More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3612 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
276 aa  537  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.77 
 
 
377 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  34.94 
 
 
275 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  34.94 
 
 
275 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  34.94 
 
 
275 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  31.6 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  34.54 
 
 
275 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  34.54 
 
 
275 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.14 
 
 
275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  36.94 
 
 
275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  34.14 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.84 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  34.94 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  34.14 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  32.16 
 
 
273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.84 
 
 
290 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
273 aa  125  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
266 aa  125  8.000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.65 
 
 
279 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
255 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2146  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.58 
 
 
315 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
255 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  29.67 
 
 
284 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  29.67 
 
 
284 aa  122  9e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  29.67 
 
 
284 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 
308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.589472  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  33.47 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0213  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.15 
 
 
252 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.92 
 
 
277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1391  NO3-/NO2- ABC transporter  31.56 
 
 
305 aa  118  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  34.21 
 
 
274 aa  118  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  31.8 
 
 
285 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21600  aliphatic sulfonates ABC transporter, inner membrane component  32.17 
 
 
284 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.577279 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
536 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
532 aa  117  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6545  ABC transporter permease  32.07 
 
 
269 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.276106 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  34.88 
 
 
274 aa  116  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3523  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.17 
 
 
309 aa  115  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.26 
 
 
271 aa  115  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  34.78 
 
 
274 aa  115  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02450  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  33.86 
 
 
289 aa  115  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458789  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.35 
 
 
279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 
273 aa  115  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5011  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.37 
 
 
286 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.312092  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
276 aa  115  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.23 
 
 
264 aa  115  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4958  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.37 
 
 
285 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.165118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.64 
 
 
294 aa  115  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0208  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  33.04 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.473726 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.32 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.62 
 
 
288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4495  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.37 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.77 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5896  nitrate ABC transporter permease protein  31.28 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149001  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  34.04 
 
 
277 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2555  nitrate transport permease  32.42 
 
 
314 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162104  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0673  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.18 
 
 
275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0666321  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1283  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  31.8 
 
 
252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0507526 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.9 
 
 
279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3160  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.89 
 
 
274 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.913146  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.3 
 
 
279 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
282 aa  112  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3153  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  31.52 
 
 
303 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
303 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.451363  normal  0.0367857 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  32.47 
 
 
253 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  32.47 
 
 
283 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  32.47 
 
 
285 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2104  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.75 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0291571  normal  0.0240092 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321257  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  28.41 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3842  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.78 
 
 
331 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  32.74 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  32.74 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0998  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.74 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.944594 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.41 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3526  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.15 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.471487 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  32.74 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4471  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.17 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.5689 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.88 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1439  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.06 
 
 
310 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.062597  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.61 
 
 
279 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 
257 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0257  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35 
 
 
283 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738144 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1704  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.66 
 
 
311 aa  110  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0236  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35 
 
 
283 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0380  putative nitrate transmembrane ABC transporter protein  33 
 
 
287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.931268 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2515  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.48 
 
 
282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313862  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.64 
 
 
441 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0502009  hitchhiker  0.0000630788 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0159  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.89 
 
 
253 aa  109  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3268  nitrate transport permease  33.17 
 
 
328 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321419  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0164  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.89 
 
 
253 aa  109  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>