55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0329 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0329  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 		 227 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014302 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0445  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  76.8 
 
 		 268 aa  299  3e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0961015  normal  0.0287558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3748  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  49.75 
 
 		 302 aa  202  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0297901  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2892  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  52.3 
 
 		 332 aa  201  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4909  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  51.79 
 
 		 313 aa  198  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.296324  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4033  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  50.81 
 
 		 315 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0396564 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4403  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  51.37 
 
 		 315 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271262  normal  0.226597 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4515  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  54.17 
 
 		 314 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal  0.254845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0134  hypothetical protein  47.37 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0378  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  46.01 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  42.22 
 
 		 339 aa  176  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296297  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0277  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  49.67 
 
 		 280 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.012946  normal  0.130604 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0443  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  42.94 
 
 		 315 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0084  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  41.24 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1840  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.38 
 
 		 312 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0335702  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0283  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  45.91 
 
 		 313 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111335  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3767  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  41.62 
 
 		 222 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.796035 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  41.04 
 
 		 222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3234  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.2 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1926  hypothetical protein  35.05 
 
 		 258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4235  possible lolA type protein  40.48 
 
 		 220 aa  135  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1299  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  39.53 
 
 		 243 aa  134  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_004310  BR2003  hypothetical protein  34.58 
 
 		 230 aa  134  9e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0961  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.58 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3053  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.26 
 
 		 220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0094  LolA family protein  37.41 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2946  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.68 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.879784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1497  putative outer membrane lipoprotein carrier protein  32.57 
 
 		 212 aa  99  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0146  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.57 
 
 		 212 aa  99  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.193487 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2901  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.52 
 
 		 212 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3698  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.05 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0417  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.21 
 
 		 206 aa  94  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656484  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3116  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.41 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5008  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.08 
 
 		 212 aa  93.2  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.17 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560514  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0429  twin-arginine translocation pathway signal  28.65 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0061  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.37 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0207527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0058  outer membrane lipoprotein carrier protein  28.16 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000236321 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2670  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.75 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2541  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.48 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423269  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3189  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.27 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.59 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1571  outer membrane lipoprotein carrier  28.57 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.199657  normal  0.807566 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1753  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.76 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0975512  normal  0.0644178 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1053  hypothetical protein  25.69 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0568151  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0547  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.34 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.117593  hitchhiker  0.000046415 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0377  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA, putative  26.34 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0348  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.44 
 
 		 236 aa  48.5  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1296  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.15 
 
 		 208 aa  48.5  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.95 
 
 		 223 aa  45.8  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.632485  normal  0.483182 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1394  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.02 
 
 		 208 aa  45.8  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0119  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.01 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256615  normal  0.030366 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1125  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.43 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1711  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.33 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113541  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6863  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.08 
 
 		 258 aa  42.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0520741 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>