53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2669 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 		 198 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560514  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2901  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  67.05 
 
 		 212 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1497  putative outer membrane lipoprotein carrier protein  65.34 
 
 		 212 aa  242  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0146  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  65.34 
 
 		 212 aa  242  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.193487 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0061  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  59.52 
 
 		 198 aa  215  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0207527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0429  twin-arginine translocation pathway signal  48.7 
 
 		 203 aa  199  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0058  outer membrane lipoprotein carrier protein  42.02 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000236321 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1299  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.84 
 
 		 243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0417  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.57 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656484  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.13 
 
 		 222 aa  99.4  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5008  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.75 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3767  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.53 
 
 		 222 aa  95.9  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.796035 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2541  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.71 
 
 		 207 aa  95.5  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423269  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3234  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.74 
 
 		 216 aa  95.1  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2670  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.24 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1840  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.03 
 
 		 312 aa  94  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0335702  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3189  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.33 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.71 
 
 		 339 aa  91.3  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296297  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4235  possible lolA type protein  34.13 
 
 		 220 aa  90.9  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0084  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.84 
 
 		 258 aa  88.2  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0094  LolA family protein  28.08 
 
 		 210 aa  88.2  8e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2003  hypothetical protein  32.61 
 
 		 230 aa  87.8  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2946  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.21 
 
 		 221 aa  87.4  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.879784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3053  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.18 
 
 		 220 aa  86.3  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1926  hypothetical protein  31.52 
 
 		 258 aa  86.3  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3698  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.36 
 
 		 221 aa  85.9  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0961  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.28 
 
 		 230 aa  84.7  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3116  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.66 
 
 		 223 aa  84.7  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0443  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.84 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0134  hypothetical protein  31.36 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0378  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.28 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0329  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.17 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014302 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4403  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35 
 
 		 315 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271262  normal  0.226597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4033  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35 
 
 		 315 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0396564 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3748  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.13 
 
 		 302 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0297901  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4515  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35 
 
 		 314 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal  0.254845 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4909  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.97 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.296324  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0445  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.48 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0961015  normal  0.0287558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2892  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.74 
 
 		 332 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0283  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.71 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111335  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0277  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.46 
 
 		 280 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.012946  normal  0.130604 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0119  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.08 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256615  normal  0.030366 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0710  hypothetical protein  22.7 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.744618  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.78 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1296  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.6 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1286  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.19 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0547  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.97 
 
 		 230 aa  41.6  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.117593  hitchhiker  0.000046415 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5362  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.26 
 
 		 211 aa  41.6  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0377  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA, putative  30.97 
 
 		 230 aa  41.6  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1711  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.33 
 
 		 214 aa  41.2  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113541  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06126  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.88 
 
 		 216 aa  41.2  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01040  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.88 
 
 		 216 aa  41.2  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.331194  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1760  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.12 
 
 		 216 aa  41.2  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.889402 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>