82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3116 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3116  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 		 223 aa  448  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0417  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  48.15 
 
 		 206 aa  154  8e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656484  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3698  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  44.25 
 
 		 221 aa  151  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1840  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.35 
 
 		 312 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0335702  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2946  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.7 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.879784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4909  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.36 
 
 		 313 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.296324  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2892  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.94 
 
 		 332 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.99 
 
 		 222 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0329  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.38 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014302 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3767  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.33 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.796035 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3053  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.21 
 
 		 220 aa  104  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4403  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.06 
 
 		 315 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271262  normal  0.226597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3748  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.26 
 
 		 302 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0297901  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.84 
 
 		 339 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296297  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4033  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.93 
 
 		 315 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0396564 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4515  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.93 
 
 		 314 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal  0.254845 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.66 
 
 		 198 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560514  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2901  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.59 
 
 		 212 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1497  putative outer membrane lipoprotein carrier protein  37.27 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0084  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.33 
 
 		 258 aa  102  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0146  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.27 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.193487 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0119  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  39.74 
 
 		 202 aa  101  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256615  normal  0.030366 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0443  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.74 
 
 		 315 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1299  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.57 
 
 		 243 aa  99.8  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4235  possible lolA type protein  32.89 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0134  hypothetical protein  30.54 
 
 		 257 aa  95.5  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5008  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.73 
 
 		 212 aa  95.1  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0445  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.54 
 
 		 268 aa  94.7  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0961015  normal  0.0287558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0378  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.26 
 
 		 317 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0277  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.55 
 
 		 280 aa  91.7  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.012946  normal  0.130604 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3234  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.26 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1926  hypothetical protein  31.41 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0429  twin-arginine translocation pathway signal  34.23 
 
 		 203 aa  91.3  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2003  hypothetical protein  28.79 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0283  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.42 
 
 		 313 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111335  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0961  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.54 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0058  outer membrane lipoprotein carrier protein  34.25 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000236321 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0061  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.15 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0207527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2670  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.05 
 
 		 206 aa  84.7  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0094  LolA family protein  30.13 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2541  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.93 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423269  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3189  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.86 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30310  outer-membrane lipoprotein carrier protein  33.51 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2594  outer-membrane lipoprotein carrier protein  33.51 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28210  outer-membrane lipoprotein carrier protein  31.47 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372853  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0757  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.64 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000775377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2387  outer-membrane lipoprotein carrier protein  31.31 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0116989 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0547  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.68 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.117593  hitchhiker  0.000046415 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0377  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA, putative  31.68 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3178  outer-membrane lipoprotein carrier protein  31.61 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308735  normal  0.0497193 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.57 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2003  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.05 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3348  outer membrane lipoprotein carrier protein  31.03 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00496768  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1121  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.01 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.310503  normal  0.176319 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0710  hypothetical protein  30.6 
 
 		 171 aa  54.3  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.744618  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1296  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.12 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3585  outer-membrane lipoprotein carrier protein  30.41 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2435  outer-membrane lipoprotein carrier protein  28.73 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.699017  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3407  outer-membrane lipoprotein carrier protein  28.04 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0765  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.11 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0575497  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1765  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.62 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.455724  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4003  outer-membrane lipoprotein carrier protein  28.49 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0440839  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0088  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.29 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.700906  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1830  outer-membrane lipoprotein carrier protein  28.49 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153108 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3608  outer-membrane lipoprotein carrier protein  28.49 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1518  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.58 
 
 		 273 aa  45.4  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1729  hypothetical protein  29.82 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1125  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.07 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1729  hypothetical protein  29.82 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0178  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.87 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0106  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.4 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0095  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.4 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.57 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.632485  normal  0.483182 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1342  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.61 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1281  outer-membrane lipoproteins carrier protein  32.61 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.866532  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1711  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.11 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113541  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3210  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.59 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.378959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0706  outer-membrane lipoprotein carrier protein  29.73 
 
 		 214 aa  42.4  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3425  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.89 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936296  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5362  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.31 
 
 		 211 aa  42  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1826  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.36 
 
 		 219 aa  41.6  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119174  hitchhiker  0.00000680848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1574  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.07 
 
 		 219 aa  41.6  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.057142  normal  0.0500809 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>