56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0277 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0277  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 		 280 aa  556  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.012946  normal  0.130604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0134  hypothetical protein  71.6 
 
 		 257 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0443  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  69.47 
 
 		 315 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0378  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  67.79 
 
 		 317 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  70.54 
 
 		 339 aa  345  4e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296297  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0084  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  59.54 
 
 		 258 aa  310  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0283  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  77.56 
 
 		 313 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111335  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1840  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  57.65 
 
 		 312 aa  214  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0335702  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0445  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  50.57 
 
 		 268 aa  189  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0961015  normal  0.0287558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2892  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  50.91 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0329  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  47.85 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014302 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4909  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  49.11 
 
 		 313 aa  178  9e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.296324  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4515  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  48.24 
 
 		 314 aa  175  6e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal  0.254845 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4403  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  49.11 
 
 		 315 aa  175  8e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271262  normal  0.226597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4033  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  49.11 
 
 		 315 aa  175  9e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0396564 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3748  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  47.93 
 
 		 302 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0297901  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1926  hypothetical protein  46.15 
 
 		 258 aa  149  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2003  hypothetical protein  45.56 
 
 		 230 aa  148  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0961  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  45.34 
 
 		 230 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3053  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  44.31 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4235  possible lolA type protein  43.4 
 
 		 220 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3234  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  42.68 
 
 		 216 aa  142  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  39.43 
 
 		 222 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3767  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  39.43 
 
 		 222 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.796035 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0094  LolA family protein  37.71 
 
 		 210 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1299  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.5 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2946  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.37 
 
 		 221 aa  117  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.879784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5008  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.1 
 
 		 212 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0146  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.05 
 
 		 212 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.193487 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1497  putative outer membrane lipoprotein carrier protein  36.05 
 
 		 212 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2901  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.47 
 
 		 212 aa  92  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3116  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.69 
 
 		 223 aa  91.7  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0417  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.13 
 
 		 206 aa  90.5  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656484  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.27 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560514  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0429  twin-arginine translocation pathway signal  33.13 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0061  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.33 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0207527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0058  outer membrane lipoprotein carrier protein  28.05 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000236321 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3698  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.4 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2541  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.94 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423269  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2670  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.77 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3189  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.82 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0348  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.82 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0765  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30 
 
 		 217 aa  53.9  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0575497  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1711  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.77 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113541  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0710  hypothetical protein  31.76 
 
 		 171 aa  48.1  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.744618  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0119  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.85 
 
 		 202 aa  47.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256615  normal  0.030366 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1125  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.32 
 
 		 205 aa  45.8  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1053  hypothetical protein  26.53 
 
 		 193 aa  45.4  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0568151  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0846  hypothetical protein  24.79 
 
 		 193 aa  44.3  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3585  outer-membrane lipoprotein carrier protein  31.18 
 
 		 206 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2594  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.52 
 
 		 208 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30310  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.52 
 
 		 208 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1342  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.59 
 
 		 211 aa  43.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1281  outer-membrane lipoproteins carrier protein  31.65 
 
 		 211 aa  43.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.866532  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2658  hypothetical protein  27.47 
 
 		 206 aa  42.7  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>