24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0710 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0710  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  353  7.999999999999999e-97  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.744618  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0417  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.36 
 
 
206 aa  62.4  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656484  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.01 
 
 
339 aa  57.4  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296297  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2901  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.31 
 
 
212 aa  54.3  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0084  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.63 
 
 
258 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0146  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.32 
 
 
212 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.193487 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.7 
 
 
198 aa  53.9  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560514  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0429  twin-arginine translocation pathway signal  23.43 
 
 
203 aa  53.9  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1497  putative outer membrane lipoprotein carrier protein  26.32 
 
 
212 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1926  hypothetical protein  23.81 
 
 
258 aa  52.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2946  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.74 
 
 
221 aa  50.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.879784  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0061  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.7 
 
 
198 aa  49.3  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0207527  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2003  hypothetical protein  23.53 
 
 
230 aa  48.5  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0058  outer membrane lipoprotein carrier protein  25.58 
 
 
234 aa  48.5  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000236321 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0961  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.2 
 
 
230 aa  48.5  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0443  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.12 
 
 
315 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3116  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.21 
 
 
223 aa  47.4  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0378  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.12 
 
 
317 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4235  possible lolA type protein  24.05 
 
 
220 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0134  hypothetical protein  29.41 
 
 
257 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1299  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.12 
 
 
243 aa  43.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0283  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.56 
 
 
313 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111335  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4909  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.93 
 
 
313 aa  40.8  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.296324  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1840  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.69 
 
 
312 aa  40.8  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0335702  normal  0.659808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>