More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2575 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0916  microcin-processing peptidase 1  98.66 
 
 		 447 aa  867    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0214325  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  90.16 
 
 		 463 aa  738    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.382298  normal  0.100895 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2575  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 447 aa  879    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336858 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0064  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  69.2 
 
 		 448 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.669376  hitchhiker  0.000186098 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  63.98 
 
 		 473 aa  558  1e-158  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0403  microcin-processing peptidase 1  64.17 
 
 		 449 aa  509  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0481166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2687  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  62.18 
 
 		 450 aa  466  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  47.86 
 
 		 465 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1852  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  48.65 
 
 		 465 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405759  decreased coverage  0.000697877 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  45.41 
 
 		 468 aa  363  3e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1346  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  48.65 
 
 		 465 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200432  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  47.53 
 
 		 479 aa  361  2e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1687  putative Zn-dependent protease, pmbA-like protein  48.21 
 
 		 464 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4708  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  49.21 
 
 		 465 aa  349  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3182  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  46.98 
 
 		 463 aa  348  9e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167211  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0575  microcin-processing peptidase 1  46.79 
 
 		 452 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.580246  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1785  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  46.53 
 
 		 442 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179483  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3042  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.76 
 
 		 456 aa  307  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0903  PmbA/TldD related protein  43.02 
 
 		 448 aa  304  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0191  pmbA protein  42.98 
 
 		 447 aa  301  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0310  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.73 
 
 		 446 aa  300  3e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108287 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0211  pmbA protein  42.76 
 
 		 447 aa  300  4e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2361  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  44.6 
 
 		 448 aa  300  5e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0294  microcin-processing peptidase 1  44.5 
 
 		 448 aa  294  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0485  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.18 
 
 		 448 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0434  microcin-processing peptidase 1  43.24 
 
 		 445 aa  283  6.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.05 
 
 		 448 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.334504 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0421  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.91 
 
 		 448 aa  282  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0569  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.72 
 
 		 447 aa  281  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.289965 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1208  TldD/PmbA family protein  38.53 
 
 		 443 aa  279  7e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.99051  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.81 
 
 		 448 aa  278  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2323  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.78 
 
 		 469 aa  275  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118827  normal  0.680287 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4534  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.41 
 
 		 443 aa  273  4.0000000000000004e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.333963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.35 
 
 		 456 aa  272  7e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0639  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.96 
 
 		 453 aa  270  2.9999999999999997e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  38.43 
 
 		 447 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1053  microcin-processing peptidase 1  39.82 
 
 		 486 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0971  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.82 
 
 		 469 aa  263  6e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0235752  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4261  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.41 
 
 		 481 aa  262  8e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2079  microcin-processing peptidase 1  39.21 
 
 		 485 aa  260  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0600  pmbA protein  40.13 
 
 		 448 aa  257  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0753  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.13 
 
 		 448 aa  257  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0158404 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1984  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.27 
 
 		 457 aa  257  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.189239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1385  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.92 
 
 		 469 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000808939  normal  0.0131442 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0413  microcin-processing peptidase 1  37.14 
 
 		 452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0570132  normal  0.116989 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1735  hypothetical protein  34.57 
 
 		 452 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1735  hypothetical protein  34.57 
 
 		 452 aa  252  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0887  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.73 
 
 		 457 aa  252  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0527  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.56 
 
 		 448 aa  251  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3287  microcin-processing peptidase 1  38 
 
 		 476 aa  250  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1274  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.97 
 
 		 448 aa  249  6e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.277535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2887  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.44 
 
 		 468 aa  249  7e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2836  PmbA protein  38.62 
 
 		 455 aa  248  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0390  microcin-processing peptidase 1  33.1 
 
 		 444 aa  247  4e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.248859  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2415  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.44 
 
 		 452 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0584  microcin-processing peptidase 1  38.1 
 
 		 432 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000109453  normal  0.168168 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0816  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.06 
 
 		 457 aa  246  8e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0865  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.1 
 
 		 448 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.619374  normal  0.968432 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2570  microcin-processing peptidase 1  39.82 
 
 		 455 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  34.27 
 
 		 460 aa  244  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.19 
 
 		 455 aa  242  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0383  pmbA protein  37.72 
 
 		 444 aa  241  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.976724  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0847  microcin-processing peptidase 1  36.32 
 
 		 448 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0650  pmbA protein  32.25 
 
 		 448 aa  241  2e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.501682  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0193  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.48 
 
 		 441 aa  239  8e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26115  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1223  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.75 
 
 		 474 aa  239  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  35.47 
 
 		 450 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04103  predicted peptidase required for the maturation and secretion of the antibiotic peptide MccB17  35.88 
 
 		 450 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4463  pmbA protein  35.87 
 
 		 448 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0853906  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04067  hypothetical protein  35.88 
 
 		 450 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.55 
 
 		 450 aa  237  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0911  microcin-processing peptidase 1  38.62 
 
 		 460 aa  237  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5754  peptidase PmbA  35.55 
 
 		 446 aa  237  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4818  peptidase PmbA  35.78 
 
 		 446 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4488  peptidase PmbA  35.55 
 
 		 446 aa  237  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4838  peptidase PmbA  35.78 
 
 		 446 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4849  peptidase PmbA  35.55 
 
 		 446 aa  237  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4805  peptidase PmbA  35.55 
 
 		 446 aa  237  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4688  peptidase PmbA  35.78 
 
 		 446 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.358914 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2264  microcin-processing peptidase 1  38.88 
 
 		 434 aa  237  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4713  peptidase PmbA  35.88 
 
 		 450 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4783  peptidase PmbA  35.78 
 
 		 446 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.137949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01893  PmbA  36.7 
 
 		 455 aa  236  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1234  pmbA protein  33.65 
 
 		 444 aa  236  8e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4720  peptidase PmbA  35.55 
 
 		 446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3776  peptidase PmbA  35.42 
 
 		 450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4384  peptidase PmbA  34.53 
 
 		 446 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0267  peptidase PmbA  35.78 
 
 		 446 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0945  putative PMBA protein (tlde protein)  39.96 
 
 		 457 aa  233  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0171463 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2133  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.56 
 
 		 448 aa  233  5e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0949  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.02 
 
 		 448 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0982  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.79 
 
 		 448 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03671  peptidase PmbA  34.3 
 
 		 447 aa  232  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0942  pmbA protein  35.79 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4154  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.24 
 
 		 448 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2148  microcin-processing peptidase 1  35.79 
 
 		 446 aa  232  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002397  PmbA protein  34.3 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0275  peptidase PmbA  35.78 
 
 		 446 aa  230  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00273  pmbA protein  34.23 
 
 		 443 aa  230  5e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3663  peptidase PmbA  36.19 
 
 		 446 aa  229  6e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>