97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2901 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2901  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 		 212 aa  428  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1497  putative outer membrane lipoprotein carrier protein  90.09 
 
 		 212 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0146  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  90.09 
 
 		 212 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.193487 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  65.66 
 
 		 198 aa  265  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560514  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0061  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  62.72 
 
 		 198 aa  214  9e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0207527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0429  twin-arginine translocation pathway signal  55.91 
 
 		 203 aa  212  3.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0058  outer membrane lipoprotein carrier protein  51.83 
 
 		 234 aa  192  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000236321 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1299  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.71 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5008  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.64 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3234  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.99 
 
 		 216 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1840  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.53 
 
 		 312 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0335702  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.54 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3748  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.53 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0297901  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0084  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.29 
 
 		 339 aa  99.4  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296297  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3767  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.94 
 
 		 222 aa  99.4  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.796035 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0417  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.55 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656484  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4235  possible lolA type protein  33.33 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0329  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.52 
 
 		 227 aa  96.7  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0134  hypothetical protein  32.95 
 
 		 257 aa  94  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2892  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.97 
 
 		 332 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3116  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.76 
 
 		 223 aa  92  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2670  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.77 
 
 		 206 aa  91.7  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0445  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.74 
 
 		 268 aa  91.3  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0961015  normal  0.0287558 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4515  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.42 
 
 		 314 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal  0.254845 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4033  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.42 
 
 		 315 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0396564 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4403  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.42 
 
 		 315 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271262  normal  0.226597 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3698  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.98 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3053  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.16 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4909  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.97 
 
 		 313 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.296324  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2946  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.879784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0378  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.71 
 
 		 317 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0443  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.14 
 
 		 315 aa  88.6  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0094  LolA family protein  30.65 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2541  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.54 
 
 		 207 aa  85.1  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423269  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3189  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.19 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0961  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.9 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0277  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.29 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.012946  normal  0.130604 
 
 
-
 
NC_004310  BR2003  hypothetical protein  32.53 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1926  hypothetical protein  31.93 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0283  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.37 
 
 		 313 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111335  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0119  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.96 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256615  normal  0.030366 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.78 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2435  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.12 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.699017  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1281  outer-membrane lipoproteins carrier protein  24.2 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.866532  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1342  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.2 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0710  hypothetical protein  26.04 
 
 		 171 aa  54.3  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.744618  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1497  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.93 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.540106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30310  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.24 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2594  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.38 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2003  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.58 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0765  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.71 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0575497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0547  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.71 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.117593  hitchhiker  0.000046415 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0377  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA, putative  31.71 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1729  hypothetical protein  24.71 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1729  hypothetical protein  24.12 
 
 		 202 aa  48.9  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28210  outer-membrane lipoprotein carrier protein  29.29 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372853  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2151  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.39 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100483  normal  0.437177 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5362  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.9 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1286  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.75 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1760  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.81 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1571  outer membrane lipoprotein carrier  23.19 
 
 		 233 aa  45.8  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.199657  normal  0.807566 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1711  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.41 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113541  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1125  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.56 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2555  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.9 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.442107  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0757  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.32 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000775377 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3210  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.9 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.378959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3407  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.8 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3425  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.74 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936296  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3178  outer-membrane lipoprotein carrier protein  27.66 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308735  normal  0.0497193 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3348  outer membrane lipoprotein carrier protein  27.66 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00496768  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2387  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.19 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0116989 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2599  outer-membrane lipoprotein carrier protein  27.35 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4003  outer-membrane lipoprotein carrier protein  28.44 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0440839  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0814  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.58 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000179338  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2340  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.3 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1753  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.79 
 
 		 233 aa  42.4  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0975512  normal  0.0644178 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1518  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.23 
 
 		 273 aa  42.4  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1869  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.47 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06126  outer-membrane lipoprotein carrier protein  36.78 
 
 		 216 aa  42.4  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1053  hypothetical protein  18.75 
 
 		 193 aa  42.4  0.006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0568151  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1121  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.87 
 
 		 203 aa  42  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.310503  normal  0.176319 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1830  outer-membrane lipoprotein carrier protein  27.66 
 
 		 207 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153108 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3608  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.6 
 
 		 207 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01040  outer-membrane lipoprotein carrier protein  36.78 
 
 		 216 aa  42.4  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.331194  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0686  outer-membrane lipoprotein carrier protein  27 
 
 		 214 aa  41.6  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal  0.650962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3585  outer-membrane lipoprotein carrier protein  30.43 
 
 		 206 aa  41.6  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2705  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.27 
 
 		 203 aa  41.6  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0180788  normal  0.777132 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2229  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.27 
 
 		 203 aa  41.6  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.583755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0966  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.27 
 
 		 203 aa  41.6  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.015889  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0996  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.27 
 
 		 203 aa  41.6  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00638939  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2437  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.27 
 
 		 203 aa  41.6  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0718725  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2719  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.57 
 
 		 212 aa  41.2  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.72131  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1053  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.27 
 
 		 203 aa  41.6  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0514291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00902  hypothetical protein  25.27 
 
 		 204 aa  41.2  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2752  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.27 
 
 		 203 aa  41.6  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000100398  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00895  outer-membrane lipoprotein carrier protein precursor  25.27 
 
 		 204 aa  41.2  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.169529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>