 
 
 		 166 aa  114  5e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.25545e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1734  intracellular protease, PfpI family  38.46 
 
 		 170 aa  114  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0443029 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  36.21 
 
 		 197 aa  114  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  38.46 
 
 		 169 aa  114  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2033  intracellular protease, PfpI family  34.71 
 
 		 173 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  38.46 
 
 		 169 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0160  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.36 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  39.31 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4125  intracellular protease, PfpI family  41.24 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1159  PfpI family intracellular peptidase  40.61 
 
 		 167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.123312  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  36.16 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0118  intracellular protease, PfpI family  37.5 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0615011  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2987  PfpI family intracellular peptidase  36.87 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  39.29 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2218  intracellular protease, PfpI family  38.6 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.554266  normal  0.164233 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1646  peptidase C56, PfpI  38.24 
 
 		 174 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5298  PfpI family intracellular peptidase  38.95 
 
 		 183 aa  111  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  0.0507605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1035  PfpI family intracellular peptidase  36.72 
 
 		 182 aa  111  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1190  intracellular protease, PfpI family  32.75 
 
 		 170 aa  111  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.311369  normal  0.0141697 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0077  peptidase C56, PfpI  36.78 
 
 		 174 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0445898  normal  0.845154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4698  intracellular protease PfpI family  37.36 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5481  PfpI family intracellular peptidase  40.23 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892859  hitchhiker  0.00158499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>