More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2271 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2271  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  100 
 
 
547 aa  1091    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2675  thiamine pyrophosphate protein central region  57.95 
 
 
550 aa  635    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000213075  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3052  Thiamine pyrophosphate-requiring protein-like protein  50.08 
 
 
584 aa  526  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.912898  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1938  thiamine pyrophosphate protein central region  51.37 
 
 
547 aa  526  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.684685  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4926  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  53.22 
 
 
615 aa  517  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267965  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1505  thiamine pyrophosphate protein central region  48.09 
 
 
600 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173483  normal  0.846718 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0379  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  50.9 
 
 
554 aa  468  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4212  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  48.82 
 
 
477 aa  364  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0207401  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0969  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  39.18 
 
 
552 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1075  thiamine pyrophosphate protein central region  39.6 
 
 
551 aa  300  6e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0873  thiamine pyrophosphate protein central region  39.77 
 
 
550 aa  296  8e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0954869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3916  thiamine pyrophosphate protein central region  32.91 
 
 
550 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0769701  normal  0.56258 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4867  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  30.51 
 
 
591 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.562185 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4011  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  31.77 
 
 
593 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0930701  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2045  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  31.43 
 
 
592 aa  213  7e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.460294 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0805  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  31.43 
 
 
592 aa  213  7.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.153828  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1993  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  30.71 
 
 
605 aa  212  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15706  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4516  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  31.02 
 
 
605 aa  212  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2846  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  30.57 
 
 
593 aa  209  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.114516  normal  0.151315 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1010  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  30.39 
 
 
593 aa  209  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1642  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  30.39 
 
 
593 aa  209  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4277  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  30.39 
 
 
593 aa  209  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.268033  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3825  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  29.98 
 
 
607 aa  208  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1828  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  30.58 
 
 
593 aa  207  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.902523 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3502  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  29.37 
 
 
591 aa  207  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1992  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  30.24 
 
 
603 aa  207  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137247  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3999  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  29.98 
 
 
605 aa  206  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.422194  normal  0.0161793 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4214  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  30.16 
 
 
591 aa  204  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.169445  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0189  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  29.76 
 
 
578 aa  203  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000920393  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3773  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  29.43 
 
 
616 aa  203  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4369  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  30.46 
 
 
610 aa  203  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0691  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  30.28 
 
 
610 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000259545  normal  0.156409 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4208  acetolactate synthase  29.05 
 
 
550 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4168  acetolactate synthase  29.05 
 
 
550 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0760  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  30.35 
 
 
602 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0688  acetolactate synthase  29.17 
 
 
550 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  29.96 
 
 
555 aa  201  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6205  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  30.2 
 
 
603 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207188  normal  0.371773 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6210  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  30.2 
 
 
610 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1114  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.34 
 
 
562 aa  197  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0155  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  29.39 
 
 
592 aa  197  5.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.316464  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.8 
 
 
552 aa  196  9e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.18 
 
 
574 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.82 
 
 
573 aa  195  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2122  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.81 
 
 
572 aa  195  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.25 
 
 
573 aa  195  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274178  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3533  acetolactate synthase  29.91 
 
 
547 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.476222 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.26 
 
 
559 aa  194  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.15 
 
 
555 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.59 
 
 
555 aa  194  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1928  acetolactate synthase  28.91 
 
 
545 aa  194  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886275  normal  0.0286883 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1776  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.1 
 
 
573 aa  193  7e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2138  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.81 
 
 
572 aa  192  9e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.803808  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.44 
 
 
582 aa  192  1e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1830  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29 
 
 
572 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.38 
 
 
552 aa  192  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.31 
 
 
581 aa  192  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.66 
 
 
636 aa  192  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.05 
 
 
557 aa  192  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1934  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  30.51 
 
 
580 aa  192  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.81 
 
 
558 aa  191  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1750  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.13 
 
 
572 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.524546  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.96 
 
 
562 aa  192  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2269  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29 
 
 
572 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0515  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  30.51 
 
 
580 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0291729 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0220  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  28.36 
 
 
580 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4634  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  28.6 
 
 
581 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0123329  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0051  acetolactate synthase  26.55 
 
 
547 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.74 
 
 
572 aa  191  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.9 
 
 
581 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.69 
 
 
554 aa  189  8e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2490  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.62 
 
 
572 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.156428  hitchhiker  0.00098132 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2115  pyruvate oxidase  25.14 
 
 
579 aa  189  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.100527  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2279  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.49 
 
 
572 aa  189  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1858  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.26 
 
 
582 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.667431  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08220  pyruvate oxidase  27.37 
 
 
534 aa  189  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.52 
 
 
573 aa  189  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302703  decreased coverage  0.000148215 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.68 
 
 
554 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  28.73 
 
 
599 aa  188  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.72 
 
 
563 aa  188  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2201  pyruvate oxidase  26.82 
 
 
566 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0998219  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.46 
 
 
553 aa  188  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33590  thiamine pyrophosphate protein  30.8 
 
 
596 aa  187  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.345752 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05831  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.08 
 
 
587 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.72 
 
 
559 aa  187  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.46 
 
 
557 aa  187  5e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2757  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.97 
 
 
632 aa  186  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.928665  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.94 
 
 
535 aa  186  7e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2018  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.41 
 
 
573 aa  186  7e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.801766  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2360  pyruvate oxidase  26.3 
 
 
566 aa  186  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.15 
 
 
557 aa  186  7e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3793  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.79 
 
 
572 aa  186  8e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2386  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.44 
 
 
572 aa  186  8e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0890713  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2374  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.62 
 
 
572 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343911  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2706  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.17 
 
 
573 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001649  acetolactate synthase large subunit  27.74 
 
 
574 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546971  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3605  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.73 
 
 
572 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.9 
 
 
575 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.33 
 
 
569 aa  185  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3531  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.9 
 
 
575 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>