More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2363 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2363  cysteine desulfurase  100 
 
 		 348 aa  687    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0442  putative aminotransferase  88.43 
 
 		 348 aa  541  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0429876  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2095  cysteine desulfurase  88.43 
 
 		 348 aa  541  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00656129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2365  aminotransferase, class V  70.81 
 
 		 350 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.494188 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3963  cysteine desulfurase  66.86 
 
 		 355 aa  445  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0421265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1632  cysteine desulfurase  68.39 
 
 		 348 aa  434  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.422734  hitchhiker  0.00000261738 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1241  aminotransferase, class V  67.05 
 
 		 347 aa  431  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3263  aminotransferase class V  44.2 
 
 		 400 aa  258  9e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.867544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2995  aminotransferase, class V  49.05 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0581835 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2842  aminotransferase, class V  47.01 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2741  aminotransferase class V  50.27 
 
 		 390 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2434  cysteine desulfurase  42.71 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2108  aminotransferase class V  41.78 
 
 		 405 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44473  normal  0.0661399 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2587  aminotransferase class V  46.67 
 
 		 377 aa  226  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.577396  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  40.27 
 
 		 383 aa  225  9e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5849  aminotransferase class V  43.58 
 
 		 391 aa  223  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402198  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0930  cysteine desulfurase, putative  41.99 
 
 		 392 aa  222  7e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0484195  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0924  putative cysteine desulfurase  41.99 
 
 		 392 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1901  aminotransferase class V  40.1 
 
 		 388 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  42.37 
 
 		 385 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1312  aminotransferase, class V  42.66 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.085766  normal  0.715303 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4456  aminotransferase class V  42.25 
 
 		 390 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259181  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2455  aminotransferase, class V  47.85 
 
 		 390 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1469  aminotransferase class V  43.62 
 
 		 402 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.747649  normal  0.0112306 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4344  aminotransferase class V  41.71 
 
 		 390 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3965  cysteine desulfurase  45.82 
 
 		 387 aa  210  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.707417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2027  aminotransferase, class V  43.66 
 
 		 368 aa  210  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159236  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1665  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  44.59 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.502772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2329  aminotransferase, class V  47.58 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1782  aminotransferase, class V  42.67 
 
 		 388 aa  206  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0705  aminotransferase, class V  34.43 
 
 		 378 aa  206  7e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2257  aminotransferase class V  39.06 
 
 		 386 aa  205  9e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  36.1 
 
 		 401 aa  205  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5110  aminotransferase class V  44.12 
 
 		 391 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3976  aminotransferase class V  41.71 
 
 		 390 aa  203  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  36.68 
 
 		 400 aa  203  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  36.24 
 
 		 401 aa  202  8e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4470  aminotransferase class V  44.5 
 
 		 424 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.425504 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  34.3 
 
 		 384 aa  200  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  40 
 
 		 1143 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  35.25 
 
 		 388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  38.86 
 
 		 1135 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2884  cysteine desulfurase  39.62 
 
 		 373 aa  197  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  33.68 
 
 		 392 aa  197  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  39.12 
 
 		 1139 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  39.62 
 
 		 394 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  36.66 
 
 		 398 aa  195  8.000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0097  aminotransferase class V  39.32 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.765035 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  32.37 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0693  aminotransferase class V  41.49 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456582  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  35.6 
 
 		 397 aa  194  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  36.81 
 
 		 386 aa  192  6e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  34.83 
 
 		 382 aa  192  6e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0809  aminotransferase, class V  36.48 
 
 		 382 aa  192  7e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0512399  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  34.13 
 
 		 414 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  33.24 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  36.29 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  33.51 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  35.65 
 
 		 401 aa  189  4e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  34.99 
 
 		 398 aa  189  5e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  36.39 
 
 		 400 aa  188  9e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  42.33 
 
 		 381 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1949  aminotransferase, class V  37.8 
 
 		 385 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000781244  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  39.89 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  34.29 
 
 		 394 aa  186  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0628  rrf2/aminotransferase, class V family protein  31.08 
 
 		 492 aa  186  4e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54422  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  36.24 
 
 		 400 aa  186  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  34.1 
 
 		 394 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  33.88 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  35.22 
 
 		 400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  34.74 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  34.74 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  39.05 
 
 		 393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  32.98 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0411  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 533 aa  182  7e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.206912  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2206  Cysteine desulfurase  39.36 
 
 		 387 aa  182  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0240111  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  38.38 
 
 		 388 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  36.57 
 
 		 402 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  37.89 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0304  rrf2/aminotransferase, class V family protein  34.17 
 
 		 530 aa  181  2e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  34.91 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  34.89 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  34.15 
 
 		 392 aa  180  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5030  aminotransferase class V  36.07 
 
 		 388 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  30.4 
 
 		 388 aa  180  4e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  35.99 
 
 		 382 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  35.26 
 
 		 399 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0593  aminotransferase class V  38.65 
 
 		 389 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2295  aminotransferase class V  34.95 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0121543 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  37.87 
 
 		 396 aa  177  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1048  aminotransferase, class V  41.76 
 
 		 381 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  34.13 
 
 		 398 aa  177  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1175  aminotransferase class V  41.39 
 
 		 381 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  32.33 
 
 		 394 aa  176  5e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1098  aminotransferase class V  43.92 
 
 		 379 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  37.53 
 
 		 397 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  32.72 
 
 		 381 aa  176  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1609  aminotransferase class V  38.17 
 
 		 392 aa  176  7e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4051  Cysteine desulfurase  36.66 
 
 		 380 aa  176  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0863916  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06940  cysteine desulfurase family protein  36.15 
 
 		 395 aa  175  8e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.417246  normal  0.55711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>