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for query gene Rxyl_2903 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 438 aa  881    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  50.9 
 
 		 454 aa  472  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  51.14 
 
 		 454 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  51.14 
 
 		 454 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  51.14 
 
 		 454 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  51.14 
 
 		 478 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  51.14 
 
 		 454 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  50.68 
 
 		 454 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  50.68 
 
 		 479 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  50.23 
 
 		 468 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  50.45 
 
 		 454 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  53.54 
 
 		 430 aa  460  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  50.23 
 
 		 454 aa  456  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  54.61 
 
 		 453 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  49.54 
 
 		 448 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  52.45 
 
 		 434 aa  438  9.999999999999999e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  52.16 
 
 		 453 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0562  4-aminobutyrate aminotransferase  52.51 
 
 		 447 aa  426  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.921583 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  53.46 
 
 		 448 aa  427  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2313  4-aminobutyrate aminotransferase  51.26 
 
 		 446 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233271  normal  0.897192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2274  4-aminobutyrate aminotransferase  51.26 
 
 		 446 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  50.72 
 
 		 430 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  51.17 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2321  4-aminobutyrate aminotransferase  51.26 
 
 		 446 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42867  normal  0.490264 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  46.64 
 
 		 441 aa  418  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
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NC_009767  Rcas_0117  aminotransferase class-III  53.97 
 
 		 453 aa  421  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.457647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1956  4-aminobutyrate aminotransferase  50.69 
 
 		 450 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  47.92 
 
 		 438 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2924  4-aminobutyrate aminotransferase  49.77 
 
 		 450 aa  421  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.647687 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2405  aminotransferase class-III  50.23 
 
 		 450 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3663  4-aminobutyrate aminotransferase  54.04 
 
 		 445 aa  418  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  52.8 
 
 		 439 aa  416  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4570  aminotransferase class-III  53.55 
 
 		 447 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  49.31 
 
 		 446 aa  414  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2798  4-aminobutyrate aminotransferase  49.55 
 
 		 456 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539792 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  48 
 
 		 432 aa  410  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  47.49 
 
 		 426 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  47.28 
 
 		 426 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  47.52 
 
 		 426 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  47.49 
 
 		 426 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  47.52 
 
 		 426 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  48.56 
 
 		 425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3094  4-aminobutyrate aminotransferase  49.66 
 
 		 468 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  48.33 
 
 		 425 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  48.33 
 
 		 425 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  47.99 
 
 		 426 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  50.72 
 
 		 426 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  47.04 
 
 		 426 aa  404  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  47.26 
 
 		 426 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  47.26 
 
 		 426 aa  403  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  48.23 
 
 		 440 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  47.75 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  50.24 
 
 		 426 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  48.56 
 
 		 425 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  48.19 
 
 		 425 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  48.21 
 
 		 430 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3818  4-aminobutyrate aminotransferase  49.09 
 
 		 450 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104054  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4960  4-aminobutyrate aminotransferase  48.96 
 
 		 432 aa  395  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2371  4-aminobutyrate aminotransferase  51.55 
 
 		 440 aa  392  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0827884  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  50.48 
 
 		 422 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0029  4-aminobutyrate aminotransferase protein  50.97 
 
 		 426 aa  391  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0293  hypothetical protein  48.28 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  48.71 
 
 		 430 aa  391  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2002  4-aminobutyrate aminotransferase  50.95 
 
 		 434 aa  391  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607298 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0429  4-aminobutyrate aminotransferase  49.88 
 
 		 433 aa  391  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.286831  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  48.58 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  48.42 
 
 		 426 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  48.11 
 
 		 427 aa  391  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  47.87 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2905  4-aminobutyrate aminotransferase  45.86 
 
 		 427 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0848  4-aminobutyrate aminotransferase  50.36 
 
 		 425 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0309  hypothetical protein  48.05 
 
 		 450 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4167  4-aminobutyrate aminotransferase  48.68 
 
 		 434 aa  388  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  46.79 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0897  4-aminobutyrate aminotransferase  50.79 
 
 		 489 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1978  4-aminobutyrate aminotransferase  47.07 
 
 		 425 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2937  4-aminobutyrate aminotransferase  45.63 
 
 		 427 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  48.58 
 
 		 420 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2972  4-aminobutyrate aminotransferase  45.63 
 
 		 427 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109466  normal  0.025416 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  47.69 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3824  4-aminobutyrate aminotransferase  54.52 
 
 		 475 aa  382  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0707619  normal  0.0367563 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1723  4-aminobutyrate aminotransferase  50.92 
 
 		 451 aa  384  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.577321  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3262  4-aminobutyrate aminotransferase  50.12 
 
 		 425 aa  383  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.129895 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12609  4-aminobutyrate aminotransferase  49.66 
 
 		 449 aa  382  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.20545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4677  4-aminobutyrate aminotransferase  49.16 
 
 		 422 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300302  normal  0.0763833 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1889  4-aminobutyrate aminotransferase  48.24 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148357  normal  0.0202633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  46.88 
 
 		 427 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1100  4-aminobutyrate aminotransferase  47.26 
 
 		 425 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.840531  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1172  4-aminobutyrate aminotransferase  47.02 
 
 		 425 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.408586  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  46.89 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  47.12 
 
 		 427 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1910  4-aminobutyrate aminotransferase  47.43 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.692445  normal  0.29202 
 
 
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NC_013131  Caci_7835  4-aminobutyrate aminotransferase  46.68 
 
 		 443 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  47.12 
 
 		 429 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1289  4-aminobutyrate aminotransferase  45.69 
 
 		 426 aa  379  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_3186  4-aminobutyrate aminotransferase  46.78 
 
 		 425 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.365354  normal  0.0629171 
 
 
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NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  47.12 
 
 		 429 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  47.12 
 
 		 429 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
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NC_009997  Sbal195_1205  4-aminobutyrate aminotransferase  46.78 
 
 		 425 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.60622  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_46670  4-aminobutyrate transaminase  49.88 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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