43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4154 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4154  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  161  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  35.21 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4302  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 79 aa  50.4  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.397769  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01120  hypothetical protein  35.48 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4798  transcriptional regulator  43.1 
 
 		 222 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124269  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1447  putative transcription regulator protein  43.1 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 513 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2898  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0914  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 213 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2272  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.71 
 
 		 201 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306888  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1618  putative DNA-binding protein  38.98 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03585  transcriptional regulator  35.14 
 
 		 206 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0285  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.17528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1361  EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)  37.5 
 
 		 516 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419571  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2581  DNA-binding protein  30.49 
 
 		 209 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03330  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.312142  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3353  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 513 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  43.64 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000053147  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1915  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.799088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36660  predicted transcriptional regulator with C-terminal CBS domains  41.82 
 
 		 293 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0372485  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 72 aa  42  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1419  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 64 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 188 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  40.35 
 
 		 508 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 252 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0204  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2410  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000774173  normal  0.481646 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9055  hypothetical protein  37.31 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142837  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3687  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2208  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0421873 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 198 aa  40.4  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1722  helix-turn-helix domain-containing protein  46.3 
 
 		 204 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5469  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 215 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0381278  normal  0.011752 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1311  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  47.73 
 
 		 273 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  36.21 
 
 		 178 aa  40.4  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003247  putative transcription regulator protein  31.94 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 503 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>