More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1832 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1832  methyltransferase type 11  100 
 
 
203 aa  397  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  42.94 
 
 
189 aa  106  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  34.88 
 
 
199 aa  102  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0558  Methyltransferase type 11  34.44 
 
 
188 aa  101  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166016  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  30.11 
 
 
189 aa  101  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4328  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 
188 aa  91.3  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4278  Methyltransferase type 11  37.65 
 
 
186 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.867588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1433  methyltransferase type 11  32.16 
 
 
190 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2464  Methyltransferase type 11  34.71 
 
 
187 aa  88.2  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788915  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  34.12 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0604  Methyltransferase type 11  29.83 
 
 
194 aa  87  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3310  methyltransferase type 11  32.77 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00554158  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2205  Methyltransferase type 11  32.93 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.450687  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2515  methyltransferase type 11  35.23 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3326  Methyltransferase type 11  32.96 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  33.89 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4072  Methyltransferase type 11  30.06 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0881  hypothetical protein  26.44 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.421379  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1436  Methyltransferase type 11  33.52 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3707  Methyltransferase type 11  31.18 
 
 
184 aa  74.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52514  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0017  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2303  Methyltransferase type 11  30.21 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0543227  normal  0.375483 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  34.44 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0457  methyltransferase type 11  30 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3127  methyltransferase type 11  29.68 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.182035  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2377  Methyltransferase type 11  31.01 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.954171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1842  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 
190 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617793 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0437  Methyltransferase type 11  29.07 
 
 
189 aa  64.3  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.598014  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  36.44 
 
 
215 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1330  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.14 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.283996  normal  0.0130791 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4188  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 
278 aa  59.3  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2622  Methyltransferase type 11  24.74 
 
 
191 aa  58.9  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.179692  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  35.63 
 
 
215 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  29.67 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  30.5 
 
 
265 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0321  demethylmenaquinone methyltransferase  35.23 
 
 
216 aa  57.4  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  25 
 
 
287 aa  57  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3178  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
239 aa  56.6  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.184817 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.17 
 
 
293 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0330  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
199 aa  55.8  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2671  SAM-dependent methyltransferase  28.08 
 
 
193 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4456  methyltransferase type 12  29.05 
 
 
180 aa  55.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  37.32 
 
 
309 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  36.79 
 
 
207 aa  55.1  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.47 
 
 
420 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  54.3  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.91 
 
 
264 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  29.03 
 
 
275 aa  53.9  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  33.11 
 
 
263 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  24.32 
 
 
285 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2756  glucose inhibited division protein  35.34 
 
 
239 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  24.32 
 
 
285 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2392  hypothetical protein  22.75 
 
 
206 aa  53.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.823369  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  27.22 
 
 
216 aa  53.1  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  36.45 
 
 
210 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  26.97 
 
 
209 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  36.19 
 
 
204 aa  53.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
340 aa  53.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  33.07 
 
 
245 aa  52.4  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 
261 aa  52.4  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4441  methyltransferase type 11  32.7 
 
 
294 aa  52.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0218  Methyltransferase type 11  24.73 
 
 
212 aa  52.4  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3469  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 
243 aa  52  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.508961  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.17 
 
 
209 aa  52  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 
255 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  25.27 
 
 
344 aa  52  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.33 
 
 
268 aa  51.6  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 
363 aa  51.6  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  27.21 
 
 
275 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
273 aa  51.6  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  28.38 
 
 
251 aa  51.6  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  33.08 
 
 
255 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  32.94 
 
 
273 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  32.94 
 
 
273 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  31.86 
 
 
263 aa  50.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.04 
 
 
251 aa  49.7  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  31.93 
 
 
335 aa  49.7  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  23.08 
 
 
285 aa  49.7  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4785  Methyltransferase type 11  35.37 
 
 
267 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  32.17 
 
 
255 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
265 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1442  methyltransferase type 11  27.91 
 
 
176 aa  48.9  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0423534  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  30.56 
 
 
307 aa  49.3  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  30.32 
 
 
305 aa  49.3  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3480  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.3 
 
 
438 aa  49.3  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2245  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 
197 aa  48.9  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0720  hypothetical protein  26.55 
 
 
234 aa  48.9  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  30.25 
 
 
276 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  48.44 
 
 
302 aa  48.9  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  26.58 
 
 
232 aa  48.5  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2339  methyltransferase type 11  30.91 
 
 
191 aa  48.5  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.755854  normal  0.422901 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 
295 aa  48.5  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0254  methyltransferase type 11  25.74 
 
 
230 aa  48.5  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.753586 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14451  SAM-dependent methyltransferase  21.15 
 
 
223 aa  48.5  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  30.13 
 
 
265 aa  48.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  38.89 
 
 
279 aa  48.1  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 
262 aa  48.1  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.24 
 
 
265 aa  47.4  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>