78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1311 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1311  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  100 
 
 		 273 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05270  predicted transcriptional regulator  45 
 
 		 68 aa  52  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0591  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 68 aa  48.9  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0408  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 63 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0169  Cro/CI family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 68 aa  47.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0106537  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0590  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 64 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4855  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 73 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  44.44 
 
 		 508 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  40 
 
 		 65 aa  46.2  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5730  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 239 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0741  DNA-binding protein  41.38 
 
 		 72 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153081 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 71 aa  46.2  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 74 aa  45.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4895  DNA-binding protein  35 
 
 		 73 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  40 
 
 		 377 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2164  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 75 aa  45.8  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.27184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0597  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 75 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0686  DNA-binding protein  41.38 
 
 		 72 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000669096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5139  DNA-binding protein  35 
 
 		 73 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2496  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 69 aa  45.4  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294217  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0753  DNA-binding protein  41.38 
 
 		 75 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389457  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0142  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 91 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0927186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3164  helix-turn-helix domain-containing protein  37.93 
 
 		 83 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0375363 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0954  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 63 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0197  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 80 aa  45.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243983  normal  0.255658 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5184  DNA-binding protein  35 
 
 		 73 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5175  DNA-binding protein  35 
 
 		 73 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4619  DNA-binding protein  39.66 
 
 		 72 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.985933  normal  0.0107743 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0652  DNA-binding protein  41.38 
 
 		 75 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5270  DNA-binding protein  35 
 
 		 79 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0596  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 75 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.128395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4739  DNA-binding protein  35 
 
 		 73 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4758  DNA-binding protein  35 
 
 		 73 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0571449  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3817  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 72 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00145193  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 69 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5169  DNA-binding protein  35 
 
 		 79 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 69 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 69 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 69 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 69 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0717  DNA-binding protein  39.66 
 
 		 72 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 69 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 69 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0989  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 67 aa  44.3  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.214292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 65 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0189  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 65 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 66 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  36.21 
 
 		 66 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2033  hypothetical protein  38.33 
 
 		 64 aa  43.9  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5748  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 219 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  36.21 
 
 		 66 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  36.21 
 
 		 66 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  36.21 
 
 		 66 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  36.21 
 
 		 66 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 66 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  36.21 
 
 		 67 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  36.21 
 
 		 66 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 66 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2664  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 83 aa  43.5  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.406995 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3681  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 109 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 69 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0813  DNA-binding protein  39.66 
 
 		 72 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.371509  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 72 aa  43.5  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4366  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 101 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0270567  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4304  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 80 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4871  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 101 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4519  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 101 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 80 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 67 aa  43.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0427  transcriptional regulator  30 
 
 		 66 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.423701  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1472  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 69 aa  42.7  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 503 aa  42.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  31.67 
 
 		 69 aa  42.7  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3578  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 140 aa  42.7  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2467  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 109 aa  42.7  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0444  XRE family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 529 aa  42.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 67 aa  42  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0363  transcriptional regulator  35 
 
 		 68 aa  42  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>