More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3169 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  63.69 
 
 		 533 aa  667    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4150  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  62.86 
 
 		 534 aa  655    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1715  ABC transporter related  62.78 
 
 		 535 aa  660    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  62.8 
 
 		 541 aa  667    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  64 
 
 		 536 aa  685    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  63.43 
 
 		 536 aa  678    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  62.5 
 
 		 553 aa  673    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  64.19 
 
 		 537 aa  679    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0292  ABC transporter, ATPase subunit  62.08 
 
 		 545 aa  652    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2178  ABC transporter-like  62.1 
 
 		 536 aa  658    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  64.14 
 
 		 543 aa  675    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3361  ABC transporter related  62.29 
 
 		 550 aa  643    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.397875 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3475  ABC transporter related  62.67 
 
 		 536 aa  650    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4210  ABC transporter related  62.8 
 
 		 545 aa  659    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355372  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  63.95 
 
 		 543 aa  672    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3169  ABC transporter component  100 
 
 		 553 aa  1091    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  65.74 
 
 		 542 aa  687    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  62.97 
 
 		 535 aa  676    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1774  ABC transporter related  61.68 
 
 		 545 aa  653    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.846994  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  62 
 
 		 531 aa  644    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  64.74 
 
 		 571 aa  640    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7051  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  63.27 
 
 		 545 aa  671    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3723  ABC transporter related  62.99 
 
 		 545 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  63.64 
 
 		 542 aa  685    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  64 
 
 		 537 aa  672    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  64.99 
 
 		 545 aa  691    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  65.1 
 
 		 542 aa  687    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  63.02 
 
 		 530 aa  639    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3530  ABC transporter related  62.62 
 
 		 545 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.463612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0382  ABC transporter related  62.78 
 
 		 543 aa  659    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  62.62 
 
 		 550 aa  664    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  63.5 
 
 		 533 aa  661    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  61.71 
 
 		 530 aa  650    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  65.92 
 
 		 545 aa  672    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  65.74 
 
 		 542 aa  686    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  64.57 
 
 		 537 aa  682    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  62.66 
 
 		 543 aa  672    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  64.19 
 
 		 542 aa  686    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  63.67 
 
 		 545 aa  686    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41160  putative ATP-binding component of ABC transporter  64.38 
 
 		 536 aa  666    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  64.33 
 
 		 542 aa  672    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4520  ABC transporter related  65.19 
 
 		 539 aa  642    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  65.18 
 
 		 542 aa  682    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  63.79 
 
 		 547 aa  684    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  60.11 
 
 		 537 aa  631  1e-179  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  61.07 
 
 		 537 aa  622  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2269  ABC transporter related  59.77 
 
 		 532 aa  624  1e-177  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  59.1 
 
 		 541 aa  621  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  59.96 
 
 		 531 aa  607  9.999999999999999e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  58.78 
 
 		 527 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2329  ABC transporter, ATP-binding protein  58.89 
 
 		 529 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.787685  normal  0.0242694 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2478  ABC transporter, ATP-binding protein  58.7 
 
 		 529 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.17279  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02110  fused predicted oligopeptide transporter subunits of ABC superfamilly: ATP-binding components  58.51 
 
 		 529 aa  601  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.207066  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1477  ABC transporter related protein  58.51 
 
 		 529 aa  601  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.086834  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1913  ABC transporter related protein  57.36 
 
 		 530 aa  598  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  58.21 
 
 		 527 aa  599  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2318  ABC transporter, ATP-binding protein  58.32 
 
 		 529 aa  598  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2776  ABC transporter related  57.25 
 
 		 539 aa  598  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3318  ABC transporter, ATP-binding protein  58.51 
 
 		 529 aa  599  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.561111  normal  0.65051 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1467  ABC transporter related  58.51 
 
 		 529 aa  601  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000937636  normal  0.218677 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02069  hypothetical protein  58.51 
 
 		 529 aa  601  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24532  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  58.4 
 
 		 525 aa  596  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2459  glutathione import ATP-binding protein GsiA  58.59 
 
 		 529 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.798953 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2339  ABC transporter related  57.82 
 
 		 530 aa  595  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0778  ABC transporter, ATP-binding protein  58.51 
 
 		 529 aa  597  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  57.82 
 
 		 525 aa  593  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1642  ABC transporter related  57.36 
 
 		 538 aa  593  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0532  putative peptide ABC transporter, ATP-binding protein  57.01 
 
 		 530 aa  593  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  56.93 
 
 		 534 aa  589  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2456  glutathione import ATP-binding protein GsiA  58.59 
 
 		 529 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000644784 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2570  glutathione import ATP-binding protein GsiA  58.4 
 
 		 529 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182676 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2413  glutathione import ATP-binding protein GsiA  58.59 
 
 		 529 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.137702 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  57.41 
 
 		 534 aa  585  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2368  glutathione import ATP-binding protein GsiA  58.59 
 
 		 529 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0121237  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2789  ABC transporter related  57.22 
 
 		 530 aa  579  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  57.44 
 
 		 524 aa  578  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2714  ABC transporter, ATP-binding protein  57.22 
 
 		 530 aa  580  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451292  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  57.89 
 
 		 539 aa  581  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1494  ABC transporter ATP-binding protein  57.03 
 
 		 530 aa  577  1.0000000000000001e-163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.475677  normal  0.971253 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  56.87 
 
 		 536 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  58.56 
 
 		 527 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  57.89 
 
 		 539 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  57.06 
 
 		 539 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1351  ABC transporter related  57.69 
 
 		 544 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2435  ABC transporter related  57.63 
 
 		 530 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  56.87 
 
 		 536 aa  574  1.0000000000000001e-162  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  53.89 
 
 		 530 aa  568  1e-161  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  56.06 
 
 		 533 aa  565  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0035  ABC transporter related  54.63 
 
 		 543 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806878  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  52.36 
 
 		 543 aa  557  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  53.77 
 
 		 539 aa  556  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  58.68 
 
 		 536 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3249  ABC transporter-related protein  57.69 
 
 		 530 aa  554  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0370695 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  52.53 
 
 		 543 aa  552  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2225  ABC transporter related  53.22 
 
 		 532 aa  542  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.691472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  51.02 
 
 		 547 aa  540  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  51.98 
 
 		 555 aa  535  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  55.19 
 
 		 548 aa  534  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6090  ABC transporter related  55.95 
 
 		 532 aa  529  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  54.15 
 
 		 540 aa  527  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>