53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4403 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4403  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 		 315 aa  624  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271262  normal  0.226597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4033  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  99.37 
 
 		 315 aa  619  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0396564 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4515  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  87.3 
 
 		 314 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal  0.254845 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3748  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  64.78 
 
 		 302 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0297901  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2892  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  58.49 
 
 		 332 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4909  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  58.33 
 
 		 313 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.296324  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0445  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  55.95 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0961015  normal  0.0287558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0329  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  53.57 
 
 		 227 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1840  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  44.93 
 
 		 312 aa  185  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0335702  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0134  hypothetical protein  44.25 
 
 		 257 aa  172  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0378  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  46.93 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  45.14 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296297  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0443  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  45.14 
 
 		 315 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0277  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  50 
 
 		 280 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.012946  normal  0.130604 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0084  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  44.51 
 
 		 258 aa  165  8e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0283  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  47.85 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111335  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3234  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  39.26 
 
 		 216 aa  136  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3053  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  41.32 
 
 		 220 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3767  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  41.21 
 
 		 222 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.796035 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1299  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  44.44 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1926  hypothetical protein  38.6 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  40.61 
 
 		 222 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2003  hypothetical protein  38.14 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4235  possible lolA type protein  39.13 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0961  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  40.49 
 
 		 230 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2946  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.06 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.879784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0094  LolA family protein  36.81 
 
 		 210 aa  116  6e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1497  putative outer membrane lipoprotein carrier protein  37.72 
 
 		 212 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0146  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.72 
 
 		 212 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.193487 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3698  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.56 
 
 		 221 aa  94.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0417  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.77 
 
 		 206 aa  92.8  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656484  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2901  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.53 
 
 		 212 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3116  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.06 
 
 		 223 aa  87.8  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5008  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.91 
 
 		 212 aa  87  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0429  twin-arginine translocation pathway signal  36.31 
 
 		 203 aa  86.3  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.19 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560514  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2670  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.49 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0058  outer membrane lipoprotein carrier protein  30.81 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000236321 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2541  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.19 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423269  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3189  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.79 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0061  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.1 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0207527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0846  hypothetical protein  24.53 
 
 		 193 aa  55.5  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1125  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.42 
 
 		 205 aa  51.6  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30310  outer-membrane lipoprotein carrier protein  33.33 
 
 		 208 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1518  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.96 
 
 		 273 aa  50.1  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.74 
 
 		 208 aa  49.7  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2594  outer-membrane lipoprotein carrier protein  32.22 
 
 		 208 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1053  hypothetical protein  22.36 
 
 		 193 aa  46.6  0.0005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0568151  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0348  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.4 
 
 		 236 aa  43.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1711  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.47 
 
 		 214 aa  43.1  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113541  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.65 
 
 		 223 aa  43.1  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.632485  normal  0.483182 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0119  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.44 
 
 		 202 aa  42.4  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256615  normal  0.030366 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1296  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.58 
 
 		 208 aa  42.4  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.435605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>