55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0058 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0058  outer membrane lipoprotein carrier protein  100 
 
 		 234 aa  470  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000236321 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2901  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  52.87 
 
 		 212 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1497  putative outer membrane lipoprotein carrier protein  50.57 
 
 		 212 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0146  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  50.57 
 
 		 212 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.193487 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0429  twin-arginine translocation pathway signal  43 
 
 		 203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0061  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  49.7 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0207527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  42.02 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560514  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5008  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  40.51 
 
 		 212 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1299  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.59 
 
 		 243 aa  96.3  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.29 
 
 		 339 aa  89.7  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296297  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0084  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.3 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2946  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.95 
 
 		 221 aa  86.3  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.879784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0134  hypothetical protein  30.49 
 
 		 257 aa  85.5  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.52 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2670  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.02 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1840  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.49 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0335702  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3053  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.64 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3767  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.31 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.796035 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0417  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.95 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656484  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3234  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.01 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2541  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.12 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423269  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4235  possible lolA type protein  28.92 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3116  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.25 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3189  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3698  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.8 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0445  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.52 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0961015  normal  0.0287558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3748  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.72 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0297901  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0277  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.86 
 
 		 280 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.012946  normal  0.130604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2892  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.3 
 
 		 332 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0443  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.89 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0378  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.05 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0329  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.16 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014302 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0094  LolA family protein  24.75 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4403  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.81 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271262  normal  0.226597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4033  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.81 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0396564 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4515  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.06 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal  0.254845 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4909  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.43 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.296324  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1926  hypothetical protein  26.32 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0283  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.01 
 
 		 313 aa  65.5  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111335  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2003  hypothetical protein  26.38 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0961  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.7 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5362  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.21 
 
 		 211 aa  52  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0710  hypothetical protein  25.58 
 
 		 171 aa  48.5  0.00009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.744618  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.87 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1281  outer-membrane lipoproteins carrier protein  24.12 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.866532  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1729  hypothetical protein  24.28 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1729  hypothetical protein  24.14 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0706  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.71 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1053  hypothetical protein  23.96 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0568151  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0765  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.47 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0575497  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1342  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.53 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0846  hypothetical protein  26.8 
 
 		 193 aa  43.5  0.003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0795  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.52 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111148  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01040  outer-membrane lipoprotein carrier protein  32.18 
 
 		 216 aa  41.6  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.331194  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06126  outer-membrane lipoprotein carrier protein  32.18 
 
 		 216 aa  41.6  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>