More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0940 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0940  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 577 aa  1105    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.693692  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2431  DNA repair protein RecN  54.53 
 
 		 557 aa  484  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  50.18 
 
 		 553 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  50.82 
 
 		 557 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  49.83 
 
 		 565 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  50.26 
 
 		 554 aa  442  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  49.38 
 
 		 558 aa  444  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6694  DNA repair protein RecN  50.54 
 
 		 557 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3161  DNA repair protein RecN  50.35 
 
 		 570 aa  432  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.957491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  47.86 
 
 		 557 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  48.55 
 
 		 559 aa  427  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  48.55 
 
 		 559 aa  426  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2007  DNA repair protein RecN  48.68 
 
 		 561 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.518502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3295  DNA repair protein RecN  47.72 
 
 		 561 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  47.48 
 
 		 561 aa  425  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  47.71 
 
 		 561 aa  425  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4037  DNA repair protein RecN  49.04 
 
 		 562 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6163  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  48.66 
 
 		 557 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430688 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4729  DNA repair protein RecN  51.59 
 
 		 553 aa  421  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.574204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  48.91 
 
 		 554 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0756  DNA repair protein RecN  53.18 
 
 		 559 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2747  DNA repair protein RecN  49.65 
 
 		 549 aa  418  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3383  DNA repair protein RecN  48.5 
 
 		 561 aa  415  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342411  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  46.84 
 
 		 557 aa  415  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  47.03 
 
 		 557 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7433  DNA repair protein RecN  49.73 
 
 		 557 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146948  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2583  DNA repair protein RecN  46.33 
 
 		 557 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0083659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2954  DNA repair protein RecN  48.21 
 
 		 566 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217727 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0700  DNA repair protein RecN  47.26 
 
 		 554 aa  405  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.415077 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0793  DNA repair protein RecN  49.64 
 
 		 546 aa  405  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.628008 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2067  DNA repair protein RecN  49.21 
 
 		 565 aa  401  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.614381 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2118  DNA repair protein RecN  49.64 
 
 		 546 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513575  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  42.73 
 
 		 555 aa  398  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3137  DNA repair protein RecN  48.3 
 
 		 565 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3180  DNA repair protein RecN  48.21 
 
 		 566 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4484  DNA repair protein RecN  50.36 
 
 		 547 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0692  DNA repair protein RecN  47.26 
 
 		 549 aa  388  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0261152  decreased coverage  0.000301908 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0703  DNA repair protein RecN  48.92 
 
 		 546 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3099  DNA repair protein RecN  48.85 
 
 		 564 aa  371  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.545519  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0546  DNA repair protein RecN  50 
 
 		 556 aa  365  1e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.419857 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  36.94 
 
 		 608 aa  350  6e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  36.94 
 
 		 556 aa  349  7e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2413  DNA repair protein  48.27 
 
 		 553 aa  348  2e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00688711  normal  0.675409 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  40.38 
 
 		 560 aa  334  3e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  39.4 
 
 		 556 aa  331  3e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  37.88 
 
 		 559 aa  331  3e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  39.93 
 
 		 558 aa  327  5e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  38.34 
 
 		 554 aa  326  6e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  39.15 
 
 		 558 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  41.38 
 
 		 556 aa  324  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  41.49 
 
 		 549 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  41.49 
 
 		 549 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  41.49 
 
 		 549 aa  324  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  41.49 
 
 		 549 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  40.82 
 
 		 568 aa  324  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  41.49 
 
 		 549 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  41.49 
 
 		 549 aa  324  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  41.49 
 
 		 549 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  39.75 
 
 		 552 aa  323  8e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  39.36 
 
 		 558 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  33.39 
 
 		 555 aa  319  1e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  40.65 
 
 		 568 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  38.15 
 
 		 559 aa  317  5e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  41.31 
 
 		 549 aa  316  9e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  33.92 
 
 		 555 aa  315  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  40.13 
 
 		 589 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0456  DNA repair protein RecN  38.54 
 
 		 553 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  36.7 
 
 		 553 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  36.7 
 
 		 553 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  36.7 
 
 		 553 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  36.7 
 
 		 553 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  36.7 
 
 		 553 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  36.7 
 
 		 553 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  36.7 
 
 		 553 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  41.21 
 
 		 549 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  35.29 
 
 		 554 aa  311  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  41.28 
 
 		 549 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  41.3 
 
 		 549 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  41.3 
 
 		 549 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  36.35 
 
 		 553 aa  311  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  39.08 
 
 		 567 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  36.35 
 
 		 553 aa  310  4e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  41.28 
 
 		 549 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  41.28 
 
 		 549 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  36.35 
 
 		 552 aa  310  5e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  36.01 
 
 		 552 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  36.17 
 
 		 552 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  39.4 
 
 		 554 aa  309  9e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  34.94 
 
 		 554 aa  309  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  36.17 
 
 		 552 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  36.01 
 
 		 552 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  35.16 
 
 		 552 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  39.25 
 
 		 557 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  39.23 
 
 		 558 aa  306  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  35.83 
 
 		 552 aa  306  6e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  35.83 
 
 		 552 aa  306  6e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  35.83 
 
 		 552 aa  306  6e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  35.83 
 
 		 552 aa  306  6e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  35.64 
 
 		 553 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  36.64 
 
 		 553 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>