76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0417 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0417  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 
206 aa  421  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656484  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3116  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  48.15 
 
 
223 aa  141  8e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3698  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  39.39 
 
 
221 aa  122  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1299  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.74 
 
 
243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2946  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.24 
 
 
221 aa  105  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.879784  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.57 
 
 
198 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560514  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0429  twin-arginine translocation pathway signal  32.83 
 
 
203 aa  102  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0084  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.57 
 
 
258 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0134  hypothetical protein  36.25 
 
 
257 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.3 
 
 
339 aa  99.4  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296297  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0146  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.76 
 
 
212 aa  99  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.193487 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1497  putative outer membrane lipoprotein carrier protein  35.76 
 
 
212 aa  99  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3767  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.04 
 
 
222 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.796035 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2901  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.55 
 
 
212 aa  97.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.25 
 
 
222 aa  95.5  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0961  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.54 
 
 
230 aa  95.1  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3053  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.65 
 
 
220 aa  93.2  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661457  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0329  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.21 
 
 
227 aa  93.6  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014302 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4033  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.76 
 
 
315 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0396564 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3748  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.18 
 
 
302 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0297901  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4403  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.76 
 
 
315 aa  92  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271262  normal  0.226597 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4235  possible lolA type protein  30.3 
 
 
220 aa  92  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1926  hypothetical protein  32.92 
 
 
258 aa  92  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0378  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.95 
 
 
317 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0443  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.26 
 
 
315 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_004310  BR2003  hypothetical protein  30.89 
 
 
230 aa  91.3  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1840  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.95 
 
 
312 aa  91.3  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0335702  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4515  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.77 
 
 
314 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal  0.254845 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0061  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.77 
 
 
198 aa  89.4  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0207527  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3234  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.08 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4909  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.54 
 
 
313 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.296324  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2892  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.4 
 
 
332 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0445  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.62 
 
 
268 aa  85.9  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0961015  normal  0.0287558 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0119  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.53 
 
 
202 aa  84  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256615  normal  0.030366 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5008  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.36 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0283  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.46 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111335  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0277  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.25 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.012946  normal  0.130604 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0058  outer membrane lipoprotein carrier protein  30.95 
 
 
234 aa  77  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000236321 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2541  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.77 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423269  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2670  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.09 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0094  LolA family protein  27.68 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3189  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.38 
 
 
228 aa  63.2  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0710  hypothetical protein  30.36 
 
 
171 aa  62.4  0.000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.744618  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0765  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.96 
 
 
217 aa  62.4  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0575497  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1296  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.82 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0846  hypothetical protein  21.39 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1518  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.07 
 
 
273 aa  56.6  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1053  hypothetical protein  19.89 
 
 
193 aa  56.2  0.0000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0568151  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.17 
 
 
208 aa  56.2  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0377  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA, putative  26.14 
 
 
230 aa  52.4  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0547  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.14 
 
 
230 aa  52.4  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.117593  hitchhiker  0.000046415 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1729  hypothetical protein  29.59 
 
 
202 aa  50.1  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1729  hypothetical protein  29.59 
 
 
202 aa  49.3  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0178  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28 
 
 
207 aa  48.9  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1753  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35 
 
 
233 aa  48.5  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0975512  normal  0.0644178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28210  outer-membrane lipoprotein carrier protein  33.67 
 
 
207 aa  48.5  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372853  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0757  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.82 
 
 
212 aa  48.5  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000775377 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30310  outer-membrane lipoprotein carrier protein  32.8 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1281  outer-membrane lipoproteins carrier protein  25.99 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.866532  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1342  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.99 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1121  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.32 
 
 
203 aa  46.2  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.310503  normal  0.176319 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1571  outer membrane lipoprotein carrier  34 
 
 
233 aa  45.8  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.199657  normal  0.807566 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2594  outer-membrane lipoprotein carrier protein  32 
 
 
208 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0348  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.84 
 
 
236 aa  45.4  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1765  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.28 
 
 
219 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.455724  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0686  outer-membrane lipoprotein carrier protein  28.49 
 
 
214 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal  0.650962 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1125  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.86 
 
 
205 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5362  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.4 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.93 
 
 
223 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.632485  normal  0.483182 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2387  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25 
 
 
208 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0116989 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1286  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.07 
 
 
210 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3407  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.07 
 
 
211 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3178  outer-membrane lipoprotein carrier protein  31.13 
 
 
207 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308735  normal  0.0497193 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1711  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.67 
 
 
214 aa  42.4  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113541  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1497  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.94 
 
 
202 aa  41.6  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.540106  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0088  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.26 
 
 
228 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.700906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>